1. Gene
  2. PEF1 - penta-EF-hand domain containing 1 Gene

PEF1 - penta-EF-hand domain containing 1 Gene

中文名称:含 5-EF-手域 1

种属: Homo sapiens

同用名: ABP32; PEF1A

基因 ID: 553115 | 基因类型: protein coding

关于 PEF1

Cytogenetic location: 1p35.2 Genomic coordinates (GRCh38): 1:31,629,866-31,644,876 (from NCBI)

This gene has 8 transcripts (splice variants), 214 orthologues and 20 paralogues. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 29.9), placenta (RPKM 14.6) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码属于 penta-EF-hand 蛋白家族的钙结合蛋白。编码的蛋白质已显示与程序性细胞死亡 6 基因产物形成异二聚体,并可能调节其在 CA (2+) 信号传导中的功能。可变剪接导致多个转录本变体,并且已在 1 号染色体上鉴定出一个假基因。[RefSeq 提供,2010 年 5 月]

This gene encodes a calcium-binding protein belonging to the penta-EF-hand protein family. The encoded protein has been shown to form a heterodimer with the programmed cell death 6 gene product and may modulate its function in CA(2+) signaling. Alternative splicing results in multiple transcript variants and a pseudogene has been identified on chromosome 1.[provided by RefSeq, May 2010]

PEF1 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001359651.2 NP_001346580.1 peflin isoform 2
NM_012392.4 NP_036524.1 peflin isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables calcium-dependent protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
27716508 GOA
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
enables protein dimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11883899 GOA
enables protein heterodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11278427 GOA
enables ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
27716508 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in COPII vesicle coating IMP
IMP: 通过突变表型推断
27716508 GOA
involved in endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport IMP
IMP: 通过突变表型推断
27716508 GOA
involved in neural crest cell development IMP
IMP: 通过突变表型推断
27716508 GOA
involved in neural crest formation IMP
IMP: 通过突变表型推断
27716508 GOA
involved in positive regulation of protein monoubiquitination IMP
IMP: 通过突变表型推断
27716508 GOA
involved in response to calcium ion IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11278427 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of COPII vesicle coat IDA
IDA: 通过直接分析推断
27716508 GOA
part of Cul3-RING ubiquitin ligase complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
27716508 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
11278427 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

PEF1 蛋白结构

EF-hand_7

EF-hand_7: EF-hand domain pair (123 - 178)

EF-hand_7

EF-hand_7: EF-hand domain pair (186 - 278)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 284 a.a.
蛋白主名 其他名称

peflin

PEF protein with a long N-terminal hydrophobic domain

PEF1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PEF1 Q9UBV8 METTL15 Homo sapiens A6NJ78-4 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 METTL15 Homo sapiens A6NJ78-4 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KRTAP12-1 Homo sapiens P59990 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KRTAP12-1 Homo sapiens P59990 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 HEMK1 Homo sapiens Q9Y5R4 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CTAG1A Homo sapiens P78358 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CTAG1A Homo sapiens P78358 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 FAM168A Homo sapiens Q92567-2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 FAM168A Homo sapiens Q92567-2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KRTAP15-1 Homo sapiens Q3LI76 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KRTAP15-1 Homo sapiens Q3LI76 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 EIF4G1 Homo sapiens Q04637-9 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 EIF4G1 Homo sapiens Q04637-9 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 ANKRD10 Homo sapiens Q9NXR5-2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 ANKRD10 Homo sapiens Q9NXR5-2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 SMUG1 Homo sapiens Q53HV7-2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 SMUG1 Homo sapiens Q53HV7-2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 SOHLH1 Homo sapiens Q5JUK2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 SOHLH1 Homo sapiens Q5JUK2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KRTAP19-1 Homo sapiens Q8IUB9 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KRTAP19-1 Homo sapiens Q8IUB9 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 STH Homo sapiens Q8IWL8 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 STH Homo sapiens Q8IWL8 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 BAG4 Homo sapiens O95429 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 BAG4 Homo sapiens O95429 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 PDCD6 Homo sapiens O75340 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 PDCD6 Homo sapiens O75340 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 PDCD6 Homo sapiens O75340 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 PDCD6 Homo sapiens O75340 33961781
种属内
PEF1 Q9UBV8 PDCD6 Homo sapiens O75340 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 TFG Homo sapiens Q92734 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 TFG Homo sapiens Q92734 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 TFG Homo sapiens Q92734 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 AKAP8L Homo sapiens Q9ULX6 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 AKAP8L Homo sapiens Q9ULX6 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 AKAP8L Homo sapiens Q9ULX6 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 INCA1 Homo sapiens Q0VD86 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 INCA1 Homo sapiens Q0VD86 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CFAP68 Homo sapiens Q9H5F2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CFAP68 Homo sapiens Q9H5F2 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 19060904
种属内
PEF1 Q9UBV8 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 19060904
种属内
PEF1 Q9UBV8 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 16189514
种属内
PEF1 Q9UBV8 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 16189514
种属内
PEF1 Q9UBV8 KLHL12 Homo sapiens Q53G59 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CALCOCO2 Homo sapiens Q13137 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 EWSR1 Homo sapiens Q01844 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 HGS Homo sapiens O14964 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 HGS Homo sapiens O14964 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 SPG21 Homo sapiens Q9NZD8 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 SPG21 Homo sapiens Q9NZD8 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CEP55 Homo sapiens Q53EZ4 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 CEP55 Homo sapiens Q53EZ4 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CEP55 Homo sapiens Q53EZ4 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 CEP55 Homo sapiens Q53EZ4 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 CEP55 Homo sapiens Q53EZ4 25416956
种属内
PEF1 Q9UBV8 FOXR2 Homo sapiens Q6PJQ5 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 FOXR2 Homo sapiens Q6PJQ5 31515488
种属内
PEF1 Q9UBV8 FOXR2 Homo sapiens Q6PJQ5 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 BPIFA1 Homo sapiens Q9NP55 32296183
种属内
PEF1 Q9UBV8 BPIFA1 Homo sapiens Q9NP55 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

PEF1 抗体

目录号 产品名 应用 反应物种
HY-P81827 PEF1 Antibody (YA1572) WB, IP Human, Mouse, Rat

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus PEF1 VGNC VGNC:64110
Mus musculus PEF1 MGD MGI:1915148
Rattus norvegicus PEF1 RGD RGD:1359536
Bos taurus PEF1 VGNC VGNC:32739
Canis familiaris PEF1 VGNC VGNC:44412