TRA2B - transformer 2 beta homolog Gene

中文名称：变形金刚 2 beta 同系物

种属: Homo sapiens

同用名: SFRS10; SRFS10; TRAN2B; PPP1R156; TRA2-BETA; Htra2-beta

基因 ID: 6434 | 基因类型: protein coding

关于 TRA2B

Cytogenetic location: 3q27.2 Genomic coordinates (GRCh38): 3:185,914,558-185,938,014 (from NCBI)

This gene has 15 transcripts (splice variants), 542 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 41.9), lymph node (RPKM 15.3) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码一种核蛋白，作为序列特异性丝氨酸/精氨酸剪接因子发挥作用，在 mRNA 加工、剪接模式和基因表达中发挥作用。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供，2011 年 8 月]

This gene encodes a nuclear protein which functions as sequence-specific serine/arginine splicing factor which plays a role in mRNA processing, splicing patterns, and gene expression. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2011]

TRA2B 基因产物(2)

mRNA	Protein	Name
NM_001243879.2	NP_001230808.1	transformer-2 protein homolog beta isoform 2
NM_004593.3	NP_004584.1	transformer-2 protein homolog beta isoform 1

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables RNA binding	IMP IMP: 通过突变表型推断	10749975	GOA
enables identical protein binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	10749975	GOA
enables identical protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	32296183	GOA
enables mRNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	12165565	GOA
enables pre-mRNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	25689357	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	10749975	GOA
enables protein domain specific binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	10749975	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in cellular response to glucose stimulus	IMP IMP: 通过突变表型推断	25689357	GOA
involved in mRNA splicing, via spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	9546399	GOA
involved in regulation of RNA splicing	IMP IMP: 通过突变表型推断	10749975	GOA
involved in regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	12165565	GOA
involved in regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome	IMP IMP: 通过突变表型推断	25689357	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	9546399	GOA
part of protein-containing complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	10749975	GOA
part of spliceosomal complex	IMP IMP: 通过突变表型推断	25689357	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

TRA2B 蛋白结构

RRM_1

0
100
200
288 a.a.

蛋白主名

其他名称

transformer-2 protein homolog beta

TRA-2 beta

TRA2B 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	TRA2B	P62995	PCDHB14	Homo sapiens	Q9Y5E9	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SRSF8	Homo sapiens	Q9BRL6-2	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SF3A2	Homo sapiens	Q15428	Affinity Chrom	17332742
种属内	TRA2B	P62995	YTHDC1	Homo sapiens	Q96MU7	Y2H	21988832
种属内	TRA2B	P62995	YTHDC1	Homo sapiens	Q96MU7	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	MYPOP	Homo sapiens	Q86VE0	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SRSF9	Homo sapiens	Q13242	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SRSF9	Homo sapiens	Q13242	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SRSF9	Homo sapiens	Q13242	Y2H Array	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SRSF1	Homo sapiens	Q07955	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SRPK2	Homo sapiens	P78362	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	EPM2AIP1	Homo sapiens	Q7L775	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	SRSF4	Homo sapiens	Q08170	Y2H	22365833
种属内	TRA2B	P62995	SRSF4	Homo sapiens	Q08170	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	CLK3	Homo sapiens	P49761	Y2H Array	32296183
种属内	TRA2B	P62995	CLK3	Homo sapiens	P49761	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	CLK3	Homo sapiens	P49761	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	TRA2B	P62995	MAGOHB	Homo sapiens	Q96A72	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	RBMY1F	Homo sapiens	Q15415	Validated Y2H	32296183
种属内	TRA2B	P62995	RBMY1F	Homo sapiens	Q15415	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	TRA2B	P62995	RBMY1F	Homo sapiens	Q15415	Y2H Array	32296183

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

重组 TRA2B 蛋白

目录号	产品名	蛋白编号	纯度
HY-P72056	TRA2B Protein, Human (Baculovirus, His-Myc)	P62995 (S2-Y288)	≥95%

关联疾病

疾病名称

别名

Spinal Muscular Atrophy

Sma	5q Sma
Proximal Sma	Sma-Associated Sma
Spinal Amyotrophies	Spinal Amyotrophy
Spinal Muscle Degeneration	Spinal Muscle Wasting
Muscular Atrophy Spinal	Atrophy, Muscular, Spinal
Hereditary Motor Neuronopathy	Progressive Muscular Atrophy
Sma - [Spinal Muscular Atrophy]

Muscular Atrophy

Muscle Wasting	Amyotrophia
Wasting - Muscle	Skeletal Muscle Atrophy

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS14962	TRA2B Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Canis familiaris	TRA2B	VGNC	VGNC:47759
Felis catus	TRA2B	VGNC	VGNC:66491
Bos taurus	TRA2B	VGNC	VGNC:36268
Macaca mulatta	TRA2B	VGNC	VGNC:78554
Rattus norvegicus	TRA2B	RGD	RGD:619886
Mus musculus	TRA2B	MGD	MGI:106016
Others	TRA2B	NCBI

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