1. Gene
  2. TSN - translin Gene

TSN - translin Gene

中文名称:转运蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: C3PO; RCHF1; TBRBP; TRSLN; BCLF-1; REHF-1

基因 ID: 7247 | 基因类型: protein coding

关于 TSN

Cytogenetic location: 2q14.3 Genomic coordinates (GRCh38): 2:121,755,651-121,767,853 (from NCBI)

This gene has 12 transcripts (splice variants), 208 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in testis (RPKM 26.5), brain (RPKM 20.8) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码一种 DNA 结合蛋白,可特异性识别染色体易位断点连接处的保守靶序列。易位蛋白多肽形成多聚体结构,负责其 DNA 结合活性。重组相关基序和易位蛋白结合位点存在于重组热点,可作为易位融合基因断点的指标。这些结合活性可能在淋巴肿瘤的染色体易位中起着至关重要的作用。由该基因编码的这种蛋白质,当与转位蛋白相关蛋白 X 复合时,也会形成 Mg 离子依赖性核糖核酸内切酶,促进 RNA 诱导的沉默复合物 (RISC) 激活。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供,2012 年 5 月]

This gene encodes a DNA-binding protein which specifically recognizes conserved target sequences at the breakpoint junction of chromosomal translocations. Translin polypeptides form a multimeric structure that is responsible for its DNA-binding activity. Recombination-associated motifs and translin-binding sites are present at recombination hotspots and may serve as indicators of breakpoints in genes which are fused by translocations. These binding activities may play a crucial role in chromosomal translocation in lymphoid neoplasms. This protein encoded by this gene, when complexed with translin-associated protein X, also forms a Mg ion-dependent endoribonuclease that promotes RNA-induced silencing complex (RISC) activation. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2012]

TSN 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001261401.2 NP_001248330.1 translin isoform 2
NM_004622.3 NP_004613.1 translin isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21988832 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21552258 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in siRNA processing IDA
IDA: 通过直接分析推断
21552258 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of endoribonuclease complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21552258 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TSN 蛋白结构

Translin

Translin: Translin family (18 - 216)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 228 a.a.
蛋白主名 其他名称

translin

component 3 of promoter of RISC

TSN 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
TSN Q15631 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 32296183
种属内
TSN Q15631 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 32296183
种属内
TSN Q15631 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 32296183
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598 21552258
种属内
TSN Q15631 TSN Homo sapiens Q15631 21988832
种属内
TSN Q15631 TSN Homo sapiens Q15631 32296183
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598 32296183
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598 21552258
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598
GMS
21552258
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598 33961781
种属内
TSN Q15631 TSN Homo sapiens Q15631 32296183
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598 32296183
种属内
TSN Q15631 TSN Homo sapiens Q15631 32296183
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598 21552258
种属内
TSN Q15631 TSNAX Homo sapiens Q99598 32296183
种属内
TSN Q15631 GIT2 Homo sapiens Q14161 21988832
种属内
TSN Q15631 GORASP2 Homo sapiens Q9H8Y8 32296183
种属内
TSN Q15631 GORASP2 Homo sapiens Q9H8Y8 32296183
种属内
TSN Q15631 GORASP2 Homo sapiens Q9H8Y8 32296183
种属内
TSN Q15631 DVL3 Homo sapiens Q92997 32296183
种属内
TSN Q15631 LNX1 Homo sapiens Q8TBB1 32296183
种属内
TSN Q15631 NTAQ1 Homo sapiens Q96HA8 32296183
种属内
TSN Q15631 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Liposarcoma

Lipomatous Cancer

Dysgerminoma
Sotos Syndrome

Cerebral Gigantism

SOTOS

Chromosome 5q35 Deletion Syndrome

Sotos Syndrome 1, Formerly

Sotos1, Formerly

Distinctive Facial Appearance, Overgrowth In Childhood, And Learning Disabilities Or Delayed Development

Sotos Sequence

Sotos' Syndrome

Sotos1

Sotos Syndrome 1

Chromosome 1p36 Deletion Syndrome

1p36 Deletion Syndrome

Deletion 1p36

Monosomy 1p36

Subtelomeric 1p36 Deletion

Monosomy 1p36 Syndrome

Distal Monosomy 1p36

Del(1)(P36)

Deletion 1pter

Monosomy 1pter

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris TSN VGNC VGNC:47907
Bos taurus TSN VGNC VGNC:36422
Macaca mulatta TSN VGNC VGNC:78663
Felis catus TSN VGNC VGNC:82547
Rattus norvegicus TSN RGD RGD:621107
Mus musculus TSN MGD MGI:109263
Others TSN NCBI