1. Gene
  2. ZBED1 - zinc finger BED-type containing 1 Gene

ZBED1 - zinc finger BED-type containing 1 Gene

中文名称:含锌指 BED 型 1

种属: Homo sapiens

同用名: ALTE; DREF; TRAMP; hDREF

基因 ID: 9189 | 基因类型: protein coding

关于 ZBED1

Cytogenetic location: Xp22.33 Genomic coordinates (GRCh38): X:2,486,435-2,500,976 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants), 117 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in kidney (RPKM 10.8), colon (RPKM 10.6) and 25 other tissues.

功能概要

该基因位于 X 和 Y 染色体的假常染色体区域 1 (PAR1) 。它早先被鉴定为与 Ac 转座因子具有相似性的基因,但被发现不具有转座酶活性。后来的研究表明,该基因产物位于细胞核中,并作为转录因子发挥作用。它与在几个与细胞增殖相关的基因启动子区域发现的 DNA 元件结合,例如组蛋白 H1,因此可能在调节与细胞增殖相关的基因中发挥作用。已发现该基因具有不同 5' 非翻译区的可变剪接转录物变体。[RefSeq 提供,2010 年 1 月]

This gene is located in the pseudoautosomal region 1 (PAR1) of X and Y chromosomes. It was earlier identified as a gene with similarity to Ac transposable elements, however, was found not to have transposase activity. Later studies show that this gene product is localized in the nucleus and functions as a transcription factor. It binds to DNA elements found in the promoter regions of several genes related to cell proliferation, such as histone H1, hence may have a role in regulating genes related to cell proliferation. Alternatively spliced transcript variants with different 5' untranslated region have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010]

ZBED1 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001171135.2 NP_001164606.1 E3 SUMO-protein ligase ZBED1
NM_001171136.2 NP_001164607.1 E3 SUMO-protein ligase ZBED1
NM_004729.4 NP_004720.1 E3 SUMO-protein ligase ZBED1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific IDA
IDA: 通过直接分析推断
17220279 GOA
enables RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
17220279 GOA
enables SUMO ligase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
27068747 GOA
enables SUMO transferase activity EXP
EXP: 通过实验结果推断
27068747 GOA
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17209048 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16713569 GOA
enables sequence-specific DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
23332764 GOA
enables sequence-specific double-stranded DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
28473536 GOA
enables transcription coactivator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
27068747 GOA
enables transcription coactivator activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
17209048 GOA
enables transcription coregulator activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
25210186 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation by host of viral genome replication IDA
IDA: 通过直接分析推断
25210186 GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
17220279 GOA
involved in protein autosumoylation IMP
IMP: 通过突变表型推断
27068747 GOA
involved in regulation of DNA-templated transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
25210186 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in PML body IDA
IDA: 通过直接分析推断
25210186 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
17209048 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

ZBED1 蛋白结构

zf-BED

zf-BED: BED zinc finger (23 - 72)

Dimer_Tnp_hAT

Dimer_Tnp_hAT: hAT family C-terminal dimerisation region (571 - 650)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 694 a.a.
蛋白主名 其他名称

E3 SUMO-protein ligase ZBED1

Ac-like transposable element

ZBED1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
ZBED1 O96006 a8k5h9_human Homo sapiens A8K5H9 25416956
种属内
ZBED1 O96006 a8k5h9_human Homo sapiens A8K5H9 25416956
种属内
ZBED1 O96006 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 25416956
种属内
ZBED1 O96006 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 25416956
种属内
ZBED1 O96006 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 32296183
种属内
ZBED1 O96006 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 32296183
种属内
ZBED1 O96006 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 25416956
种属内
ZBED1 O96006 UBE2I Homo sapiens Q7KZS0 32296183
种属内
ZBED1 O96006 LRRC20 Homo sapiens Q8TCA0 32296183
种属内
ZBED1 O96006 LRRC20 Homo sapiens Q8TCA0 25416956
种属内
ZBED1 O96006 GGACT Homo sapiens Q9BVM4 32296183
种属内
ZBED1 O96006 UCHL5 Homo sapiens Q9Y5K5 25416956
种属内
ZBED1 O96006 UCHL5 Homo sapiens Q9Y5K5 25416956
种属内
ZBED1 O96006 UCHL5 Homo sapiens Q9Y5K5 25416956
种属内
ZBED1 O96006 NCDN Homo sapiens Q9UBB6 32296183
种属内
ZBED1 O96006 CCDC13 Homo sapiens Q8IYE1 32296183
种属内
ZBED1 O96006 TRIML2 Homo sapiens Q8N7C3 32296183
种属内
ZBED1 O96006 PRKAA1 Homo sapiens Q13131 25416956
种属内
ZBED1 O96006 LCN2 Homo sapiens P80188 32296183
种属内
ZBED1 O96006 TRAPPC2 Homo sapiens P0DI81-3 32296183
种属内
ZBED1 O96006 FAM124B Homo sapiens Q9H5Z6-2 32296183
种属内
ZBED1 O96006 KIFC3 Homo sapiens Q9BVG8-5 32296183
种属内
ZBED1 O96006 SSX2 Homo sapiens Q16385 25416956
种属内
ZBED1 O96006 MPST Homo sapiens P25325 32296183
种属内
ZBED1 O96006 CDC37 Homo sapiens Q16543 32296183
种属内
ZBED1 O96006 PIAS2 Homo sapiens O75928 25416956
种属内
ZBED1 O96006 PIAS2 Homo sapiens O75928 25416956
种属内
ZBED1 O96006 PIAS2 Homo sapiens O75928 25416956
种属内
ZBED1 O96006 RIN1 Homo sapiens Q13671 32296183
种属内
ZBED1 O96006 CTNNAL1 Homo sapiens Q9UBT7 32296183
种属内
ZBED1 O96006 KDM1A Homo sapiens O60341
Y2H
21516116
种属内
ZBED1 O96006 POLE2 Homo sapiens P56282 32296183
种属内
ZBED1 O96006 PSAP Homo sapiens P07602 32296183
种属内
ZBED1 O96006 MKKS Homo sapiens Q9NPJ1 32296183
种属内
ZBED1 O96006 GORASP2 Homo sapiens Q9H8Y8 32296183
种属内
ZBED1 O96006 LNX1 Homo sapiens Q8TBB1 32296183
种属内
ZBED1 O96006 AIRIM Homo sapiens Q9NX04 25416956
种属内
ZBED1 O96006 EFHC1 Homo sapiens Q5JVL4 32296183
种属内
ZBED1 O96006 AIRIM Homo sapiens Q9NX04 32296183
种属内
ZBED1 O96006 AIRIM Homo sapiens Q9NX04 25416956
种属内
ZBED1 O96006 NTAQ1 Homo sapiens Q96HA8 32296183
种属内
ZBED1 O96006 FNDC11 Homo sapiens Q9BVV2 32296183
种属内
ZBED1 O96006 PAX6 Homo sapiens P26367 32296183
种属内
ZBED1 O96006 PAX6 Homo sapiens P26367 32296183
种属内
ZBED1 O96006 PAX6 Homo sapiens P26367 32296183
种属内
ZBED1 O96006 MAD2L2 Homo sapiens Q9UI95 32296183
种属内
ZBED1 O96006 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属内
ZBED1 O96006 TTC23 Homo sapiens Q5W5X9-3 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

重组 ZBED1 蛋白

目录号 产品名 蛋白编号 纯度
HY-P71047 ZBED1 Protein, Human (His) O96006 (N3-E100) ≥95%

关联疾病

疾病名称 别名
Fibrosclerosis Of Breast

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Breast Fibrosis

Sotos Syndrome 1

Sotos1

Sotos Syndrome, Type 1

Sotos' Syndrome

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

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Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

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