1. Gene
  2. GTF2F1 - general transcription factor IIF subunit 1 Gene

GTF2F1 - general transcription factor IIF subunit 1 Gene

中文名称:一般转录因子 IIF 亚基 1

种属: Homo sapiens

同用名: BTF4; RAP74; TF2F1; TFIIF

基因 ID: 2962 | 基因类型: protein coding

关于 GTF2F1

Cytogenetic location: 19p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 19:6,379,572-6,393,164 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants) and 211 orthologues. Ubiquitous expression in ovary (RPKM 36.8), testis (RPKM 30.9) and 25 other tissues.

功能概要

启用多种功能,包括 RNA 聚合酶 II 一般转录起始因子活性;磷酸酶激活剂活性;和启动子特异性染色质结合活性。参与多个过程,包括 RNA 聚合酶 II 对转录的正调控;对病毒的反应;和转录起始于 RNA 聚合酶 II 启动子。位于细胞连接处和核质中。转录因子 TFIID 复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables several functions, including RNA polymerase II general transcription initiation factor activity; Phosphatase activator activity; and promoter-specific chromatin binding activity. Involved in several processes, including positive regulation of transcription by RNA polymerase II; response to virus; and transcription initiation from RNA polymerase II promoter. Located in cell junction and nucleoplasm. Part of transcription factor TFIID complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

GTF2F1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_002096.3 NP_002087.2 general transcription factor IIF subunit 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
7929273 GOA
enables RNA polymerase II general transcription initiation factor binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8625415 GOA
enables phosphatase activator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
12721286 GOA
enables promoter-specific chromatin binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
24441171 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
7590250 GOA
enables protein domain specific binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15723517 GOA
enables protein phosphatase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12732728 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of protein binding IMP
IMP: 通过突变表型推断
8662660 GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
15351637 GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IMP
IMP: 通过突变表型推断
8662660 GOA
involved in response to virus IEP
IEP: 通过表达模式推断
16548883 GOA
involved in transcription elongation by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
15351637 GOA
involved in transcription initiation at RNA polymerase II promoter IDA
IDA: 通过直接分析推断
7929273 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IMP
IMP: 通过突变表型推断
15723517 GOA
part of protein-containing complex IMP
IMP: 通过突变表型推断
12732728 GOA
part of transcription factor TFIID complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
27193682 GOA
part of transcription factor TFIIF complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11183778 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

GTF2F1 蛋白结构

TFIIF_alpha

TFIIF_alpha: Transcription initiation factor IIF, alpha subunit (TFIIF-alpha) (3 - 517)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 517 a.a.
蛋白主名 其他名称

general transcription factor IIF subunit 1

TFIIF-alpha

GTF2F1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
TAP
24981860
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
Complementation
31467278
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
BRET
37398436
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
Lumier
37398436
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
MAPPIT
31467278
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
Y2H
7854423
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
SLC
31467278
种属内
GTF2F1 P35269 GTF2F2 Homo sapiens P13984
X-Ray Diffraction
11183778
种属内
GTF2F1 P35269 CTDP1 Homo sapiens Q9Y5B0
NMR
12732728
种属内
GTF2F1 P35269 URI1 Homo sapiens O94763
Far-WB
12737519
种属内
GTF2F1 P35269 URI1 Homo sapiens O94763
Anti Tag CoIP
12737519
种属内
GTF2F1 P35269 TAF1 Homo sapiens P21675
Anti Tag CoIP
7590250
种属内
GTF2F1 P35269 TAF1 Homo sapiens P21675
CoIP
7590250
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus GTF2F1 RGD RGD:1359646
Bos taurus GTF2F1 VGNC VGNC:97277
Canis familiaris GTF2F1 VGNC VGNC:41546
Macaca mulatta GTF2F1 VGNC VGNC:73309
Felis catus GTF2F1 VGNC VGNC:67497
Mus musculus GTF2F1 MGD MGI:1923848