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H3-5 - H3.5 histone Gene

中文名称:H3.5 组蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: H3.5; H3.3C; H3F3C

基因 ID: 440093 | 基因类型: protein coding

关于 H3-5

Cytogenetic location: 12p11.21 Genomic coordinates (GRCh38): 12:31,791,185-31,792,298 (from NCBI)

This gene has 1 transcript (splice variant), 84 orthologues and 20 paralogues.

功能概要

组蛋白是基本的核蛋白,负责真核生物染色体纤维的核小体结构。核小体由大约 146 bp 的 DNA 组成,包裹在由四种核心组蛋白 (H2A、H2B、H3 和 H4) 中的每一种成对组成的组蛋白八聚体周围。染色质纤维通过接头组蛋白 H1 与核小体之间的 DNA 相互作用进一步压缩,形成更高阶的染色质结构。与大多数组蛋白基因不同,该基因包含内含子并且其 mRNA 是聚腺苷酸化的。该基因编码的蛋白质是一种不依赖于复制的组蛋白,是组蛋白 H3 家族的一员。[RefSeq 提供,2015 年 10 月]

Histones are basic nuclear proteins that are responsible for the nucleosome structure of the chromosomal fiber in eukaryotes. Nucleosomes consist of approximately 146 bp of DNA wrapped around a histone octamer composed of pairs of each of the four core histones (H2A, H2B, H3, and H4). The chromatin fiber is further compacted through the interaction of a linker histone, H1, with the DNA between the nucleosomes to form higher order chromatin structures. This gene contains introns and its mRNA is polyadenylated, unlike most histone genes. The protein encoded by this gene is a replication-independent histone that is a member of the histone H3 family. [provided by RefSeq, Oct 2015]

H3-5 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_001013699.3 NP_001013721.2 histone H3.3C
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables nucleosomal DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
21274551 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in positive regulation of cell growth IMP
IMP: 通过突变表型推断
21274551 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in euchromatin IDA
IDA: 通过直接分析推断
21274551 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

H3-5 蛋白结构

Histone

Histone: Core histone H2A/H2B/H3/H4 (57 - 131)

  • 0
  • 100
  • 135 a.a.
蛋白主名 其他名称

histone H3.3C

H3 histone family member 3C

H3-5 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
H3-5 Q6NXT2 GTF3C3 Homo sapiens Q9Y5Q9
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 GTF3C3 Homo sapiens Q9Y5Q9
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 GTF3C3 Homo sapiens Q9Y5Q9
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 KIF1B Homo sapiens O60333-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 BAG6 Homo sapiens P46379-2
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 BAG6 Homo sapiens P46379-2
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 BAG6 Homo sapiens P46379-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DNAJB6 Homo sapiens O75190-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DNAJB6 Homo sapiens O75190-2
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DNAJB6 Homo sapiens O75190-2
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32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 COL26A1 Homo sapiens Q96A83-2
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 COL26A1 Homo sapiens Q96A83-2
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32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 COL26A1 Homo sapiens Q96A83-2
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种属内
H3-5 Q6NXT2 LAMP2 Homo sapiens P13473-2
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32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 LAMP2 Homo sapiens P13473-2
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种属内
H3-5 Q6NXT2 LAMP2 Homo sapiens P13473-2
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DNAJC9 Homo sapiens Q8WXX5
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 DNAJC9 Homo sapiens Q8WXX5
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32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 DNAJC9 Homo sapiens Q8WXX5
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32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
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32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 RAN Homo sapiens P62826
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 RAN Homo sapiens P62826
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 RAN Homo sapiens P62826
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 FBLIM1 Homo sapiens Q8WUP2
Y2H Array
32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 FBLIM1 Homo sapiens Q8WUP2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 FBLIM1 Homo sapiens Q8WUP2
Validated Y2H
32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 RNF11 Homo sapiens Q9Y3C5
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 LSAMP Homo sapiens Q13449
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 LSAMP Homo sapiens Q13449
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 LSAMP Homo sapiens Q13449
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 ICAM5 Homo sapiens Q9UMF0
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 ICAM5 Homo sapiens Q9UMF0
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 ICAM5 Homo sapiens Q9UMF0
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 CCK Homo sapiens P06307
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 CCK Homo sapiens P06307
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 CCK Homo sapiens P06307
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 NASP Homo sapiens P49321-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 NASP Homo sapiens P49321-2
Y2H Array
32296183
种属内
H3-5 Q6NXT2 NASP Homo sapiens P49321-2
Validated Y2H
25416956
种属内
H3-5 Q6NXT2 HMOX2 Homo sapiens P30519
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 HMOX2 Homo sapiens P30519
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 HMOX2 Homo sapiens P30519
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 CASP6 Homo sapiens P55212
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 CASP6 Homo sapiens P55212
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 CASP6 Homo sapiens P55212
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 WFS1 Homo sapiens O76024
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 WFS1 Homo sapiens O76024
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 WFS1 Homo sapiens O76024
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 GRN Homo sapiens P28799
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 GRN Homo sapiens P28799
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 GRN Homo sapiens P28799
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DR1 Homo sapiens Q01658
Y2H Pooling
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DR1 Homo sapiens Q01658
Validated Y2H
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DR1 Homo sapiens Q01658
Y2H Array
32814053
种属内
H3-5 Q6NXT2 DAXX Homo sapiens Q9UER7
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus H3-5 MGD MGI:3651714