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HMG20A - high mobility group 20A Gene

中文名称:高机动性组别 20A

种属: Homo sapiens

同用名: HMGX1; HMGXB1

基因 ID: 10363 | 基因类型: protein coding

关于 HMG20A

Cytogenetic location: 15q24.3 Genomic coordinates (GRCh38): 15:77,420,888-77,520,050 (from NCBI)

This gene has 12 transcripts (splice variants), 206 orthologues and 20 paralogues. Ubiquitous expression in spleen (RPKM 13.0), testis (RPKM 10.4) and 25 other tissues.

功能概要

实现相同的蛋白质结合活性。预计参与基因表达的调控。预计在神经元分化的负调节上游或负调节内起作用;蛋白质苏木化的负调节; RNA 聚合酶 II 对转录的负调控。预计活跃于核心。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables identical protein binding activity. Predicted to be involved in regulation of gene expression. Predicted to act upstream of or within negative regulation of neuron differentiation; negative regulation of protein sumoylation; and negative regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

HMG20A 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001304504.2 NP_001291433.1 high mobility group protein 20A isoform a
NM_001304505.2 NP_001291434.1 high mobility group protein 20A isoform b
NM_018200.4 NP_060670.1 high mobility group protein 20A isoform a
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

HMG20A 蛋白结构

HMG_box

HMG_box: HMG (high mobility group) box (103 - 170)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 347 a.a.
蛋白主名 其他名称

high mobility group protein 20A

HMG box domain containing 1

HMG20A 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
HMG20A Q9NP66 CCDC136 Homo sapiens Q96JN2-2 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 CCDC136 Homo sapiens Q96JN2-2 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 FMNL1 Homo sapiens O95466-2 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 FMNL1 Homo sapiens O95466-2 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 FMNL1 Homo sapiens O95466-2 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 ADD1 Homo sapiens P35611-5 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 GPSM1 Homo sapiens Q86YR5-3 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 GPSM1 Homo sapiens Q86YR5-3 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 MORF4L1 Homo sapiens Q9UBU8-2 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 RSPH9 Homo sapiens Q9H1X1 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 RSPH9 Homo sapiens Q9H1X1 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 RSPH9 Homo sapiens Q9H1X1 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 PTH2R Homo sapiens P49190 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 PTH2R Homo sapiens P49190 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 FOXD4L1 Homo sapiens Q9NU39 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 PSORS1C2 Homo sapiens Q9UIG4 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 BACH2 Homo sapiens Q9BYV9 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 BACH2 Homo sapiens Q9BYV9 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 TCP11L1 Homo sapiens Q9NUJ3 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 PIAS2 Homo sapiens O75928-2 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 KPNA2 Homo sapiens P52292 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 RPP30 Homo sapiens P78346 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 RPP30 Homo sapiens P78346 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 RPP30 Homo sapiens P78346 31515488
种属内
HMG20A Q9NP66 HTT Homo sapiens P42858 23275563
种属内
HMG20A Q9NP66 HTT Homo sapiens P42858 23275563
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20B Homo sapiens Q9P0W2 26496610
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20B Homo sapiens Q9P0W2 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20B Homo sapiens Q9P0W2 33961781
种属内
HMG20A Q9NP66 USHBP1 Homo sapiens Q8N6Y0 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 USHBP1 Homo sapiens Q8N6Y0 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 DTNB Homo sapiens O60941 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 DTNB Homo sapiens O60941 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 HDAC2 Homo sapiens Q92769 33961781
种属内
HMG20A Q9NP66 HDAC1 Homo sapiens Q13547 33961781
种属内
HMG20A Q9NP66 HDAC2 Homo sapiens Q92769 28514442
种属内
HMG20A Q9NP66 HDAC1 Homo sapiens Q13547 26496610
种属内
HMG20A Q9NP66 HDAC1 Homo sapiens Q13547 28514442
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20A Homo sapiens Q9NP66 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 HDAC2 Homo sapiens Q92769 26496610
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20A Homo sapiens Q9NP66 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20A Homo sapiens Q9NP66 20211142
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20A Homo sapiens Q9NP66 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 HMG20A Homo sapiens Q9NP66 16189514
种属内
HMG20A Q9NP66 TESC Homo sapiens Q96BS2 16189514
种属内
HMG20A Q9NP66 LURAP1 Homo sapiens Q96LR2 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 LURAP1 Homo sapiens Q96LR2 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 DDIT4L Homo sapiens Q96D03 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 DDIT4L Homo sapiens Q96D03 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 CFAP53 Homo sapiens Q96M91 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 MAGOHB Homo sapiens Q96A72 16189514
种属内
HMG20A Q9NP66 SYTL4 Homo sapiens Q96C24 31515488
种属内
HMG20A Q9NP66 SYTL4 Homo sapiens Q96C24 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 RPRD1B Homo sapiens Q9NQG5 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 SCNM1 Homo sapiens Q9BWG6 31515488
种属内
HMG20A Q9NP66 SCNM1 Homo sapiens Q9BWG6 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 SCNM1 Homo sapiens Q9BWG6 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 SCNM1 Homo sapiens Q9BWG6 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 HPCAL1 Homo sapiens P37235 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 HPCAL1 Homo sapiens P37235 25416956
种属内
HMG20A Q9NP66 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 TBC1D22B Homo sapiens Q9NU19 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 RAD54L2 Homo sapiens Q9Y4B4 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 RAD54L2 Homo sapiens Q9Y4B4 32296183
种属内
HMG20A Q9NP66 RAD54L2 Homo sapiens Q9Y4B4 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus HMG20A RGD RGD:1564760
Mus musculus HMG20A MGD MGI:1914117
Bos taurus HMG20A VGNC VGNC:29873
Macaca mulatta HMG20A VGNC VGNC:73481
Canis familiaris HMG20A VGNC VGNC:41707
Felis catus HMG20A VGNC VGNC:67592