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SNX12 - sorting nexin 12 Gene

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中文名称：排序 nexin 12

种属: Homo sapiens

基因 ID: 29934 | 基因类型: protein coding

关于 SNX12

Cytogenetic location: Xq13.1 Genomic coordinates (GRCh38): X:71,059,247-71,073,426 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants), 215 orthologues and 15 paralogues. Ubiquitous expression in kidney (RPKM 19.5), thyroid (RPKM 17.8) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码分选连接蛋白家族的一个成员。该家族的成员包含一个 phox (PX) 结构域，它是一个磷酸肌醇结合结构域，并参与细胞内运输。这种蛋白质不像某些家族成员那样包含卷曲螺旋区域。小鼠中的一种类似蛋白质可能参与调节神经突的生长。交替剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供，2012 年 1 月]

This gene encodes a member of the sorting nexin family. Members of this family contain a phox (PX) domain, which is a phosphoinositide binding domain, and are involved in intracellular trafficking. This protein does not contain a coiled coil region, like some family members. A similar protein in mouse may be involved in regulating the neurite outgrowth. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2012]

SNX12 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001256185.2 NP_001243114.1 sorting nexin-12 isoform 1
NM_001256186.2 NP_001243115.1 sorting nexin-12 isoform 2
NM_001256187.2 NP_001243116.1 sorting nexin-12 isoform 3
NM_001256188.2 NP_001243117.1 sorting nexin-12 isoform 4
NM_013346.4 NP_037478.2 sorting nexin-12 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables enzyme binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
22709416 GOA
enables phosphatidylinositol binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22719997 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17474147 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of early endosome to late endosome transport IDA
IDA: 通过直接分析推断
22719997 GOA
involved in negative regulation of gene expression IMP
IMP: 通过突变表型推断
22709416 GOA
involved in negative regulation of protein catabolic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
22719997 GOA
involved in negative regulation of protein processing IDA
IDA: 通过直接分析推断
22709416 GOA
involved in negative regulation of protein transport IDA
IDA: 通过直接分析推断
22719997 GOA
involved in regulation of endocytosis IMP
IMP: 通过突变表型推断
22709416 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in early endosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
22709416 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SNX12 蛋白结构

PX

PX: PX domain (28 - 148)

  • 0
  • 100
  • 162 a.a.
蛋白主名 其他名称

sorting nexin-12

SNX12 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SNX12 Q9UMY4 KLKB1 Homo sapiens P03952
Y2H Array
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 KLKB1 Homo sapiens P03952
Validated Y2H
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 KLKB1 Homo sapiens P03952
Y2H Pooling
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 CCT2 Homo sapiens P78371
Validated Y2H
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 CCT2 Homo sapiens P78371
Y2H Array
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 CCT2 Homo sapiens P78371
Y2H Pooling
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 NCK1 Homo sapiens P16333
Peptide Array
17474147
种属内
SNX12 Q9UMY4 ARL6IP1 Homo sapiens Q15041
Y2H Array
25416956
种属内
SNX12 Q9UMY4 LPL Homo sapiens P06858
Y2H Array
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 LPL Homo sapiens P06858
Validated Y2H
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 LPL Homo sapiens P06858
Y2H Pooling
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 PACSIN1 Homo sapiens Q9BY11
Validated Y2H
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 PACSIN1 Homo sapiens Q9BY11
Y2H Array
32814053
种属内
SNX12 Q9UMY4 PACSIN1 Homo sapiens Q9BY11
Y2H Pooling
32814053
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Pre-clinical Phase
生物活性分子 (1)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS13525 SNX12 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SNX12 RGD RGD:1565585
Felis catus SNX12 VGNC VGNC:65543
Bos taurus SNX12 VGNC VGNC:35093
Mus musculus SNX12 MGD MGI:1919331
Macaca mulatta SNX12 VGNC VGNC:77707
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