1. Gene
  2. MED21 - mediator complex subunit 21 Gene

MED21 - mediator complex subunit 21 Gene

中文名称:介体复合体亚基 21

种属: Homo sapiens

同用名: SRB7; SURB7; hSrb7

基因 ID: 9412 | 基因类型: protein coding

关于 MED21

Cytogenetic location: 12p11.23 Genomic coordinates (GRCh38): 12:27,022,558-27,038,951 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants) and 209 orthologues. Ubiquitous expression in adrenal (RPKM 13.1), testis (RPKM 11.0) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码介体复合物亚基 21 家族的成员。编码的蛋白质与人 RNA 聚合酶 II 全酶相互作用,并参与 RNA 聚合酶 II 转录基因的转录调节。该基因的一个假基因位于 8 号染色体上。可变剪接导致多个转录变体。[RefSeq 提供,2012 年 11 月]

This gene encodes a member of the mediator complex subunit 21 family. The encoded protein interacts with the human RNA polymerase II holoenzyme and is involved in transcriptional regulation of RNA polymerase II transcribed genes. A pseudogene of this gene is located on chromosome 8. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Nov 2012]

MED21 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001271811.2 NP_001258740.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21 isoform 2
NM_004264.5 NP_004255.2 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
14638676 GOA
enables transcription coactivator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
12037571 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
acts upstream of or within positive regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
12037571 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of core mediator complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24882805 GOA
part of mediator complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
12037571 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
24882805 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

MED21 蛋白结构

Med21

Med21: Subunit 21 of Mediator complex (1 - 127)

  • 0
  • 100
  • 144 a.a.
蛋白主名 其他名称

mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21

RNA polymerase II holoenzyme component SRB7

MED21 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
MED21 Q13503 SSC5D Homo sapiens A1L4H1
Validated Y2H
25416956
种属内
MED21 Q13503 SSC5D Homo sapiens A1L4H1
Y2H Array
25416956
种属内
MED21 Q13503 BORCS6 Homo sapiens Q96GS4
Validated Y2H
32296183
种属内
MED21 Q13503 TRIM72 Homo sapiens Q6ZMU5
Validated Y2H
32296183
种属内
MED21 Q13503 TRIM72 Homo sapiens Q6ZMU5
Y2H Array
32296183
种属内
MED21 Q13503 MED1 Homo sapiens Q15648
TAP
24981860
种属内
MED21 Q13503 MED1 Homo sapiens Q15648
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
MED21 Q13503 MED1 Homo sapiens Q15648
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
MED21 Q13503 MED1 Homo sapiens Q15648
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
MED21 Q13503 MED4 Homo sapiens Q9NPJ6
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
MED21 Q13503 MED4 Homo sapiens Q9NPJ6
TAP
24981860
种属内
MED21 Q13503 MED4 Homo sapiens Q9NPJ6
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
MED21 Q13503 MED4 Homo sapiens Q9NPJ6
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
MED21 Q13503 MED4 Homo sapiens Q9NPJ6
Anti Tag CoIP
24882805
种属内
MED21 Q13503 MED7 Homo sapiens O43513
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
MED21 Q13503 MED7 Homo sapiens O43513
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
MED21 Q13503 MED7 Homo sapiens O43513
Anti Tag CoIP
24882805
种属内
MED21 Q13503 MED7 Homo sapiens O43513
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
MED21 Q13503 MED9 Homo sapiens Q9NWA0
Anti Tag CoIP
24882805
种属内
MED21 Q13503 MED9 Homo sapiens Q9NWA0
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
MED21 Q13503 MED9 Homo sapiens Q9NWA0
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
MED21 Q13503 MED9 Homo sapiens Q9NWA0
TAP
24981860
种属内
MED21 Q13503 MED9 Homo sapiens Q9NWA0
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
MED21 Q13503 LSAMP Homo sapiens Q13449
Y2H Array
32814053
种属内
MED21 Q13503 LSAMP Homo sapiens Q13449
Validated Y2H
32814053
种属内
MED21 Q13503 LSAMP Homo sapiens Q13449
Y2H Pooling
32814053
种属内
MED21 Q13503 BLOC1S6 Homo sapiens Q9UL45
Validated Y2H
25416956
种属内
MED21 Q13503 BLOC1S6 Homo sapiens Q9UL45
Y2H Array
25416956
种属内
MED21 Q13503 ZNF655 Homo sapiens Q8N720
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
MED21 Q13503 ZNF655 Homo sapiens Q8N720
Validated Y2H
25416956
种属内
MED21 Q13503 ZNF655 Homo sapiens Q8N720
Y2H Array
25416956
种属内
MED21 Q13503 MIEF1 Homo sapiens Q9NQG6
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Hemopericardium

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Pericardial Effusion

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疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus MED21 MGD MGI:1347064
Canis familiaris MED21 VGNC VGNC:57444
Rattus norvegicus MED21 RGD RGD:1309836
Macaca mulatta MED21 VGNC VGNC:74501
Bos taurus MED21 VGNC VGNC:31358