1. Gene
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SH3RF1 - SH3 domain containing ring finger 1 Gene

中文名称:含 SH3 结构域的无名指 1

种属: Homo sapiens

同用名: POSH; RNF142; SH3MD2

基因 ID: 57630 | 基因类型: protein coding

关于 SH3RF1

Cytogenetic location: 4q32.3-q33 Genomic coordinates (GRCh38): 4:169,094,259-169,270,956 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 208 orthologues and 12 paralogues. Ubiquitous expression in thyroid (RPKM 11.9), stomach (RPKM 11.2) and 24 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质包含一个 N 末端环指、四个 SH3 结构域和一个与 Rho GTPase Rac 结合有关的区域。通过无名指,编码的蛋白质已被证明可以作为一种泛素-蛋白质连接酶参与跨高尔基体网络中的蛋白质分选。编码的蛋白质还可以作为 c-Jun N 末端激酶信号通路的支架,促进功能性信号模块的形成。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes a protein containing an N-terminus RING-finger, four SH3 domains, and a region implicated in binding of the Rho GTPase Rac. Via the RING-finger, the encoded protein has been shown to function as an ubiquitin-protein Ligase involved in protein sorting at the trans-Golgi network. The encoded protein may also act as a scaffold for the c-Jun N-terminal kinase signaling pathway, facilitating the formation of a functional signaling module. [provided by RefSeq, Jul 2008]

SH3RF1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_020870.4 NP_065921.2 E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
20696164 GOA
enables ubiquitin protein ligase activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
20696164 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of apoptotic process IMP
IMP: 通过突变表型推断
21586138 GOA
involved in negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process IMP
IMP: 通过突变表型推断
21586138 GOA
involved in negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
21586138 GOA
involved in protein autoubiquitination IMP
IMP: 通过突变表型推断
20696164 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytosol IDA
IDA: 通过直接分析推断
21586138 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SH3RF1 蛋白结构

zf-C3HC4

zf-C3HC4: Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) (12 - 52)

SH3_9

SH3_9: Variant SH3 domain (141 - 189)

SH3_9

SH3_9: Variant SH3 domain (203 - 255)

SH3_9

SH3_9: Variant SH3 domain (452 - 502)

SH3_9

SH3_9: Variant SH3 domain (837 - 886)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 888 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1

RING-type E3 ubiquitin transferase SH3RF1

SH3RF1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra SH3RF1 Q7Z6J0 YWHAE Homo sapiens P62258
Crosslink
36931259
Intra SH3RF1 Q7Z6J0 RAC1 Homo sapiens P63000
Y2H Pooling
20936779
Intra SH3RF1 Q7Z6J0 SIAH2 Homo sapiens O43255
Anti Tag CoIP
21586138
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta SH3RF1 VGNC VGNC:77259
Bos taurus SH3RF1 VGNC VGNC:34579
Mus musculus SH3RF1 MGD MGI:1913066
Felis catus SH3RF1 VGNC VGNC:65113
Canis familiaris SH3RF1 VGNC VGNC:46132
Rattus norvegicus SH3RF1 RGD RGD:735154