SFR1 - SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 Gene

中文名称：SWI5 依赖的同源重组修复蛋白 1

种属: Homo sapiens

同用名: MEI5; MEIR5; C10orf78; bA373N18.1

基因 ID: 119392 | 基因类型: protein coding

关于 SFR1

Cytogenetic location: 10q25.1 Genomic coordinates (GRCh38): 10:104,120,166-104,126,383 (from NCBI)

This gene has 3 transcripts (splice variants) and 190 orthologues. Broad expression in testis (RPKM 6.8), appendix (RPKM 2.8) and 25 other tissues.

功能概要

启用核受体共激活因子活性。参与细胞对雌激素刺激的反应；通过同源重组修复双链断裂；和转录的正调控，DNA 模板。位于核内。 Swi5-Sfr1 复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables nuclear receptor coactivator activity. Involved in cellular response to estrogen stimulus; double-strand break repair via homologous recombination; and positive regulation of transcription, DNA-templated. Located in nucleus. Part of Swi5-Sfr1 complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SFR1 基因产物(4)

mRNA	Protein	Name
NM_001002759.2	NP_001002759.1	swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog isoform a
NM_001384829.1	NP_001371758.1	swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog isoform b
NM_001384830.1	NP_001371759.1	swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog isoform b
NM_145247.5	NP_660290.3	swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog isoform b

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables nuclear receptor coactivator activity	IDA IDA: 通过直接分析推断	23874500	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	21252223	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in cellular response to estrogen stimulus	IDA IDA: 通过直接分析推断	23874500	GOA
involved in double-strand break repair via homologous recombination	IMP IMP: 通过突变表型推断	21252223	GOA
involved in positive regulation of DNA-templated transcription	IDA IDA: 通过直接分析推断	23874500	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
part of Swi5-Sfr1 complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	21252223	GOA
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	23874500	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SFR1 蛋白结构

Mei5

0
100
200
245 a.a.

蛋白主名

其他名称

swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog

MEI5 recombination repair protein homolog

SFR1 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	SFR1	Q86XK3	HMBOX1	Homo sapiens	Q6NT76-2	Validated Y2H	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	HMBOX1	Homo sapiens	Q6NT76-2	Y2H Array	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	TFIP11	Homo sapiens	Q9UBB9	Y2H Array	31515488
种属内	SFR1	Q86XK3	SWI5	Homo sapiens	Q1ZZU3	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	SFR1	Q86XK3	SWI5	Homo sapiens	Q1ZZU3	Anti Tag CoIP	21252223
种属内	SFR1	Q86XK3	SWI5	Homo sapiens	Q1ZZU3	Pull Down	21252223
种属内	SFR1	Q86XK3	NMI	Homo sapiens	Q13287	Validated Y2H	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	NDC80	Homo sapiens	O14777	Validated Y2H	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	RINT1	Homo sapiens	Q6NUQ1	Y2H Array	31515488
种属内	SFR1	Q86XK3	RINT1	Homo sapiens	Q6NUQ1	Validated Y2H	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	RINT1	Homo sapiens	Q6NUQ1	Y2H Array	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	CEP70	Homo sapiens	Q8NHQ1	Validated Y2H	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	RNF40	Homo sapiens	O75150	Validated Y2H	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	RNF40	Homo sapiens	O75150	Y2H Array	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	RNF40	Homo sapiens	O75150	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	SFR1	Q86XK3	MRFAP1L1	Homo sapiens	Q96HT8	Validated Y2H	25416956
种属内	SFR1	Q86XK3	MRFAP1L1	Homo sapiens	Q96HT8	Y2H Array	25416956

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Atrial Septal Defect 4

ASD4	Atrial Heart Septal Defect 4
Septal Defect, Atrial, Type 4

Atrial Septal Defect 3

ASD3	Atrial Heart Septal Defect 3
Septal Defect, Atrial, Type 3

Branchiootorenal Syndrome 2

BOR2	Bor Syndrome 2
Branchiootorenal Dysplasia 2	Branchio-Oto-Renal Dysplasia 2
Branchio-Oto-Renal Syndrome Type 2	Branchiootorenal Syndrome, Type 2

Atrial Septal Defect 2

ASD2	Atrial Heart Septal Defect 2
Atrial Septal Defect-2	Asd Ii
Septal Defect, Atrial, Type 2

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS12771	SFR1 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Bos taurus	SFR1	VGNC	VGNC:34519
Macaca mulatta	SFR1	VGNC	VGNC:106099
Mus musculus	SFR1	MGD	MGI:1915038
Rattus norvegicus	SFR1	RGD	RGD:1305481
Canis familiaris	SFR1	VGNC	VGNC:46079
Felis catus	SFR1	VGNC	VGNC:65063

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