1. Gene
  2. TRIM29 - tripartite motif containing 29 Gene

TRIM29 - tripartite motif containing 29 Gene

中文名称:含三方基序 29

种属: Homo sapiens

同用名: ATDC

基因 ID: 23650 | 基因类型: protein coding

关于 TRIM29

Cytogenetic location: 11q23.3 Genomic coordinates (GRCh38): 11:120,111,286-120,138,113 (from NCBI)

This gene has 21 transcripts (splice variants), 118 orthologues and 80 paralogues. Biased expression in esophagus (RPKM 274.4), skin (RPKM 264.0) and 4 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质属于 TRIM 蛋白家族。它有多个锌指图案和一个亮氨酸拉链图案。已经提出形成参与核酸结合的同二聚体或异二聚体。因此,它可能作为参与癌发生和/或分化的转录调节因子。它也可能在抑制放射敏感性方面起作用,因为它与共济失调毛细血管扩张表型有关。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene belongs to the TRIM protein family. It has multiple zinc finger motifs and a leucine zipper motif. It has been proposed to form homo- or heterodimers which are involved in nucleic acid binding. Thus, it may act as a transcriptional regulatory factor involved in carcinogenesis and/or differentiation. It may also function in the suppression of radiosensitivity since it is associated with ataxia telangiectasia phenotype. [provided by RefSeq, Jul 2008]

TRIM29 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001330382.2 NP_001317311.1 tripartite motif-containing protein 29 isoform 2
NM_012101.4 NP_036233.2 tripartite motif-containing protein 29 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

TRIM29 蛋白结构

zf-B_box

zf-B_box: B-box zinc finger (221 - 260)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 588 a.a.
蛋白主名 其他名称

tripartite motif-containing protein 29

ataxia-telangiectasia group D-associated protein

TRIM29 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra TRIM29 Q14134 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 NFKBID Homo sapiens Q8NI38
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 KRT35 Homo sapiens Q92764
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 KRT35 Homo sapiens Q92764
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 KRT35 Homo sapiens Q92764
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 CCDC57 Homo sapiens Q2TAC2-2
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 CCDC57 Homo sapiens Q2TAC2-2
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 CCDC57 Homo sapiens Q2TAC2-2
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 MTUS2 Homo sapiens Q5JR59-3
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 MTUS2 Homo sapiens Q5JR59-3
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 MTUS2 Homo sapiens Q5JR59-3
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 ANKS1A Homo sapiens Q49AR9
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 ANKS1A Homo sapiens Q49AR9
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 ANKS1A Homo sapiens Q49AR9
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 DISC1 Homo sapiens Q9NRI5-2
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 DISC1 Homo sapiens Q9NRI5-2
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 DISC1 Homo sapiens Q9NRI5-2
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 ACTN3 Homo sapiens Q08043
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 ACTN3 Homo sapiens Q08043
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Validated Y2H
25416956
Intra TRIM29 Q14134 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Array
25416956
Intra TRIM29 Q14134 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H
21516116
Intra TRIM29 Q14134 KRT5 Homo sapiens P13647
Anti Bait CoIP
37671092
Intra TRIM29 Q14134 TRIM29 Homo sapiens Q14134
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1
Y2H Pooling
16189514
Intra TRIM29 Q14134 MAD1L1 Homo sapiens Q9Y6D9
Validated Y2H
25416956
Intra TRIM29 Q14134 TRIM29 Homo sapiens Q14134
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 MAD1L1 Homo sapiens Q9Y6D9
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra TRIM29 Q14134 MAD1L1 Homo sapiens Q9Y6D9
Y2H Array
32296183
Intra TRIM29 Q14134 TRIM29 Homo sapiens Q14134
Y2H Pooling
16189514
Intra TRIM29 Q14134 TRIM29 Homo sapiens Q14134
Y2H Array
20211142
Intra TRIM29 Q14134 MAD1L1 Homo sapiens Q9Y6D9
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra TRIM29 Q14134 TRIM29 Homo sapiens Q14134
Validated Y2H
32296183
Intra TRIM29 Q14134 CEP70 Homo sapiens Q8NHQ1
Y2H Array
25416956
Intra TRIM29 Q14134 AXIN1 Homo sapiens O15169
Anti Bait CoIP
19249679
Intra TRIM29 Q14134 TRIM23 Homo sapiens P36406
Validated Y2H
25416956
Intra TRIM29 Q14134 TRIM23 Homo sapiens P36406
Y2H Array
25416956
Intra TRIM29 Q14134 DVL2 Homo sapiens O14641
Anti Bait CoIP
19249679
Intra TRIM29 Q14134 DVL2 Homo sapiens O14641
IF
19249679
Intra TRIM29 Q14134 LZTS2 Homo sapiens Q9BRK4
Y2H Pooling
16189514
Intra TRIM29 Q14134 LZTS2 Homo sapiens Q9BRK4
Validated Y2H
25416956
Intra TRIM29 Q14134 LZTS2 Homo sapiens Q9BRK4
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra TRIM29 Q14134 TRIP6 Homo sapiens Q15654
Y2H Array
25416956
Intra TRIM29 Q14134 TRIP6 Homo sapiens Q15654
Validated Y2H
25416956
Intra TRIM29 Q14134 GCC1 Homo sapiens Q96CN9
Y2H Pooling
16189514
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Ataxia-Telangiectasia

Ataxia Telangiectasia

Louis-Bar Syndrome

AT

At1

Ataxia-Telangiectasia Syndrome

Ataxia - Telangiectasia Variant

Boder-Sedgwick Syndrome

Louis Bar Syndrome

Cerebello-Oculocutaneous Telangiectasia

Immunodeficiency With Ataxia Telangiectasia

A-T

Ataxia Telangiectasia Syndrome

Atm

Telangiectasia, Cerebello-Oculocutaneous

Ataxia-Telangiectasia Variant

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus TRIM29 VGNC VGNC:36325
Mus musculus TRIM29 MGD MGI:1919419
Felis catus TRIM29 VGNC VGNC:66532
Rattus norvegicus TRIM29 RGD RGD:1307858
Macaca mulatta TRIM29 VGNC VGNC:79069
Canis familiaris TRIM29 VGNC VGNC:47812