1. Gene
  2. SNX7 - sorting nexin 7 Gene

SNX7 - sorting nexin 7 Gene

中文名称:排序 nexin 7

种属: Homo sapiens

基因 ID: 51375 | 基因类型: protein coding

关于 SNX7

Cytogenetic location: 1p21.3 Genomic coordinates (GRCh38): 1:98,661,319-98,760,500 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 208 orthologues and 15 paralogues. Ubiquitous expression in colon (RPKM 10.6), small intestine (RPKM 8.3) and 24 other tissues.

功能概要

该基因编码分选连接蛋白家族的一个成员。该家族的成员包含一个 phox (PX) 结构域,它是一个磷酸肌醇结合结构域,并参与细胞内运输。这种蛋白质不像某些家族成员那样包含卷曲螺旋区域,其确切功能尚不清楚。可变剪接导致多个转录本变体。已在 11 号染色体上鉴定出一个相关的假基因。[RefSeq 提供,2010 年 6 月]

This gene encodes a member of the sorting nexin family. Members of this family contain a phox (PX) domain, which is a phosphoinositide binding domain, and are involved in intracellular trafficking. This protein does not contain a coiled coil region like some family members, and its exact function is unknown. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 11. [provided by RefSeq, Jun 2010]

SNX7 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001364903.1 NP_001351832.1 sorting nexin-7 isoform c
NM_015976.5 NP_057060.2 sorting nexin-7 isoform a
NM_152238.4 NP_689424.2 sorting nexin-7 isoform b
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in positive regulation of autophagosome assembly IMP
IMP: 通过突变表型推断
32513819 GOA
involved in protein transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
32513819 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
is active in early endosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
32513819 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SNX7 蛋白结构

PX

PX: PX domain (99 - 210)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 451 a.a.
蛋白主名 其他名称

sorting nexin-7

SNX7 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SNX7 Q9UNH6 SNX4 Homo sapiens O95219
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SNX7 Q9UNH6 SNX4 Homo sapiens O95219
Pull Down
23085988
种属内
SNX7 Q9UNH6 SNX4 Homo sapiens O95219
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SNX7 Q9UNH6 HGS Homo sapiens O14964
Y2H Array
25416956
种属内
SNX7 Q9UNH6 TEX11 Homo sapiens Q8IYF3
Y2H Pooling
16189514
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus SNX7 VGNC VGNC:80362
Rattus norvegicus SNX7 RGD RGD:1305480
Canis familiaris SNX7 VGNC VGNC:46643
Bos taurus SNX7 VGNC VGNC:35113
Mus musculus SNX7 MGD MGI:1923811
Macaca mulatta SNX7 VGNC VGNC:106500