1. Gene
  2. CHAF1A - chromatin assembly factor 1 subunit A Gene

CHAF1A - chromatin assembly factor 1 subunit A Gene

中文名称:染色质装配因子 1 亚基 A

种属: Homo sapiens

同用名: CAF1; P150; CAF-1; CAF1B; CAF1P150

基因 ID: 10036 | 基因类型: protein coding

关于 CHAF1A

Cytogenetic location: 19p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 19:4,402,640-4,450,830 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants) and 200 orthologues. Broad expression in bone marrow (RPKM 7.4), testis (RPKM 6.1) and 24 other tissues.

功能概要

染色质组装因子 I (CAF1) 是一种核复合物,由 p50、p60 (CHAF1B;MIM 601245) 和 p150 (CHAF1A) 亚基组成,可在体外将组蛋白八聚体组装到复制 DNA 上 (Kaufman 等人,1995 [PubMed 7600578]) .[OMIM 提供,2008 年 3 月]

Chromatin assembly factor I (CAF1) is a nuclear complex consisting of p50, p60 (CHAF1B; MIM 601245), and p150 (CHAF1A) subunits that assembles histone octamers onto replicating DNA in vitro (Kaufman et al., 1995 [PubMed 7600578]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

CHAF1A 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_005483.3 NP_005474.2 chromatin assembly factor 1 subunit A
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables chromo shadow domain binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15882967 GOA
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16826239 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15805117 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in DNA replication-dependent chromatin assembly IDA
IDA: 通过直接分析推断
8858152 GOA
involved in nucleosome assembly IDA
IDA: 通过直接分析推断
14718166 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of CAF-1 complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
8858152 GOA
part of CAF-1 complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
9614144 GOA
located in chromatin IDA
IDA: 通过直接分析推断
9614144 GOA
part of protein-containing complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
14718166 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

CHAF1A 蛋白结构

CAF1-p150_N

CAF1-p150_N: CAF1 complex subunit p150, region binding to PCNA (1 - 229)

CAF-1_p150

CAF-1_p150: Chromatin assembly factor 1 complex p150 subunit, N-terminal (267 - 479)

CAF1A

CAF1A: Chromatin assembly factor 1 subunit A (557 - 634)

CAF1-p150_C2

CAF1-p150_C2: CAF1 complex subunit p150, region binding to CAF1-p60 at C-term (665 - 956)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 956 a.a.
蛋白主名 其他名称

chromatin assembly factor 1 subunit A

CAF-1 subunit A

CHAF1A 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CHAF1A Q13111 CHAF1B Homo sapiens Q13112
Anti Tag CoIP
19498464
种属内
CHAF1A Q13111 H3C1 Homo sapiens P68431
Anti Tag CoIP
19498464
种属内
CHAF1A Q13111 CHAF1B Homo sapiens Q13112
Density Sedimentation
19498464
种属内
CHAF1A Q13111 REL Homo sapiens Q04864-2
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 REL Homo sapiens Q04864-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 STAT5B Homo sapiens P51692
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 STAT5B Homo sapiens P51692
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 POU6F2 Homo sapiens P78424
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 POU6F2 Homo sapiens P78424
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 TCF4 Homo sapiens P15884-3
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 TCF4 Homo sapiens P15884-3
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 NOTO Homo sapiens A8MTQ0
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 NOTO Homo sapiens A8MTQ0
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 MEI4 Homo sapiens A8MW99
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 MEI4 Homo sapiens A8MW99
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 REL Homo sapiens Q04864
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
CHAF1A Q13111 PCNA Homo sapiens P12004
Pull Down
16826239
种属内
CHAF1A Q13111 ZNF620 Homo sapiens Q6ZNG0
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 ZNF620 Homo sapiens Q6ZNG0
Validated Y2H
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 ZNF620 Homo sapiens Q6ZNG0
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7
Validated Y2H
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 TCF4 Homo sapiens P15884
Y2H Array
25416956
种属内
CHAF1A Q13111 PAX6 Homo sapiens P26367
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 PAX6 Homo sapiens P26367
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 SERTAD1 Homo sapiens Q9UHV2
Validated Y2H
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 SERTAD1 Homo sapiens Q9UHV2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 SERTAD1 Homo sapiens Q9UHV2
Y2H Array
32296183
种属内
CHAF1A Q13111 H3C13 Homo sapiens Q71DI3
Anti Tag CoIP
23075851
种属内
CHAF1A Q13111 CBX5 Homo sapiens P45973
Anti Tag CoIP
19498464
种属内
CHAF1A Q13111 CBX5 Homo sapiens P45973
Density Sedimentation
19498464
种属内
CHAF1A Q13111 MBD1 Homo sapiens Q9UIS9
Pull Down
17066076
种属内
CHAF1A Q13111 GFI1 Homo sapiens Q99684
Anti Bait CoIP
21570500
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

CHAF1A 抗体

目录号 产品名 应用 反应物种
HY-P81743 p150 CAF1 Antibody (YA1488) WB, IHC-F, IHC-P, ICC/IF, IP Human

关联疾病

疾病名称 别名
Prostate Squamous Cell Carcinoma

Squamous Cell Carcinoma Of Prostate

Digeorge Syndrome

Chromosome 22q11.2 Deletion Syndrome

DGS

Hypoplasia Of Thymus And Parathyroids

Third And Fourth Pharyngeal Pouch Syndrome

22q11.2 Deletion Syndrome

Digeorge Sequence

Digeorge'S Syndrome

Pharyngeal Pouch Syndrome

Di-George Syndrome

Shprintzen Syndrome

Alpha Thalassemia-Intellectual Disability Syndrome Type 1

Alpha Thalassemia-Intellectual Disability Syndrome, Deletion Type

Alpha-Thalassemia-Intellectual Disability Syndrome Linked To Chromosome 16

Atr Syndrome Linked To Chromosome 16

Atr Syndrome, Deletion Type

Atr-16 Syndrome

Alpha Thalassemia-Retardation Syndrome

Alpha-Thalassemia/Mental Retardation Syndrome, Deletion-Type

Alpha-Thalassemia/Mental Retardation Syndrome, Type 1

Alpha-Thalassemia Mental Retardation Syndrome, Deletion-Type

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus CHAF1A RGD RGD:1590865
Canis familiaris CHAF1A VGNC VGNC:39189
Bos taurus CHAF1A VGNC VGNC:27266
Felis catus CHAF1A VGNC VGNC:60835
Macaca mulatta CHAF1A VGNC VGNC:71024
Mus musculus CHAF1A MGD MGI:1351331