1. Gene
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SUGP1 - SURP and G-patch domain containing 1 Gene

中文名称:含 SURP 和 G 补丁域 1

种属: Homo sapiens

同用名: RBP; SF4; F23858

基因 ID: 57794 | 基因类型: protein coding

关于 SUGP1

Cytogenetic location: 19p13.11 Genomic coordinates (GRCh38): 19:19,276,033-19,320,509 (from NCBI)

This gene has 15 transcripts (splice variants), 91 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in testis (RPKM 17.9), spleen (RPKM 9.9) and 25 other tissues.

功能概要

SF4 是 SURP 剪接因子家族的成员。[OMIM 提供,2003 年 9 月]

SF4 is a member of the SURP family of splicing factors.[supplied by OMIM, Sep 2003]

SUGP1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_172231.4 NP_757386.2 SURP and G-patch domain-containing protein 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21988832 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SUGP1 蛋白结构

Surp

Surp: Surp module (189 - 242)

Surp

Surp: Surp module (264 - 317)

G-patch

G-patch: G-patch domain (563 - 606)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 600
  • 645 a.a.
蛋白主名 其他名称

SURP and G-patch domain-containing protein 1

RNA-binding protein RBP

SUGP1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SUGP1 Q8IWZ8 DHX15 Homo sapiens O43143
Anti Tag CoIP
22365833
Intra SUGP1 Q8IWZ8 RBM10 Homo sapiens P98175
Anti Tag CoIP
22365833
Intra SUGP1 Q8IWZ8 RBM17 Homo sapiens Q96I25
Anti Tag CoIP
22365833
Intra SUGP1 Q8IWZ8 RBM17 Homo sapiens Q96I25
Y2H
22365833
Intra SUGP1 Q8IWZ8 U2AF2 Homo sapiens P26368
Y2H
22365833
Intra SUGP1 Q8IWZ8 U2AF2 Homo sapiens P26368
Y2H
21988832
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus SUGP1 VGNC VGNC:35463
Rattus norvegicus SUGP1 RGD RGD:1310496
Canis familiaris SUGP1 VGNC VGNC:46972
Felis catus SUGP1 VGNC VGNC:65830
Macaca mulatta SUGP1 VGNC VGNC:97833
Mus musculus SUGP1 MGD MGI:1917866
Others SUGP1 NCBI