SNX2 - sorting nexin 2 Gene

中文名称：排序 nexin 2

种属: Homo sapiens

同用名: TRG-9

基因 ID: 6643 | 基因类型: protein coding

关于 SNX2

Cytogenetic location: 5q23.2 Genomic coordinates (GRCh38): 5:122,774,996-122,834,543 (from NCBI)

This gene has 13 transcripts (splice variants), 214 orthologues and 15 paralogues. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 17.2), spleen (RPKM 14.1) and 25 other tissues.

功能概要

该基因属于分类连接蛋白家族，其成员包含磷酸肌醇结合 phox (PX) 结构域。所编码的蛋白质是逆转录酶复合体的一个组成部分，它在内吞途径中的蛋白质分选中发挥作用。该蛋白质可能与其他家族成员形成寡聚复合物。交替剪接导致该基因的多个转录变体。与该基因相关的假基因位于 1 号和 7 号染色体上。[RefSeq 提供，2013 年 5 月]

This gene belongs to the sorting nexin family whose members contain the phosphoinositide-binding phox (PX) domain. The encoded protein is a component of the retromer complex which plays a role in protein sorting in the endocytic pathway. This protein may form oligomeric complexes with Other family members. Alternate splicing results in multiple transcript variants of this gene. Pseudogenes associated with this gene are located on chromosomes 1 and 7. [provided by RefSeq, May 2013]

SNX2 基因产物(2)

mRNA	Protein	Name
NM_001278199.1	NP_001265128.1	sorting nexin-2 isoform 2
NM_003100.4	NP_003091.2	sorting nexin-2 isoform 1

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables epidermal growth factor receptor binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	9819414	GOA
enables identical protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	9819414	GOA
enables insulin receptor binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	9819414	GOA
enables leptin receptor binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	9819414	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	9819414	GOA
enables protein heterodimerization activity	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	11102511	GOA
enables protein homodimerization activity	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	11102511	GOA
enables transferrin receptor binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	9819414	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in lamellipodium morphogenesis	IDA IDA: 通过直接分析推断	20604901	GOA
involved in retrograde transport, endosome to Golgi	IMP IMP: 通过突变表型推断	20138391	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in cytoplasm	IDA IDA: 通过直接分析推断	11279102	GOA
located in endosome membrane	IDA IDA: 通过直接分析推断	15673616	GOA
located in membrane	IDA IDA: 通过直接分析推断	9819414	GOA
part of protein-containing complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	9819414	GOA
part of retromer complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	11102511	GOA
part of retromer, tubulation complex	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	11102511	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SNX2 蛋白结构

Sorting_nexin

Vps5

0
100
200
300
400
519 a.a.

蛋白主名

其他名称

sorting nexin-2

CTB-36H16.2

SNX2 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	SNX2	O60749	PNKP	Homo sapiens	Q96T60	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	FNBP1	Homo sapiens	Q96RU3	Y2H	14596906
种属内	SNX2	O60749	FNBP1	Homo sapiens	Q96RU3	Y2H	11438682
种属内	SNX2	O60749	TMEM239	Homo sapiens	Q8WW34-2	Y2H Array	32296183
种属内	SNX2	O60749	TMEM239	Homo sapiens	Q8WW34-2	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	TMEM239	Homo sapiens	Q8WW34-2	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNX2	O60749	CENPQ	Homo sapiens	Q7L2Z9	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	CENPQ	Homo sapiens	Q7L2Z9	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNX2	O60749	CENPQ	Homo sapiens	Q7L2Z9	Y2H Array	32296183
种属内	SNX2	O60749	YIF1A	Homo sapiens	O95070	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	YIF1A	Homo sapiens	O95070	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNX2	O60749	YIF1A	Homo sapiens	O95070	Y2H Array	32296183
种属内	SNX2	O60749	SNX1	Homo sapiens	Q13596	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNX2	O60749	MTIF3	Homo sapiens	Q9H2K0	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	MTIF3	Homo sapiens	Q9H2K0	Y2H Array	32296183
种属内	SNX2	O60749	MTIF3	Homo sapiens	Q9H2K0	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNX2	O60749	SMN1	Homo sapiens	Q16637	Y2H Pooling	32814053
种属内	SNX2	O60749	SMN1	Homo sapiens	Q16637	Validated Y2H	32814053
种属内	SNX2	O60749	SMN1	Homo sapiens	Q16637	Y2H Array	32814053
种属内	SNX2	O60749	HTT	Homo sapiens	P42858	Validated Y2H	32814053
种属内	SNX2	O60749	HTT	Homo sapiens	P42858	Y2H Array	32814053
种属内	SNX2	O60749	HTT	Homo sapiens	P42858	Y2H Pooling	32814053
种属内	SNX2	O60749	ARL6IP1	Homo sapiens	Q15041	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	ARL6IP1	Homo sapiens	Q15041	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNX2	O60749	ARL6IP1	Homo sapiens	Q15041	Y2H Array	32296183
种属内	SNX2	O60749	SNX5	Homo sapiens	Q9Y5X3	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNX2	O60749	SNX5	Homo sapiens	Q9Y5X3	Y2H	21988832
种属内	SNX2	O60749	PLIN3	Homo sapiens	O60664	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNX2	O60749	PLIN3	Homo sapiens	O60664	Y2H Array	32296183
种属内	SNX2	O60749	APP	Homo sapiens	P05067	Validated Y2H	32814053
种属内	SNX2	O60749	APP	Homo sapiens	P05067	Y2H Array	32814053
种属内	SNX2	O60749	APP	Homo sapiens	P05067	Y2H Pooling	32814053
种属内	SNX2	O60749	SNX32	Homo sapiens	Q86XE0	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	SNX6	Homo sapiens	Q9UNH7	Validated Y2H	32296183
种属内	SNX2	O60749	SNX6	Homo sapiens	Q9UNH7	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	SNX2	O60749	SNX6	Homo sapiens	Q9UNH7	Y2H Array	32296183
种属内	SNX2	O60749	SNX6	Homo sapiens	Q9UNH7	Anti Tag CoIP	35271311
种属内	SNX2	O60749	SNX6	Homo sapiens	Q9UNH7	Y2H	21988832

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Parkinson Disease, Late-Onset

Parkinson Disease	Parkinson'S Disease
PD	PARK
Parkinson Disease, Susceptibility To	Late Onset Parkinson'S Disease
Late Onset Parkinson Disease	Paralysis Agitans
Primary Parkinsonism	Idiopathic Parkinson Disease
Parkinson'S	Parkinson Disease, Late-Onset, Susceptibility To
Parkinson Disease, Age Of Onset, Modifier	Lewy Body Parkinson Disease
Idiopathic Parkinson'S Disease	Pd - [Parkinson Disease]
Parkinson Disease Nos	Parkinson, Nos
Primary Parkinson Disease

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-101800	Senexin B	Inhibitor	99.72%	否
HY-RS13533	SNX2 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否
HY-117988	SNX2-1-108		/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Felis catus	SNX2	VGNC	VGNC:65550
Rattus norvegicus	SNX2	RGD	RGD:1310291
Canis familiaris	SNX2	VGNC	VGNC:46629
Macaca mulatta	SNX2	VGNC	VGNC:77682
Mus musculus	SNX2	MGD	MGI:1915054
Bos taurus	SNX2	VGNC	VGNC:35100

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