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SOX13 - SRY-box transcription factor 13 Gene

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中文名称：SRY-box 转录因子 13

种属: Homo sapiens

同用名: ICA12; Sox-13

基因 ID: 9580 | 基因类型: protein coding

关于 SOX13

Cytogenetic location: 1q32.1 Genomic coordinates (GRCh38): 1:204,073,115-204,127,743 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants), 212 orthologues and 20 paralogues. Ubiquitous expression in placenta (RPKM 12.7), endometrium (RPKM 11.6) and 24 other tissues.

功能概要

该基因编码参与胚胎发育调控和细胞命运决定的转录因子 SOX (SRY 相关 HMG 盒) 家族成员。编码的蛋白质在与其他蛋白质形成蛋白质复合物后可以充当转录调节剂。它还被确定为 1 型糖尿病自身抗原，也称为胰岛细胞抗体 12。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene encodes a member of the SOX (SRY-related HMG-box) family of transcription factors involved in the regulation of embryonic development and in the determination of cell fate. The encoded protein may act as a transcriptional regulator after forming a protein complex with Other proteins. It has also been determined to be a type-1 diabetes autoantigen, also known as islet cell antibody 12. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SOX13 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_005686.3 NP_005677.2 transcription factor SOX-13
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10871192 GOA
enables DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific IMP
IMP: 通过突变表型推断
20028982 GOA
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10871192 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17218525 GOA
enables transcription cis-regulatory region binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
26525805 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of DNA-templated transcription IMP
IMP: 通过突变表型推断
20028982 GOA
involved in negative regulation of canonical Wnt signaling pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
20028982 GOA
involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II IMP
IMP: 通过突变表型推断
20028982 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
10871192 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SOX13 蛋白结构

HMG_box

HMG_box: HMG (high mobility group) box (424 - 492)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 622 a.a.
蛋白主名 其他名称

transcription factor SOX-13

SRY (sex determining region Y)-box 13

SOX13 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SOX13 Q9UN79 CTBP2 Homo sapiens P56545
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SOX13 Q9UN79 CTBP2 Homo sapiens P56545
Y2H
21988832
种属内
SOX13 Q9UN79 CTBP2 Homo sapiens P56545
Anti Tag CoIP
21988832
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Type 1 Diabetes Mellitus 5

Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent, 5

Latent Autoimmune Diabetes In Adults

IDDM5

Insulin-Dependent Diabetes Mellitus 5

T1D5

Lada

Type 1.5 Diabetes

Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent, Type 5
疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS13586 SOX13 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus SOX13 VGNC VGNC:35142
Mus musculus SOX13 MGD MGI:98361
Rattus norvegicus SOX13 RGD RGD:1309674
Felis catus SOX13 VGNC VGNC:65579
Macaca mulatta SOX13 VGNC VGNC:77839
Canis familiaris SOX13 VGNC VGNC:46674
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