RRP1B - ribosomal RNA processing 1B Gene

中文名称：核糖体 RNA 加工 1B

种属: Homo sapiens

同用名: Nnp1; RRP1; NNP1L; KIAA0179; PPP1R136

基因 ID: 23076 | 基因类型: protein coding

关于 RRP1B

Cytogenetic location: 21q22.3 Genomic coordinates (GRCh38): 21:43,659,560-43,696,079 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants), 197 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in lymph node (RPKM 10.6), testis (RPKM 10.3) and 25 other tissues.

功能概要

启用转录共激活因子活性。参与多个过程，包括细胞对病毒的反应；宿主对病毒转录的正调控；和 RNA 聚合酶 II 对转录的正调控。位于染色体；粒状成分；和核质。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables transcription coactivator activity. Involved in several processes, including cellular response to virus; positive regulation by host of viral transcription; and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in chromosome; granular component; and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

RRP1B 基因产物(1)

mRNA	Protein	Name
NM_015056.3	NP_055871.1	ribosomal RNA processing protein 1 homolog B

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	19389623	GOA
enables transcription coactivator activity	IMP IMP: 通过突变表型推断	20040599	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in cellular response to virus	IDA IDA: 通过直接分析推断	26311876	GOA
involved in positive regulation by host of viral transcription	IMP IMP: 通过突变表型推断	26311876	GOA
involved in positive regulation of apoptotic process	IMP IMP: 通过突变表型推断	20040599	GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II	IMP IMP: 通过突变表型推断	20040599	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in granular component	IDA IDA: 通过直接分析推断	20926688	GOA
located in nucleolus	IDA IDA: 通过直接分析推断	20040599	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RRP1B 蛋白结构

Nop52

0
200
400
600
758 a.a.

蛋白主名

其他名称

ribosomal RNA processing protein 1 homolog B

RRP1-like protein B

RRP1B 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	RRP1B	Q14684	RRP1	Homo sapiens	P56182	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	PPP1CB	Homo sapiens	P62140	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	RPL27	Homo sapiens	P61353	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	PPP1CC	Homo sapiens	P36873	Density Sedimentation	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	PPP1CC	Homo sapiens	P36873	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	PPP1CA	Homo sapiens	P62136	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	RPL5	Homo sapiens	P46777	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	FBL	Homo sapiens	P22087	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	SRSF1	Homo sapiens	Q07955	Anti Bait CoIP	23604122
种属内	RRP1B	Q14684	SRSF1	Homo sapiens	Q07955	Confocal	23604122
种属内	RRP1B	Q14684	SRSF1	Homo sapiens	Q07955	Anti Tag CoIP	23604122
种属内	RRP1B	Q14684	SRSF1	Homo sapiens	Q07955	Anti Tag CoIP	20926688
种属内	RRP1B	Q14684	E2F1	Homo sapiens	Q01094	BiFC	20040599
种属内	RRP1B	Q14684	E2F1	Homo sapiens	Q01094	Anti Tag CoIP	20040599
种属内	RRP1B	Q14684	E2F1	Homo sapiens	Q01094	CH-IP	20040599
种属内	RRP1B	Q14684	E2F1	Homo sapiens	Q01094	Pull Down	20040599

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Microinvasive Gastric Cancer

Early Gastric Cancer

Surface Gastric Cancer

Laryngeal Squamous Cell Carcinoma

Epidermoid Carcinoma Of The Larynx	Squamous Cell Carcinoma Of Larynx
Squamous Cell Carcinoma Of The Larynx	Squamous Cell Carcinoma Of Head And Neck

Influenza

Flu	Influenza With Non-Respiratory Manifestation
Influenza With Other Manifestations	Influenza, Human
Influenza, Susceptibility To	Seasonal Influenza, Virus Identified

Osteogenesis Imperfecta, Type Xii

Osteogenesis Imperfecta Type 12	OI12
Osteogenesis Imperfecta Type Xii	Oi, Type Xii
Osteogenesis Imperfecta 12	Oi Type Xii
Oi-Xii	Osteogenesis Imperfecta Sillence Type Iii

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS12291	RRP1B Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Mus musculus	RRP1B	MGD	MGI:1919712
Canis familiaris	RRP1B	VGNC	VGNC:45766
Felis catus	RRP1B	VGNC	VGNC:64781
Macaca mulatta	RRP1B	VGNC	VGNC:77089
Rattus norvegicus	RRP1B	RGD	RGD:1305633
Bos taurus	RRP1B	VGNC	VGNC:34170

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