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RTKN - rhotekin Gene

中文名称:罗特金

种属: Homo sapiens

基因 ID: 6242 | 基因类型: protein coding

关于 RTKN

Cytogenetic location: 2p13.1 Genomic coordinates (GRCh38): 2:74,425,835-74,441,937 (from NCBI)

This gene has 11 transcripts (splice variants), 259 orthologues and 2 paralogues. Broad expression in kidney (RPKM 18.1), brain (RPKM 12.5) and 23 other tissues.

功能概要

该基因编码与 GTP 结合的 Rho 蛋白相互作用的支架蛋白。该蛋白的结合会抑制 Rho 蛋白的 GTPase 活性。这种蛋白质可能会干扰 RhoGAP 将活性 GTP 结合 Rho 转化为非活性 GDP 结合形式。 Rho 蛋白调节许多重要的细胞过程,包括胞质分裂、转录、平滑肌收缩、细胞生长和转化。 Rho 信号转导通路的失调与多种癌症有关。可变剪接导致编码不同异构体的多个转录变体。[RefSeq 提供,2008 年 7 月]

This gene encodes a scaffold protein that interacts with GTP-bound Rho proteins. Binding of this protein inhibits the GTPase activity of Rho proteins. This protein may interfere with the conversion of active, GTP-bound Rho to the inactive GDP-bound form by RhoGAP. Rho proteins regulate many important cellular processes, including cytokinesis, transcription, smooth muscle contraction, cell growth and transformation. Dysregulation of the Rho signal transduction pathway has been implicated in many forms of Cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

RTKN 基因产物(4)

mRNA Protein Name
NM_001015055.2 NP_001015055.1 rhotekin isoform a
NM_001015056.1 NP_001015056.1 rhotekin isoform c
NM_001410843.1 NP_001397772.1 rhotekin isoform d
NM_033046.2 NP_149035.1 rhotekin isoform b
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables GTPase inhibitor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
10940294 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10940294 GOA
enables small GTPase binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10940294 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in Rho protein signal transduction IDA
IDA: 通过直接分析推断
15480428 GOA
involved in regulation of apoptotic process IDA
IDA: 通过直接分析推断
15480428 GOA
involved in signal transduction IDA
IDA: 通过直接分析推断
10940294 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

RTKN 蛋白结构

Anillin

Anillin: Cell division protein anillin (116 - 270)

PH

PH: PH domain (313 - 412)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 563 a.a.
蛋白主名 其他名称

rhotekin

RTKN 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra RTKN Q9BST9 SORBS3 Homo sapiens O60504-2
Anti Bait CoIP
19294487
Intra RTKN Q9BST9 SORBS3 Homo sapiens O60504-2
Pull Down
19294487
Intra RTKN Q9BST9 RHOA Homo sapiens P61586
Pull Down
22621765
Intra RTKN Q9BST9 RHOA Homo sapiens P61586
Pull Down
18256687
Intra RTKN Q9BST9 RHOA Homo sapiens P61586
Pull Down
25150978
Intra RTKN Q9BST9 RHOA Homo sapiens P61586
Pull Down
22705156
Cross RTKN Q9BST9 Rhoa Mus musculus Q9QUI0
Pull Down
24525234
Cross RTKN Q9BST9 Rhoa Mus musculus Q9QUI0
Pull Down
18854161
Intra RTKN Q9BST9 SORBS3 Homo sapiens O60504
Anti Tag CoIP
19294487
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta RTKN VGNC VGNC:76943
Mus musculus RTKN MGD MGI:107371
Rattus norvegicus RTKN RGD RGD:727874
Canis familiaris RTKN VGNC VGNC:45789
Bos taurus RTKN VGNC VGNC:34197
Felis catus RTKN VGNC VGNC:64807