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CNOT6 - CCR4-NOT transcription complex subunit 6 Gene

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中文名称：CCR4-NOT 转录复合物亚基 6

种属: Homo sapiens

同用名: CCR4; Ccr4a

基因 ID: 57472 | 基因类型: protein coding

关于 CNOT6

Cytogenetic location: 5q35.3 Genomic coordinates (GRCh38): 5:180,494,379-180,578,358 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 235 orthologues and 5 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 8.0), urinary bladder (RPKM 6.4) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 CCR4-NOT 核心转录调控复合物的催化成分。编码的蛋白质具有 3'-5' 核糖核酸酶活性，并且更倾向于聚腺苷酸化底物。 CCR4-NOT 复合物在许多细胞过程中发挥作用，包括 miRNA 介导的抑制、mRNA 降解和转录调节。[RefSeq 提供，2014 年 12 月]

This gene encodes the catalytic component of the CCR4-NOT core transcriptional regulation complex. The encoded protein has a 3'-5' RNase activity and prefers polyadenylated substrates. The CCR4-NOT complex plays a role in many cellular processes, including miRNA-mediated repression, mRNA degradation, and transcriptional regulation. [provided by RefSeq, Dec 2014]

CNOT6 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001370472.1 NP_001357401.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 6 isoform 1
NM_001370473.1 NP_001357402.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 6 isoform 2
NM_001370474.1 NP_001357403.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 6 isoform 3
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA exonuclease activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
11889047 GOA
enables nuclear receptor coactivator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
18180299 GOA
enables poly(A)-specific ribonuclease activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
11889047 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11747467 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in miRNA-mediated gene silencing by mRNA destabilization IDA
IDA: 通过直接分析推断
20065043 GOA
involved in nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay IMP
IMP: 通过突变表型推断
15314026 GOA
involved in nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening IMP
IMP: 通过突变表型推断
20595389 GOA
involved in positive regulation of cell population proliferation IMP
IMP: 通过突变表型推断
21233283 GOA
involved in positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly IMP
IMP: 通过突变表型推断
21233283 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of CCR4-NOT complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
19558367 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

CNOT6 蛋白结构

LRR_8

LRR_8: Leucine rich repeat (51 - 109)

Exo_endo_phos

Exo_endo_phos: Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family (192 - 531)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 557 a.a.
蛋白主名 其他名称

CCR4-NOT transcription complex subunit 6

carbon catabolite repression 4 protein

CNOT6 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CNOT6 Q9ULM6 CNOT10 Homo sapiens Q9H9A5
Anti Tag CoIP
17452450
种属内
CNOT6 Q9ULM6 CNOT1 Homo sapiens A5YKK6
Anti Tag CoIP
22977175
种属内
CNOT6 Q9ULM6 CNOT7 Homo sapiens Q9UIV1
Far-WB
11747467
种属内
CNOT6 Q9ULM6 CNOT7 Homo sapiens Q9UIV1
Y2H
11747467
种属内
CNOT6 Q9ULM6 TNRC6C Homo sapiens Q9HCJ0
Anti Tag CoIP
21981923
种属内
CNOT6 Q9ULM6 CNOT3 Homo sapiens O75175
Anti Tag CoIP
17452450
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (2)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS02905 CNOT6 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-RS02906 CNOT6L Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus CNOT6 VGNC VGNC:61028
Bos taurus CNOT6 VGNC VGNC:27520
Macaca mulatta CNOT6 VGNC VGNC:71175
Mus musculus CNOT6 MGD MGI:2144529
Rattus norvegicus CNOT6 RGD RGD:1310783
Canis familiaris CNOT6 VGNC VGNC:39416
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