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CKAP5 - cytoskeleton associated protein 5 Gene

中文名称:细胞骨架相关蛋白 5

种属: Homo sapiens

同用名: TOG; MSPS; TOGp; CHTOG; ch-TOG

基因 ID: 9793 | 基因类型: protein coding

关于 CKAP5

Cytogenetic location: 11p11.2 Genomic coordinates (GRCh38): 11:46,743,048-46,846,280 (from NCBI)

This gene has 12 transcripts (splice variants) and 219 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 29.0), brain (RPKM 23.7) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码属于 TOG/XMAP215 家族的细胞骨架相关蛋白。该蛋白质的 N 端一半包含微管结合域,C 端一半包含用于结合微管蛋白二聚体的 KXGS 基序。这种蛋白质在纺锤体形成中有两个不同的作用;它保护着丝粒微管免于解聚,并在中心体微管组装中发挥重要作用。这种蛋白质可能是微管与细胞皮层正确相互作用以进行定向细胞运动所必需的。它还通过与与 MBP 相关的异质核核糖核蛋白 (hnRNP) A2 相互作用,在髓鞘碱性蛋白 (MBP) mRNA 的翻译中发挥作用。已经鉴定出编码不同亚型的选择性剪接转录物变体。[RefSeq 提供,2011 年 8 月]

This gene encodes a cytoskeleton-associated protein which belongs to the TOG/XMAP215 family. The N-terminal half of this protein contains a microtubule-binding domain and the C-terminal half contains a KXGS motif for binding tubulin dimers. This protein has two distinct roles in spindle formation; it protects kinetochore microtubules from depolymerization and plays an essential role in centrosomal microtubule assembly. This protein may be necessary for the proper interaction of microtubules with the cell cortex for directional cell movement. It also plays a role in translation of the myelin basic protein (MBP) mRNA by interacting with heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) A2, which associates with MBP. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Aug 2011]

CKAP5 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001008938.4 NP_001008938.1 cytoskeleton-associated protein 5 isoform a
NM_014756.4 NP_055571.2 cytoskeleton-associated protein 5 isoform b
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables microtubule binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
10770946 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11903063 GOA
enables ribonucleoprotein complex binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
15703215 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
acts upstream of or within centrosome cycle IMP
IMP: 通过突变表型推断
14718566 GOA
involved in centrosome cycle IMP
IMP: 通过突变表型推断
14718566 GOA
involved in establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity IMP
IMP: 通过突变表型推断
14718566 GOA
involved in positive regulation of microtubule nucleation IDA
IDA: 通过直接分析推断
26414402 GOA
involved in spindle organization IMP
IMP: 通过突变表型推断
14718566 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in centrosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
14718566 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
15703215 GOA
located in kinetochore IDA
IDA: 通过直接分析推断
25596274 GOA
colocalizes with microtubule plus-end IDA
IDA: 通过直接分析推断
21646404 GOA
part of protein-containing complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
18468998 GOA
located in spindle pole IDA
IDA: 通过直接分析推断
21646404 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

CKAP5 蛋白结构

CLASP_N

CLASP_N: CLASP N terminal (284 - 469)

CLASP_N

CLASP_N: CLASP N terminal (860 - 1042)

CLASP_N

CLASP_N: CLASP N terminal (1239 - 1421)

  • 0
  • 400
  • 800
  • 1200
  • 1600
  • 2032 a.a.
蛋白主名 其他名称

cytoskeleton-associated protein 5

colonic and hepatic tumor over-expressed gene protein

CKAP5 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CKAP5 Q14008 TACC3 Homo sapiens Q9Y6A5
Anti Bait CoIP
21297582
种属内
CKAP5 Q14008 TACC3 Homo sapiens Q9Y6A5
IF
21297582
种属内
CKAP5 Q14008 TACC3 Homo sapiens Q9Y6A5
Anti Tag CoIP
26496610
种属内
CKAP5 Q14008 TACC3 Homo sapiens Q9Y6A5
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
CKAP5 Q14008 TACC3 Homo sapiens Q9Y6A5
TAP
20360068
种属内
CKAP5 Q14008 NCK1 Homo sapiens P16333
Peptide Array
17474147
种属内
CKAP5 Q14008 SLAIN2 Homo sapiens Q9P270
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
CKAP5 Q14008 SLAIN2 Homo sapiens Q9P270
Anti Tag CoIP
26496610
种属内
CKAP5 Q14008 TACC1 Homo sapiens O75410
Pull Down
14603251
种属内
CKAP5 Q14008 TACC1 Homo sapiens O75410
Anti Tag CoIP
26496610
种属内
CKAP5 Q14008 TACC1 Homo sapiens O75410
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
CKAP5 Q14008 TACC1 Homo sapiens O75410-1
Anti Bait CoIP
14603251
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus CKAP5 MGD MGI:1923036
Felis catus CKAP5 VGNC VGNC:60912
Bos taurus CKAP5 VGNC VGNC:27383
Macaca mulatta CKAP5 VGNC VGNC:71368
Canis familiaris CKAP5 VGNC VGNC:39289
Rattus norvegicus CKAP5 RGD RGD:1563596