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Rnf40 - ring finger protein 40 Gene

种属: Rattus norvegicus

基因 ID: 266712 | 基因类型: protein coding

关于 Rnf40

功能概要

Enables syntaxin-1 binding activity; ubiquitin conjugating Enzyme binding activity; and ubiquitin-protein transferase activity. Involved in positive regulation of cellular protein metabolic process; response to peptide hormone; and ubiquitin-dependent protein catabolic process. Located in axon terminus and cytosol. Is extrinsic component of membrane. Part of protein-containing complex. Biomarker of nephrogenic diabetes insipidus. Orthologous to human RNF40 (ring finger protein 40). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Rnf40 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_153471.1 NP_703201.1 E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12121982 RGD
enables syntaxin-1 binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12121982 RGD
enables ubiquitin conjugating enzyme binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
12121982 RGD
enables ubiquitin-protein transferase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
12121982 RGD
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in positive regulation of proteasomal protein catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
12121982 RGD
involved in positive regulation of protein polyubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
12121982 RGD
involved in response to peptide hormone IEP
IEP: 通过表达模式推断
21734099 RGD
involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
12121982 RGD
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of protein-containing complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
12121982 RGD
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B

BRE1-B

RING-type E3 ubiquitin transferase BRE1B

protein staring

ring finger protein 40, E3 ubiquitin protein ligase

staring protein

syntaxin-1-interacting RING finger protein

Rnf40 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属间
Rnf40 Q8CJB9 UBE2L6 Homo sapiens O14933
Anti Tag CoIP
12121982
种属内
Rnf40 Q8CJB9 Stx1b Rattus norvegicus P61265
Anti Tag CoIP
12121982
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Homo sapiens Rnf40 NCBI NCBI:9810