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HDGFL2 - HDGF like 2 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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  • 直系同源

中文名称：HDGF 样 2

种属: Homo sapiens

同用名: HRP2; HDGF2; HRP-2; HDGF-2; HDGFRP2

基因 ID: 84717 | 基因类型: protein coding

关于 HDGFL2

Cytogenetic location: 19p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 19:4,472,297-4,502,207 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants), 220 orthologues and 4 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 20.4), brain (RPKM 10.1) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码肝细胞瘤衍生生长因子 (HDGF) 家族的一个成员。该蛋白包括一个 N 端 PWWP 结构域，该结构域与含甲基赖氨酸的组蛋白结合，该蛋白与组蛋白 H3 的三甲基化赖氨酸 36 和 79 以及组蛋白 H4 的二甲基化和三甲基化赖氨酸 20 特异性结合。该蛋白质通过确定 HIV-1 整合位点选择在 LEDGF/p75 独立的 HIV-1 复制中发挥作用。该基因的可变剪接导致多个转录变体。[RefSeq 提供，2014 年 4 月]

This gene encodes a member of the hepatoma-derived growth factor (HDGF) family. The protein includes an N-terminal PWWP domain that binds to methyl-lysine-containing histones, with specific binding of this protein to tri-methylated lysines 36 and 79 of histone H3, and di- and tri-methylated lysine 20 of histone H4. The protein functions in LEDGF/p75-independent HIV-1 replication by determining HIV-1 integration site selection. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2014]

HDGFL2 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001001520.3 NP_001001520.1 hepatoma-derived growth factor-related protein 2 isoform 1
NM_001348169.2 NP_001335098.1 hepatoma-derived growth factor-related protein 2 isoform 3
NM_032631.4 NP_116020.1 hepatoma-derived growth factor-related protein 2 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables H3K27me3 modified histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
26721387 GOA
enables H3K9me3 modified histone binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
26721387 GOA
enables histone reader activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
26721387 GOA
enables methylated histone binding IMP
IMP: 通过突变表型推断
32459350 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21044950 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in DNA repair-dependent chromatin remodeling IMP
IMP: 通过突变表型推断
26721387 GOA
involved in muscle cell differentiation IMP
IMP: 通过突变表型推断
32459350 GOA
involved in positive regulation of cell growth IMP
IMP: 通过突变表型推断
25689719 GOA
involved in positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination IMP
IMP: 通过突变表型推断
26721387 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
26721387 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断
蛋白主名 其他名称

hepatoma-derived growth factor-related protein 2

HDGF-related protein 2

HDGFL2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra HDGFL2 Q7Z4V5 TERF2 Homo sapiens Q15554
Pull Down
21044950
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS06095 HDGFL2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta HDGFL2 VGNC VGNC:109500
Felis catus HDGFL2 VGNC VGNC:102608
Canis familiaris HDGFL2 VGNC VGNC:81269
Rattus norvegicus HDGFL2 RGD RGD:621013
Bos taurus HDGFL2 VGNC VGNC:109383
Mus musculus HDGFL2 MGD MGI:1194492
Others HDGFL2 NCBI
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