SSC5D - scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains Gene

中文名称：具有 5 个结构域的富半胱氨酸的清道夫受体家族成员

种属: Homo sapiens

同用名: S5D-SRCRB

基因 ID: 284297 | 基因类型: protein coding

关于 SSC5D

Cytogenetic location: 19q13.42 Genomic coordinates (GRCh38): 19:55,488,436-55,519,099 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 397 orthologues and 15 paralogues. Broad expression in gall bladder (RPKM 7.3), endometrium (RPKM 6.2) and 21 other tissues.

功能概要

预测启用纤连蛋白结合活性；层粘连蛋白结合活性；和清道夫受体活性。预计参与防御反应；细菌脂蛋白检测；白细胞介素 8 产生的负调节。预计在白细胞介素 8 生产的调节上游或调节范围内起作用。预计位于含胶原蛋白的细胞外基质中。预计在细胞外基质和细胞外空间中具有活性。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Predicted to enable fibronectin binding activity; laminin binding activity; and scavenger receptor activity. Predicted to be involved in defense response; detection of Bacterial lipoprotein; and negative regulation of interleukin-8 production. Predicted to act upstream of or within regulation of interleukin-8 production. Predicted to be located in collagen-containing extracellular matrix. Predicted to be active in extracellular matrix and extracellular space. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

SSC5D 基因产物(2)

mRNA	Protein	Name
NM_001144950.2	NP_001138422.1	soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D isoform 1 precursor
NM_001195267.2	NP_001182196.1	soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D isoform 2 precursor

基因本体论

分子功能

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	25416956	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SSC5D 蛋白结构

SRCR

0
300
600
900
1200
1573 a.a.

蛋白主名

其他名称

soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D

scavenger receptor cysteine rich domain containing (5 domains)

SSC5D 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	SSC5D	A1L4H1	NECAB2	Homo sapiens	Q7Z6G3-2	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	NECAB2	Homo sapiens	Q7Z6G3-2	Validated Y2H	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	NECAB2	Homo sapiens	Q7Z6G3-2	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	NECAB2	Homo sapiens	Q7Z6G3-2	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	SEC23IP	Homo sapiens	Q9Y6Y8	Validated Y2H	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	SEC23IP	Homo sapiens	Q9Y6Y8	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	SEC23IP	Homo sapiens	Q9Y6Y8	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	SEC23IP	Homo sapiens	Q9Y6Y8	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	SEC23IP	Homo sapiens	Q9Y6Y8	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	HAUS1	Homo sapiens	Q96CS2	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	HAUS1	Homo sapiens	Q96CS2	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	HAUS1	Homo sapiens	Q96CS2	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	KRT27	Homo sapiens	Q7Z3Y8	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	KRT27	Homo sapiens	Q7Z3Y8	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	KRT27	Homo sapiens	Q7Z3Y8	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	NUP62	Homo sapiens	P37198	Validated Y2H	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	NUP62	Homo sapiens	P37198	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	NUP62	Homo sapiens	P37198	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	NUP62	Homo sapiens	P37198	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	TRAF1	Homo sapiens	Q13077	Y2H Array	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED29	Homo sapiens	Q9NX70	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED29	Homo sapiens	Q9NX70	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED21	Homo sapiens	Q13503	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED21	Homo sapiens	Q13503	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED21	Homo sapiens	Q13503	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED21	Homo sapiens	Q13503	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED11	Homo sapiens	Q9P086	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED11	Homo sapiens	Q9P086	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	MED11	Homo sapiens	Q9P086	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	DTNBP1	Homo sapiens	Q96EV8	Validated Y2H	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	BLOC1S2	Homo sapiens	Q6QNY1	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	BLOC1S2	Homo sapiens	Q6QNY1	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	BLOC1S2	Homo sapiens	Q6QNY1	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	EXOC7	Homo sapiens	Q9UPT5-1	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	EXOC7	Homo sapiens	Q9UPT5-1	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	EXOC7	Homo sapiens	Q9UPT5-1	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	TCEA2	Homo sapiens	Q15560	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	PIN1	Homo sapiens	Q13526	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	EXOC7	Homo sapiens	Q9UPT5	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	SSC5D	A1L4H1	SDCBP	Homo sapiens	O00560	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	SKA1	Homo sapiens	Q96BD8	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	SKA1	Homo sapiens	Q96BD8	Y2H Array	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	SKA1	Homo sapiens	Q96BD8	Validated Y2H	32296183
种属内	SSC5D	A1L4H1	CEP170P1	Homo sapiens	Q96L14	Y2H Array	25416956

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Nasal Type Extranodal Nk/T-Cell Lymphoma

Extranodal Nasal Nk/T Cell Lymphoma	Angiocentric T-Cell Lymphoma
Lethal Midline Granuloma	Nk/T-Cell Lymphoma
Nktcl	Nasal T/Natural Killer-Cell Lymphoma
Granuloma, Lethal Midline	Nasal And Nasal-Type Nk/T-Cell Lymphoma

Adenoiditis

Chronic Adenoiditis

Vitreous Detachment

Posterior Vitreous Detachment

Vitreous Syneresis

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS13808	SSC5D Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Canis familiaris	SSC5D	VGNC	VGNC:53993
Felis catus	SSC5D	VGNC	VGNC:82391
Mus musculus	SSC5D	MGD	MGI:3606211
Rattus norvegicus	SSC5D	RGD	RGD:1565772
Bos taurus	SSC5D	VGNC	VGNC:35310

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