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SAMD4A - sterile alpha motif domain containing 4A Gene

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中文名称：含无菌 alpha 基序结构域 4A

种属: Homo sapiens

同用名: SMG; SMGA; SAMD4; SMAUG; SMAUG1

基因 ID: 23034 | 基因类型: protein coding

关于 SAMD4A

Cytogenetic location: 14q22.2 Genomic coordinates (GRCh38): 14:54,565,316-54,793,315 (from NCBI)

This gene has 15 transcripts (splice variants), 209 orthologues and 1 paralogue. Broad expression in testis (RPKM 19.6), heart (RPKM 19.4) and 22 other tissues.

功能概要

SAMD4A 等蛋白质中的无菌 alpha 基序 (SAM) 是 RNA 结合域的一部分，通过结合称为 Smaug 识别元件的 RNA 序列基序发挥转录后调节作用，该基序以果蝇 Smaug 蛋白命名 (Baez 和 Boccaccio, 2005 [PubMed 16221671]) .[OMIM 提供，2008 年 3 月]

Sterile alpha motifs (SAMs) in proteins such as SAMD4A are part of an RNA-binding domain that functions as a posttranscriptional regulator by binding to an RNA sequence motif known as the Smaug recognition element, which was named after the Drosophila Smaug protein (Baez and Boccaccio, 2005 [PubMed 16221671]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

SAMD4A 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001161576.2 NP_001155048.2 protein Smaug homolog 1 isoform 2
NM_001161577.2 NP_001155049.1 protein Smaug homolog 1 isoform 3
NM_015589.6 NP_056404.4 protein Smaug homolog 1 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15778465 GOA
enables translation repressor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
16221671 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
acts upstream of or within positive regulation of translation IDA
IDA: 通过直接分析推断
16221671 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SAMD4A 蛋白结构

SAM_1

SAM_1: SAM domain (Sterile alpha motif) (325 - 381)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 718 a.a.
蛋白主名 其他名称

protein Smaug homolog 1

SAM domain-containing protein 4A

SAMD4A 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SAMD4A Q9UPU9 NUTM1 Homo sapiens Q86Y26
Y2H Array
25416956
Intra SAMD4A Q9UPU9 NUTM1 Homo sapiens Q86Y26
Validated Y2H
25416956
Intra SAMD4A Q9UPU9 YWHAE Homo sapiens P62258
Crosslink
36931259
Intra SAMD4A Q9UPU9 YWHAE Homo sapiens P62258
Anti Tag CoIP
33961781
Intra SAMD4A Q9UPU9 YWHAG Homo sapiens P61981
SLC
36931259
Intra SAMD4A Q9UPU9 YWHAG Homo sapiens P61981
Anti Tag CoIP
33961781
Intra SAMD4A Q9UPU9 YWHAG Homo sapiens P61981
CoIP
15324660
Intra SAMD4A Q9UPU9 SFN Homo sapiens P31947
TAP
15778465
Intra SAMD4A Q9UPU9 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Prey Pooling
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS12426 SAMD4A Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus SAMD4A VGNC VGNC:80853
Macaca mulatta SAMD4A VGNC VGNC:77085
Mus musculus SAMD4A MGD MGI:1921730
Rattus norvegicus SAMD4A RGD RGD:1310361
Canis familiaris SAMD4A VGNC VGNC:45852
Bos taurus SAMD4A VGNC VGNC:34272
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