2. Gene
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COL23A1 - collagen type XXIII alpha 1 chain Gene

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中文名称：XXIII 型胶原蛋白 alpha 1 链

种属: Homo sapiens

基因 ID: 91522 | 基因类型: protein coding

关于 COL23A1

Cytogenetic location: 5q35.3 Genomic coordinates (GRCh38): 5:178,237,618-178,590,393 (from NCBI)

This gene has 9 transcripts (splice variants), 132 orthologues and 37 paralogues. Biased expression in thyroid (RPKM 9.3), heart (RPKM 2.2) and 10 other tissues.

功能概要

COL23A1 是跨膜胶原蛋白的成员，它是非原纤维胶原蛋白的一个亚科，包含单次疏水性跨膜结构域 (Banyard 等人，2003 [PubMed 12644459]) 。[OMIM 提供，2008 年 3 月]

COL23A1 is a member of the transmembrane collagens, a subfamily of the nonfibrillar collagens that contain a single pass hydrophobic transmembrane domain (Banyard et al., 2003 [PubMed 12644459]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

COL23A1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_173465.4 NP_775736.2 collagen alpha-1(XXIII) chain
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

COL23A1 蛋白结构

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (120 - 172)

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (160 - 218)

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (199 - 256)

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (251 - 305)

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (321 - 375)

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (342 - 396)

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (412 - 470)

Collagen

Collagen: Collagen triple helix repeat (20 copies) (463 - 520)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 540 a.a.
蛋白主名 其他名称

collagen alpha-1(XXIII) chain

collagen, type XXIII, alpha 1

COL23A1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
COL23A1 Q86Y22 EXOSC8 Homo sapiens Q96B26
Validated Y2H
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Paraurethral Gland Cancer

Malignant Tumor Of Paraurethral Gland

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Skene Gland Carcinoma

Carcinoma Of The Paraurethral Gland

Paraurethral Gland Carcinoma
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS02975 COL23A1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus COL23A1 MGD MGI:2653243
Rattus norvegicus COL23A1 RGD RGD:727898
Bos taurus COL23A1 VGNC VGNC:54416
Felis catus COL23A1 VGNC VGNC:102181
Canis familiaris COL23A1 VGNC VGNC:51705
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