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THOC5 - THO complex subunit 5 Gene

中文名称:THO 复合亚基 5

种属: Homo sapiens

同用名: Fmip; PK1.3; fSAP79; C22orf19

基因 ID: 8563 | 基因类型: protein coding

关于 THOC5

Cytogenetic location: 22q12.2 Genomic coordinates (GRCh38): 22:29,505,879-29,553,757 (from NCBI)

This gene has 17 transcripts (splice variants) and 223 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 10.3), endometrium (RPKM 6.9) and 25 other tissues.

功能概要

预测启用 mRNA 结合活性。参与多个过程,包括单核细胞分化; DNA 损伤检查点的负调控;和病毒 mRNA 从宿主细胞核输出。位于核质中。转录输出复合体的 THO 复合体的一部分。与染色体、端粒区域共定位。与乳腺癌有关。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Predicted to enable mRNA binding activity. Involved in several processes, including monocyte differentiation; negative regulation of DNA damage checkpoint; and viral mRNA export from host cell nucleus. Located in nucleoplasm. Part of THO complex part of transcription export complex. Colocalizes with chromosome, telomeric region. Implicated in breast carcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

THOC5 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001002877.2 NP_001002877.1 THO complex subunit 5 homolog
NM_001002878.1 NP_001002878.1 THO complex subunit 5 homolog
NM_001002879.1 NP_001002879.1 THO complex subunit 5 homolog
NM_003678.5 NP_003669.4 THO complex subunit 5 homolog
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19059247 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA export from nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
17190602 GOA
involved in mRNA export from nucleus IMP
IMP: 通过突变表型推断
22144908 GOA
involved in monocyte differentiation IDA
IDA: 通过直接分析推断
19015024 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of THO complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15998806 GOA
part of THO complex part of transcription export complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15998806 GOA
colocalizes with chromosome, telomeric region IDA
IDA: 通过直接分析推断
24270157 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
19059247 GOA
part of transcription export complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
15833825 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

THOC5 蛋白结构

FimP

FimP: Fms-interacting protein (96 - 452)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 683 a.a.
蛋白主名 其他名称

THO complex subunit 5 homolog

Fms-interacting protein

THOC5 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra THOC5 Q13769 THOC1 Homo sapiens Q96FV9
Anti Tag CoIP
23299939
Intra THOC5 Q13769 THOC1 Homo sapiens Q96FV9
Anti Tag CoIP
19059247
Intra THOC5 Q13769 THOC1 Homo sapiens Q96FV9
Anti Tag CoIP
26496610
Intra THOC5 Q13769 THOC7 Homo sapiens Q6I9Y2
Anti Tag CoIP
19059247
Intra THOC5 Q13769 THOC7 Homo sapiens Q6I9Y2
IF
19059247
Intra THOC5 Q13769 THOC7 Homo sapiens Q6I9Y2
Pull Down
19059247
Intra THOC5 Q13769 THOC7 Homo sapiens Q6I9Y2
Anti Tag CoIP
26496610
Intra THOC5 Q13769 TAP1 Homo sapiens Q03518
Pull Down
19165146
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta THOC5 VGNC VGNC:79178
Felis catus THOC5 VGNC VGNC:80500
Bos taurus THOC5 VGNC VGNC:35841
Mus musculus THOC5 MGD MGI:1351333
Canis familiaris THOC5 VGNC VGNC:47351
Rattus norvegicus THOC5 RGD RGD:1304991