1. Gene
  2. SNX1 - sorting nexin 1 Gene

SNX1 - sorting nexin 1 Gene

中文名称:排序 nexin 1

种属: Homo sapiens

同用名: VPS5; HsT17379

基因 ID: 6642 | 基因类型: protein coding

关于 SNX1

Cytogenetic location: 15q22.31 Genomic coordinates (GRCh38): 15:64,095,982-64,144,231 (from NCBI)

This gene has 14 transcripts (splice variants), 269 orthologues and 15 paralogues. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 29.5), fat (RPKM 17.2) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码分选连接蛋白家族的一个成员。该家族的成员包含一个 phox (PX) 结构域,它是一个磷酸肌醇结合结构域,并参与细胞内运输。这种内体蛋白调节表皮生长因子受体的细胞表面表达。这种蛋白质还在将蛋白酶激活受体 1 从早期核内体分选到溶酶体中发挥作用。这种蛋白质可能与家族成员形成寡聚复合物。该基因产生三种转录变体,编码不同的亚型。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes a member of the sorting nexin family. Members of this family contain a phox (PX) domain, which is a phosphoinositide binding domain, and are involved in intracellular trafficking. This endosomal protein regulates the cell-surface expression of epidermal growth factor receptor. This protein also has a role in sorting protease-activated receptor-1 from early endosomes to lysosomes. This protein may form oligomeric complexes with family members. This gene results in three transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SNX1 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001242933.2 NP_001229862.1 sorting nexin-1 isoform d
NM_003099.5 NP_003090.2 sorting nexin-1 isoform a
NM_148955.4 NP_683758.1 sorting nexin-1 isoform b
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables epidermal growth factor receptor binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
9819414 GOA
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11102511 GOA
enables insulin receptor binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
9819414 GOA
enables leptin receptor binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
9819414 GOA
enables phosphatidylinositol binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
15498486 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
9819414 GOA
enables protein heterodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11102511 GOA
enables protein homodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11102511 GOA
enables transferrin receptor binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
9819414 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in early endosome to Golgi transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
15498486 GOA
involved in intracellular protein transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
15498486 GOA
involved in lamellipodium morphogenesis IDA
IDA: 通过直接分析推断
20604901 GOA
involved in receptor internalization IMP
IMP: 通过突变表型推断
20070609 GOA
involved in retrograde transport, endosome to Golgi IMP
IMP: 通过突变表型推断
18088323 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
11279102 GOA
located in early endosome membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
15498486 GOA
located in endosome membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
15673616 GOA
located in membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
9819414 GOA
part of protein-containing complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
9819414 GOA
part of retromer complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
19619496 GOA
part of retromer, tubulation complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11102511 GOA
located in vesicle IDA
IDA: 通过直接分析推断
25468996 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SNX1 蛋白结构

Sorting_nexin

Sorting_nexin: Sorting nexin, N-terminal domain (10 - 137)

PX

PX: PX domain (147 - 267)

Vps5

Vps5: Vps5 C terminal like (285 - 517)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 522 a.a.
蛋白主名 其他名称

sorting nexin-1

sorting nexin 1A

SNX1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SNX1 Q13596 SNX2 Homo sapiens O60749
LexA B52 Complement
11102511
种属内
SNX1 Q13596 SNX2 Homo sapiens O60749
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SNX1 Q13596 SNX2 Homo sapiens O60749
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
SNX1 Q13596 VPS35 Homo sapiens Q96QK1
GMS
11102511
种属内
SNX1 Q13596 VPS35 Homo sapiens Q96QK1
LexA B52 Complement
11102511
种属内
SNX1 Q13596 HCCS Homo sapiens P53701
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 HCCS Homo sapiens P53701
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 COQ3 Homo sapiens Q9NZJ6
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 COQ3 Homo sapiens Q9NZJ6
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 COQ3 Homo sapiens Q9NZJ6
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 CMTM5 Homo sapiens Q96DZ9-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 CMTM5 Homo sapiens Q96DZ9-2
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 CMTM5 Homo sapiens Q96DZ9-2
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 TMEM239 Homo sapiens Q8WW34-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 TMEM239 Homo sapiens Q8WW34-2
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 TMEM239 Homo sapiens Q8WW34-2
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种属内
SNX1 Q13596 CHRNG Homo sapiens P07510-2
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种属内
SNX1 Q13596 CHRNG Homo sapiens P07510-2
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 SYNGR1 Homo sapiens O43759-2
Y2H Prey Pooling
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种属内
SNX1 Q13596 SYNGR1 Homo sapiens O43759-2
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 REEP6 Homo sapiens Q96HR9-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 REEP6 Homo sapiens Q96HR9-2
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 REEP6 Homo sapiens Q96HR9-2
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 FAM25C Homo sapiens B3EWG5
Y2H Prey Pooling
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种属内
SNX1 Q13596 FAM25C Homo sapiens B3EWG5
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种属内
SNX1 Q13596 REEP5 Homo sapiens Q00765
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种属内
SNX1 Q13596 REEP5 Homo sapiens Q00765
Y2H Prey Pooling
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种属内
SNX1 Q13596 CMTM4 Homo sapiens Q8IZR5-2
Y2H Prey Pooling
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种属内
SNX1 Q13596 CMTM4 Homo sapiens Q8IZR5-2
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 CMTM4 Homo sapiens Q8IZR5-2
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 RHEX Homo sapiens Q6ZWK4
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 RHEX Homo sapiens Q6ZWK4
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 RHEX Homo sapiens Q6ZWK4
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 CMTM5 Homo sapiens Q96DZ9
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25416956
种属内
SNX1 Q13596 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SH3GLB1 Homo sapiens Q9Y371
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
Validated Y2H
25416956
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
Y2H
21516116
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SNX6 Homo sapiens Q9UNH7
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SNX1 Q13596 SNX6 Homo sapiens Q9UNH7
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SNX6 Homo sapiens Q9UNH7
Anti Tag CoIP
35271311
种属内
SNX1 Q13596 SNX32 Homo sapiens Q86XE0
Y2H Array
25416956
种属内
SNX1 Q13596 SNX6 Homo sapiens Q9UNH7
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 LIME1 Homo sapiens Q9H400
Y2H Prey Pooling
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种属内
SNX1 Q13596 LIME1 Homo sapiens Q9H400
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 LIME1 Homo sapiens Q9H400
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 SFT2D1 Homo sapiens Q8WV19
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SFT2D1 Homo sapiens Q8WV19
Y2H Prey Pooling
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种属内
SNX1 Q13596 SFT2D1 Homo sapiens Q8WV19
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 FUNDC1 Homo sapiens Q8IVP5
Validated Y2H
25416956
种属内
SNX1 Q13596 FUNDC1 Homo sapiens Q8IVP5
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SNX1 Q13596 ARMC12 Homo sapiens Q5T9G4-2
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 ARMC12 Homo sapiens Q5T9G4-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 FKBP7 Homo sapiens Q9Y680
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 FKBP7 Homo sapiens Q9Y680
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 FKBP7 Homo sapiens Q9Y680
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SDR16C5 Homo sapiens Q8N3Y7
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SDR16C5 Homo sapiens Q8N3Y7
Validated Y2H
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SDR16C5 Homo sapiens Q8N3Y7
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32296183
种属内
SNX1 Q13596 RABAC1 Homo sapiens Q9UI14
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25416956
种属内
SNX1 Q13596 RABAC1 Homo sapiens Q9UI14
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SNX1 Q13596 ARL6IP1 Homo sapiens Q15041
Validated Y2H
25416956
种属内
SNX1 Q13596 ARL6IP1 Homo sapiens Q15041
Y2H Array
25416956
种属内
SNX1 Q13596 SNX5 Homo sapiens Q9Y5X3
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SNX1 Q13596 SNX5 Homo sapiens Q9Y5X3
Pull Down
23085988
种属内
SNX1 Q13596 SNX5 Homo sapiens Q9Y5X3
Anti Tag CoIP
28514442
种属内
SNX1 Q13596 RTN4 Homo sapiens Q9NQC3
Validated Y2H
25416956
种属内
SNX1 Q13596 RTN4 Homo sapiens Q9NQC3
Y2H Array
25416956
种属内
SNX1 Q13596 MPC2 Homo sapiens O95563
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 MPC2 Homo sapiens O95563
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 PLIN3 Homo sapiens O60664
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SNX1 Q13596 PLIN3 Homo sapiens O60664
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 RTN3 Homo sapiens O95197
Y2H Array
25416956
种属内
SNX1 Q13596 AGTRAP Homo sapiens Q6RW13
Validated Y2H
25416956
种属内
SNX1 Q13596 REEP6 Homo sapiens Q96HR9
Y2H
21988832
种属内
SNX1 Q13596 REEP6 Homo sapiens Q96HR9
Y2H Array
25416956
种属内
SNX1 Q13596 SYP Homo sapiens P08247
Y2H Array
32296183
种属内
SNX1 Q13596 SYP Homo sapiens P08247
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

SNX1 抗体

目录号 产品名 应用 反应物种
HY-P82299 SNX1 Antibody (YA2044) WB, IHC-P, ICC/IF, FC Human, Mouse, Rat

关联疾病

疾病名称 别名
Parkinson Disease, Late-Onset

Parkinson Disease

Parkinson'S Disease

PD

PARK

Parkinson Disease, Susceptibility To

Late Onset Parkinson'S Disease

Late Onset Parkinson Disease

Paralysis Agitans

Primary Parkinsonism

Idiopathic Parkinson Disease

Parkinson'S

Parkinson Disease, Late-Onset, Susceptibility To

Parkinson Disease, Age Of Onset, Modifier

Lewy Body Parkinson Disease

Idiopathic Parkinson'S Disease

Pd - [Parkinson Disease]

Parkinson Disease Nos

Parkinson, Nos

Primary Parkinson Disease

Hereditary Spastic Paraplegia

Familial Spastic Paraplegia

Hereditary Spastic Paraparesis

Strumpell-Lorrain Disease

Familial Spastic Paraparesis

Hsp

Spg

Strümpell-Lorrain Disease

Spastic Paraplegia, Hereditary

French Settlement Disease

Strumpell-Lorrain Syndrome

Fsp

Spastic Paraplegia, Familial

Spastic Paraplegia Hereditary

Spastic Paraplegia 3, Autosomal Dominant

Spastic Paraparesis

Hereditary Spastic Paralysis

Familial Spastic Paralysis

Hereditary Spastic Ataxia

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SNX1 RGD RGD:68935
Canis familiaris SNX1 VGNC VGNC:46619
Macaca mulatta SNX1 VGNC VGNC:77681
Felis catus SNX1 VGNC VGNC:65541
Mus musculus SNX1 MGD MGI:1928395
Bos taurus SNX1 VGNC VGNC:35090