1. Gene
  2. DCTN2 - dynactin subunit 2 Gene

DCTN2 - dynactin subunit 2 Gene

中文名称:动力蛋白亚基 2

种属: Homo sapiens

同用名: RBP50; DCTN50; HEL-S-77; DYNAMITIN

基因 ID: 10540 | 基因类型: protein coding

关于 DCTN2

Cytogenetic location: 12q13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 12:57,530,051-57,547,192 (from NCBI)

This gene has 33 transcripts (splice variants) and 214 orthologues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 42.2), esophagus (RPKM 36.9) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 dynactin 的 50-kD 亚基,dynactin 是一种大分子复合物,由 10-11 个亚基组成,大小从 22 到 150 kD 不等。 Dynactin 与微管和细胞质动力蛋白结合。它参与多种细胞功能,包括内质网到高尔基体的转运、溶酶体和核内体的向心运动、纺锤体形成、染色体运动、核定位和轴突发生。该亚基以每个动力蛋白分子 4-5 个拷贝的形式存在。它包含三个短的 alpha 螺旋卷曲螺旋结构域,可以介导与自身或其他 dynactin 亚基的关联。它可能直接与 dynactin 的最大亚基 (p150) 相互作用,并可能将 p150 固定到位。已经为该基因发现了编码不同亚型的多个选择性剪接的转录物变体。[RefSeq 提供,2012 年 5 月]

This gene encodes a 50-kD subunit of dynactin, a macromolecular complex consisting of 10-11 subunits ranging in size from 22 to 150 kD. Dynactin binds to both microtubules and cytoplasmic dynein. It is involved in a diverse array of cellular functions, including ER-to-Golgi transport, the centripetal movement of lysosomes and endosomes, spindle formation, chromosome movement, nuclear positioning, and axonogenesis. This subunit is present in 4-5 copies per dynactin molecule. It contains three short alpha-helical coiled-coil domains that may mediate association with self or other dynactin subunits. It may interact directly with the largest subunit (p150) of dynactin and may affix p150 in place. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2012]

DCTN2 基因产物(7)

mRNA Protein Name
NM_001261412.2 NP_001248341.1 dynactin subunit 2 isoform 2
NM_001261413.2 NP_001248342.1 dynactin subunit 2 isoform 3
NM_001348065.2 NP_001334994.1 dynactin subunit 2 isoform 4
NM_001348066.2 NP_001334995.1 dynactin subunit 2 isoform 5
NM_001348067.2 NP_001334996.1 dynactin subunit 2 isoform 6
NM_001348068.2 NP_001334997.1 dynactin subunit 2 isoform 6
NM_006400.5 NP_006391.1 dynactin subunit 2 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10226031 GOA
enables protein kinase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17139249 GOA
enables spectrin binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
23704327 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mitotic metaphase chromosome alignment IMP
IMP: 通过突变表型推断
8647893 GOA
involved in mitotic spindle organization IMP
IMP: 通过突变表型推断
8647893 GOA
acts upstream of or within protein localization to centrosome IMP
IMP: 通过突变表型推断
24816561 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in centrosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
8647893 GOA
part of dynactin complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
8647893 GOA
located in kinetochore IDA
IDA: 通过直接分析推断
8647893 GOA
located in vesicle IDA
IDA: 通过直接分析推断
20682791 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

DCTN2 蛋白结构

Dynamitin

Dynamitin: Dynamitin (12 - 399)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 401 a.a.
蛋白主名 其他名称

dynactin subunit 2

50 kDa dynein-associated polypeptide

DCTN2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra DCTN2 Q13561 CENPH Homo sapiens Q9H3R5
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 CENPH Homo sapiens Q9H3R5
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 BORCS6 Homo sapiens Q96GS4
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra DCTN2 Q13561 BORCS6 Homo sapiens Q96GS4
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 BORCS6 Homo sapiens Q96GS4
Anti Tag CoIP
33961781
Intra DCTN2 Q13561 BORCS6 Homo sapiens Q96GS4
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 KIFC3 Homo sapiens Q9BVG8-5
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 RABGEF1 Homo sapiens Q9UJ41-4
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 KIFC3 Homo sapiens Q9BVG8
Y2H Array
25416956
Intra DCTN2 Q13561 KIFC3 Homo sapiens Q9BVG8
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra DCTN2 Q13561 VPS33A Homo sapiens Q96AX1
Validated Y2H
32814053
Intra DCTN2 Q13561 VPS33A Homo sapiens Q96AX1
Y2H Array
32814053
Intra DCTN2 Q13561 VPS33A Homo sapiens Q96AX1
Y2H Pooling
32814053
Intra DCTN2 Q13561 CCDC172 Homo sapiens P0C7W6
Y2H Array
31515488
Intra DCTN2 Q13561 CCDC172 Homo sapiens P0C7W6
Y2H Array
25416956
Cross DCTN2 Q13561 y14_sars Human SARS coronavirus Q7TLC7
Y2H Pooling
22046132
Cross DCTN2 Q13561 y14_sars Human SARS coronavirus Q7TLC7
Lumier
22046132
Cross DCTN2 Q13561 ns6_sars Human SARS coronavirus P59634
Lumier
22046132
Cross DCTN2 Q13561 ns6_sars Human SARS coronavirus P59634
Y2H Pooling
22046132
Intra DCTN2 Q13561 BLOC1S1 Homo sapiens P78537
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra DCTN2 Q13561 BLOC1S1 Homo sapiens P78537
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 PDCD6 Homo sapiens O75340
Anti Bait CoIP
26950892
Intra DCTN2 Q13561 PDCD6 Homo sapiens O75340
Anti Tag CoIP
26950892
Intra DCTN2 Q13561 SMARCD1 Homo sapiens Q96GM5
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 GADD45A Homo sapiens P24522
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 GADD45A Homo sapiens P24522
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra DCTN2 Q13561 BLOC1S6 Homo sapiens Q9UL45
Y2H Array
25416956
Intra DCTN2 Q13561 BLOC1S6 Homo sapiens Q9UL45
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra DCTN2 Q13561 BLOC1S2 Homo sapiens Q6QNY1
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 BLOC1S2 Homo sapiens Q6QNY1
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 BLOC1S2 Homo sapiens Q6QNY1
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra DCTN2 Q13561 HTT Homo sapiens P42858
Y2H
17500595
Intra DCTN2 Q13561 TXLNB Homo sapiens Q8N3L3
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 CAPZA2 Homo sapiens P47755
Anti Tag CoIP
35271311
Intra DCTN2 Q13561 DCTN1 Homo sapiens Q14203
TAP
27173435
Intra DCTN2 Q13561 CAPZA2 Homo sapiens P47755
TAP
27173435
Intra DCTN2 Q13561 DCTN1 Homo sapiens Q14203
Anti Tag CoIP
33961781
Intra DCTN2 Q13561 DCTN1 Homo sapiens Q14203
Anti Tag CoIP
35271311
Intra DCTN2 Q13561 MAPRE3 Homo sapiens Q9UPY8
Validated Y2H
27107012
Intra DCTN2 Q13561 MAPRE3 Homo sapiens Q9UPY8
SLC
27107012
Intra DCTN2 Q13561 MAPRE3 Homo sapiens Q9UPY8
BFG-2H
27107012
Intra DCTN2 Q13561 RINT1 Homo sapiens Q6NUQ1
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 RINT1 Homo sapiens Q6NUQ1
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra DCTN2 Q13561 RINT1 Homo sapiens Q6NUQ1
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 USHBP1 Homo sapiens Q8N6Y0
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 CEP44 Homo sapiens Q9C0F1
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 CEP44 Homo sapiens Q9C0F1
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra DCTN2 Q13561 CEP44 Homo sapiens Q9C0F1
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 COG3 Homo sapiens Q96JB2-2
Validated Y2H
32296183
Intra DCTN2 Q13561 COG3 Homo sapiens Q96JB2-2
Y2H Array
32296183
Intra DCTN2 Q13561 COG3 Homo sapiens Q96JB2-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Charcot-Marie-Tooth Disease

Cmt

Hmsn

Hereditary Motor And Sensory Neuropathy

Pma

Cmt - Charcot-Marie-Tooth Disease

Charcot Marie Tooth Disease

Charcot-Marie-Tooth Hereditary Neuropathy

Charcot-Marie-Tooth Syndrome

Peroneal Muscular Atrophy

Hereditary Motor And Sensory Neuropathies

Neuronopathy, Distal Hereditary Motor, Type Viib

HMN7B

Hmn Viib

Dhmn7b

Neuropathy, Distal Hereditary Motor, Type Viib

Distal Hereditary Motor Neuronopathy Type 7b

Distal Hereditary Motor Neuropathy Type Viib

Neuronopathy, Distal Hereditary Motor, Type 7b

Neuropathy, Distal Hereditary Motor, With Vocal Cord Paralysis, Type Viib

Lower Motor Neuron Disease, Dynactin Type

Distal Spinal Muscular Atrophy With Vocal Cord Paralysis Type 7b

Harper-Young Myopathy

Neuronopathy, Distal Hereditary Motor, 7b

Distal Hereditary Motor Neuropathy With Vocal Cord Paralysis Type Viib

Lower Motor Neuron Disease Dynactin Type

Plmnd

Progressive Lower Motor Neuron Disease

Neuropathy, Motor, Distal, Hereditary, Type Viib

Distal Hereditary Motor Neuronopathy Type 7

Dhmn7

Dhmnvpy

Distal Spinal Muscular Atrophy With Vocal Cord Paralysis

Perry Syndrome

Parkinsonism With Alveolar Hypoventilation And Mental Depression

PERRYS

Retinitis Pigmentosa

RP

Rod-Cone Dystrophy

Autosomal Recessive Retinitis Pigmentosa

Non-Syndromic Retinitis Pigmentosa

Pericentral Pigmentary Retinopathy

Pigmentary Retinopathy

Tapetoretinal Degeneration

Rcd

Retinitis Pigmentosa Autosomal Recessive

ARRP

Retinitis Pigmentosa, Autosomal Recessive

Retinitis Pigmentosa 1

Congenital Nervous System Abnormality

Congenital Neurologic Anomaly

Congenital Nervous System Disorder

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta DCTN2 VGNC VGNC:71751
Felis catus DCTN2 VGNC VGNC:61378
Canis familiaris DCTN2 VGNC VGNC:39817
Rattus norvegicus DCTN2 RGD RGD:1303182
Mus musculus DCTN2 MGD MGI:107733
Bos taurus DCTN2 VGNC VGNC:27929
Others DCTN2 NCBI