2. Gene
  3. SPSB2 - splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 2 Gene

SPSB2 - splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 2 Gene

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中文名称：含 splA/ryanodine 受体结构域和 SOCS 盒 2

种属: Homo sapiens

同用名: SSB2; GRCC9

基因 ID: 84727 | 基因类型: protein coding

关于 SPSB2

Cytogenetic location: 12p13.31 Genomic coordinates (GRCh38): 12:6,870,935-6,873,303 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 148 orthologues and 4 paralogues. Broad expression in brain (RPKM 50.3), appendix (RPKM 44.2) and 19 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质亚家族成员包含中央 SPRY (在 splA 和 RyR 中重复) 结构域和细胞因子信号转导 (SOCS) 盒的 C 端抑制因子。这种蛋白质在细胞信号传导中起作用。该基因存在于 CD4 抗原和丙糖磷酸异构酶基因附近的染色体 12p13 上的基因丰富簇中。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供，2016 年 2 月]

This gene encodes a member of a subfamily of proteins containing a central SPRY (repeats in splA and RyR) domain and a C-terminal suppressor of cytokine signaling (SOCS) box. This protein plays a role in cell signaling. This gene is present in a gene-rich cluster on chromosome 12p13 in the vicinity of the CD4 antigen and triosephosphate isomerase genes. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

SPSB2 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001146316.2 NP_001139788.1 SPRY domain-containing SOCS box protein 2
NM_001319670.2 NP_001306599.1 SPRY domain-containing SOCS box protein 2
NM_032641.4 NP_116030.1 SPRY domain-containing SOCS box protein 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15601820 GOA
enables ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21199876 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in protein ubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
21199876 GOA
involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
21199876 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytosol IDA
IDA: 通过直接分析推断
21199876 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SPSB2 蛋白结构

SPRY

SPRY: SPRY domain (87 - 218)

SOCS_box

SOCS_box: SOCS box (224 - 263)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 263 a.a.
蛋白主名 其他名称

SPRY domain-containing SOCS box protein 2

SPRY domain-containing SOCS box protein SSB-2

SPSB2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SPSB2 Q99619 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Validated Y2H
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Y2H Array
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 DMWD Homo sapiens G5E9A7
Y2H Array
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 DMWD Homo sapiens G5E9A7
Y2H Pooling
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 DMWD Homo sapiens G5E9A7
Validated Y2H
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 ELOC Homo sapiens Q15369
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SPSB2 Q99619 ELOC Homo sapiens Q15369
Anti Tag CoIP
15601820
种属内
SPSB2 Q99619 ELOC Homo sapiens Q15369
Anti Tag CoIP
19159283
种属内
SPSB2 Q99619 VIM Homo sapiens P08670
Validated Y2H
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 VIM Homo sapiens P08670
Y2H Array
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 VIM Homo sapiens P08670
Y2H Pooling
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Y2H Array
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Y2H Pooling
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Validated Y2H
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 PAWR Homo sapiens Q96IZ0
ITC
20561531
种属内
SPSB2 Q99619 PAWR Homo sapiens Q96IZ0
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SPSB2 Q99619 PECAM1 Homo sapiens P16284
Validated Y2H
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 PECAM1 Homo sapiens P16284
Y2H Pooling
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 PECAM1 Homo sapiens P16284
Y2H Array
32814053
种属内
SPSB2 Q99619 PRMT1 Homo sapiens Q99873
Y2H
23455924
种属内
SPSB2 Q99619 PIK3R3 Homo sapiens Q92569
Y2H Array
25814554
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
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HY-P10383 SPSB2-iNOS inhibitory cyclic peptide-1 / 否
HY-P10384 SPSB2-iNOS inhibitory cyclic peptide-2 Inhibitor / 否
HY-RS13727 SPSB2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus SPSB2 VGNC VGNC:50141
Rattus norvegicus SPSB2 RGD RGD:1310854
Macaca mulatta SPSB2 VGNC VGNC:100107
Felis catus SPSB2 VGNC VGNC:65655
Mus musculus SPSB2 MGD MGI:1315199
Canis familiaris SPSB2 VGNC VGNC:49871
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