1. Gene
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NELFB - negative elongation factor complex member B Gene

中文名称:负延伸因子复合体成员 B

种属: Homo sapiens

同用名: COBRA1; NELF-B

基因 ID: 25920 | 基因类型: protein coding

关于 NELFB

Cytogenetic location: 9q34.3 Genomic coordinates (GRCh38): 9:137,255,327-137,273,542 (from NCBI)

This gene has 1 transcript (splice variant) and 203 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 16.5), fat (RPKM 16.5) and 25 other tissues.

功能概要

NELFB 是负延伸因子 (NELF) 的一个亚基,其中还包括 NELFA (WHSC2;MIM 606026) 、NELFC 或 NELFD (TH1L;MIM 605297) 和 NELFE (RDBP;MIM 154040) 。 NELF 与 DRB 敏感性诱导因子 (DSIF) 、SPT4 (SUPT4H1;MIM 603555) 和 SPT5 (SUPT5H;MIM 602102) 的异二聚体一起作用,导致 RNA 聚合酶 II 的转录暂停 (参见 MIM 180660) (Narita 等人, 2003 [PubMed 12612062]) .[OMIM 提供,2008 年 3 月]

NELFB is a subunit of negative elongation factor (NELF), which also includes NELFA (WHSC2; MIM 606026), either NELFC or NELFD (TH1L; MIM 605297), and NELFE (RDBP; MIM 154040). NELF acts with DRB sensitivity-inducing factor (DSIF), a heterodimer of SPT4 (SUPT4H1; MIM 603555) and SPT5 (SUPT5H; MIM 602102), to cause transcriptional pausing of RNA polymerase II (see MIM 180660) (Narita et al., 2003 [PubMed 12612062]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

NELFB 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_015456.5 NP_056271.3 negative elongation factor B
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11739404 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
12612062 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of NELF complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
12612062 GOA
part of NELF complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12612062 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
12612062 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

NELFB 蛋白结构

COBRA1

COBRA1: Cofactor of BRCA1 (COBRA1) (106 - 579)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 580 a.a.
蛋白主名 其他名称

negative elongation factor B

cofactor of BRCA1

NELFB 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra NELFB Q8WX92 MGST1 Homo sapiens P10620
Display Tech
20195357
Intra NELFB Q8WX92 BRCA1 Homo sapiens P38398
Confocal
11739404
Intra NELFB Q8WX92 DENR Homo sapiens O43583
Display Tech
20195357
Intra NELFB Q8WX92 PIK3R1 Homo sapiens P27986
Peptide Array
17474147
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta NELFB VGNC VGNC:75243
Mus musculus NELFB MGD MGI:1931035
Bos taurus NELFB VGNC VGNC:54461
Canis familiaris NELFB VGNC VGNC:43737
Rattus norvegicus NELFB RGD RGD:1307832
Felis catus NELFB VGNC VGNC:63772