2. Gene
  3. ALKBH2 - alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase Gene

ALKBH2 - alkB homolog 2, alpha-ketoglutarate dependent dioxygenase Gene

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中文名称：alkB 同系物 2，α-酮戊二酸依赖性双加氧酶

种属: Homo sapiens

同用名: ABH2

基因 ID: 121642 | 基因类型: protein coding

关于 ALKBH2

Cytogenetic location: 12q24.11 Genomic coordinates (GRCh38): 12:109,088,189-109,093,472 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants) and 196 orthologues. Ubiquitous expression in ovary (RPKM 6.9), endometrium (RPKM 5.8) and 25 other tissues.

功能概要

大肠杆菌 AlkB 蛋白通过修复单链 DNA 中产生的特定 DNA 损伤来防止甲基化剂的细胞毒性。 ALKBH2 和 ALKBH3 (MIM 610603) 是大肠杆菌 AlkB 同源物，可催化去除 1-甲基腺嘌呤和 3-甲基胞嘧啶 (Duncan 等人，2002 [PubMed 12486230]) 。[OMIM 提供，2008 年 3 月]

The Escherichia coli AlkB protein protects against the cytotoxicity of methylating agents by repair of the specific DNA lesions generated in single-stranded DNA. ALKBH2 and ALKBH3 (MIM 610603) are E. coli AlkB homologs that catalyze the removal of 1-methyladenine and 3-methylcytosine (Duncan et al., 2002 [PubMed 12486230]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

ALKBH2 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001001655.3 NP_001001655.1 DNA oxidative demethylase ALKBH2 isoform 1
NM_001145374.2 NP_001138846.1 DNA oxidative demethylase ALKBH2 isoform 1
NM_001145375.2 NP_001138847.1 DNA oxidative demethylase ALKBH2 isoform 1
NM_001205179.2 NP_001192108.1 DNA oxidative demethylase ALKBH2 isoform 2
NM_001205180.2 NP_001192109.1 DNA oxidative demethylase ALKBH2 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables broad specificity oxidative DNA demethylase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
12486230 GOA
enables cytosine C-5 DNA demethylase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
18432238 GOA
enables ferrous iron binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
18432238 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19736315 GOA
enables rDNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
23972994 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in DNA alkylation repair IDA
IDA: 通过直接分析推断
18432238 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleolus IDA
IDA: 通过直接分析推断
23972994 GOA
located in nucleoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
23972994 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
19736315 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

ALKBH2 蛋白结构

2OG-FeII_Oxy_2

2OG-FeII_Oxy_2: 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily (74 - 254)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 261 a.a.
蛋白主名 其他名称

DNA oxidative demethylase ALKBH2

2OG-Fe(II) oxy DC1

ALKBH2 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra ALKBH2 Q6NS38 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Array
32296183
Intra ALKBH2 Q6NS38 GOLGA2 Homo sapiens Q08379
Y2H Prey Pooling
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS00604 ALKBH2 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus ALKBH2 VGNC VGNC:25833
Felis catus ALKBH2 VGNC VGNC:59750
Rattus norvegicus ALKBH2 RGD RGD:1306377
Mus musculus ALKBH2 MGD MGI:2141032
Canis familiaris ALKBH2 VGNC VGNC:37803
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