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Top1 - DNA topoisomerase I Gene

  • 基因
  • 蛋白
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中文名称：DNA 拓扑异构酶 I

种属: Rattus norvegicus

同用名: Ab2-086

基因 ID: 64550 | 基因类型: protein coding

关于 Top1

Primary_assembly 3: 149,293,403-149,376,623 forward strand.mRatBN7.2:CM026976.1

This gene has 2 transcripts (splice variants), 273 orthologues, 1 paralogue and is associated with 7 phenotypes. Biased expression in Spleen (RPKM 242.9), Thymus (RPKM 228.2) and 9 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白可启动 I 型 DNA 拓扑异构酶（单链切割，不依赖 ATP）活性和染色质 DNA 结合活性。参与多个过程，包括细胞对促黄体激素刺激的反应；核酸代谢过程；和对伽马辐射的反应。位于致密的纤维成分和纤维中心。与人类 TOP1（DNA 拓扑异构酶 I）同源。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables DNA Topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity and chromatin DNA binding activity. Involved in several processes, including cellular response to luteinizing hormone stimulus; nucleic acid metabolic process; and response to gamma radiation. Located in dense fibrillar component and fibrillar center. Orthologous to human TOP1 (DNA Topoisomerase I). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Top1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_022615.2 NP_072137.1 DNA topoisomerase 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10469141 RGD
enables DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
1332866 RGD
enables chromatin DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
1332866 RGD
enables protein-containing complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
2851418 RGD
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in DNA topological change IDA
IDA: 通过直接分析推断
1332866 RGD
involved in animal organ regeneration IEP
IEP: 通过表达模式推断
1332866 RGD
involved in cellular response to luteinizing hormone stimulus IEP
IEP: 通过表达模式推断
2822514 RGD
involved in rRNA transcription IMP
IMP: 通过突变表型推断
3033639 RGD
involved in response to cAMP IEP
IEP: 通过表达模式推断
2822514 RGD
involved in response to gamma radiation IEP
IEP: 通过表达模式推断
2853856 RGD
involved in response to temperature stimulus IEP
IEP: 通过表达模式推断
9076473 RGD
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in dense fibrillar component IDA
IDA: 通过直接分析推断
11170002 RGD
located in fibrillar center IDA
IDA: 通过直接分析推断
17587596 RGD
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

Top1 蛋白结构

Topoisomer_IB_N_htopoI_like

Topoisomer_IB_N_htopoI_like: cd03488 (217 - 431)

TOPEUc

TOPEUc: smart00435 (361 - 738)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 767 a.a.
蛋白主名 其他名称

DNA topoisomerase 1

topoisomerase (DNA) I

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Approval
生物活性分子 (1)
目录号 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-16560 Camptothecin 99.86% 否
Clinical Phase
生物活性分子 (4)
目录号 产品名 作用方式
纯度 Phase
HY-168739 Topoisomerase I inhibitor 17 / Phase 2
HY-U00248A LMP744 hydrochloride Inhibitor 99.70% Phase 1
HY-18350 Indimitecan Inhibitor 98.30% Phase 1
HY-U00248 LMP744 Inhibitor 98.85% Phase 1
Pre-clinical Phase
生物活性分子 (19)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-N0114A (±)-Evodiamine 99.74% 否
HY-160005 LMP517 Inhibitor 99.58% 否
HY-P10742 CBX-12 Inhibitor / 否
HY-143265 Topoisomerase I inhibitor 2 / 否
HY-144794 EGFR-IN-46 / 否
HY-146437 Topoisomerase I inhibitor 6 Inhibitor / 否
HY-149348 DiPT-4 / 否
HY-161957 Top1/2-IN-1 Inhibitor / 否
HY-16560B (R)-Camptothecin Control / 否
HY-171124 Tilatamig samrotecan Inhibitor / 否
HY-18350A Indimitecan hydrochloride Inhibitor / 否
HY-RS14890 TOP1 Human Pre-designed siRNA Set A / 否
HY-RS14891 Top1 Mouse Pre-designed siRNA Set A / 否
HY-RS14892 Top1 Rat Pre-designed siRNA Set A / 否
HY-RS14893 TOP1MT Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否
HY-118942 Topovale Inhibitor / 否
HY-133219 Guajadial C Inhibitor / 否
HY-164429 VIP236 / 否
HY-126142 Top1 inhibitor 1 Inhibitor / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Homo sapiens Top1 NCBI NCBI:7150
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