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  3. CLK3 - CDC like kinase 3 Gene

CLK3 - CDC like kinase 3 Gene

  • 基因
  • 蛋白
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  • 直系同源

中文名称：CDC 样激酶 3

种属: Homo sapiens

同用名: PHCLK3; PHCLK3/152

基因 ID: 1198 | 基因类型: protein coding

关于 CLK3

Cytogenetic location: 15q24.1 Genomic coordinates (GRCh38): 15:74,608,372-74,630,201 (from NCBI)

This gene has 27 transcripts (splice variants), 625 orthologues and 12 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 16.0), testis (RPKM 5.8) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码属于丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶家族的蛋白质。该蛋白是一种核双特异性激酶，可调节富含丝氨酸/精氨酸 (SR) 的剪接因子家族的核内分布。已发现该基因的两个转录本变体编码不同的亚型。相关假基因位于 1 号和 9 号染色体上。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

This gene encodes a protein belonging to the serine/threonine type protein kinase family. This protein is a nuclear dual-specificity kinase that regulates the intranuclear distribution of the serine/arginine-rich (SR) family of splicing factors. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Related pseudogenes are located on chromosomes 1 and 9. [provided by RefSeq, Jul 2008]

CLK3 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001130028.2 NP_001123500.2 dual specificity protein kinase CLK3
NM_003992.5 NP_003983.2 dual specificity protein kinase CLK3
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in protein phosphorylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
9637771 GOA
involved in regulation of RNA splicing IDA
IDA: 通过直接分析推断
9637771 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
9637771 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

CLK3 蛋白结构

Pkinase

Pkinase: Protein kinase domain (304 - 620)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 500
  • 600
  • 638 a.a.
蛋白主名 其他名称

dual specificity protein kinase CLK3

CLK3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra CLK3 P49761 OAS2 Homo sapiens P29728
Y2H Array
25416956
Intra CLK3 P49761 OAS2 Homo sapiens P29728
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra CLK3 P49761 OAS2 Homo sapiens P29728
Y2H Array
31515488
Intra CLK3 P49761 HOXB7 Homo sapiens P09629
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 HOXB7 Homo sapiens P09629
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra CLK3 P49761 SUV39H1 Homo sapiens O43463
Y2H
23455924
Intra CLK3 P49761 SUV39H1 Homo sapiens O43463
Anti Tag CoIP
23455924
Intra CLK3 P49761 HSP90AB1 Homo sapiens P08238
Lumier
22939624
Intra CLK3 P49761 HSP90AB1 Homo sapiens P08238
Pull Down
32707033
Intra CLK3 P49761 SRSF10 Homo sapiens O75494
Anti Tag CoIP
33961781
Intra CLK3 P49761 YWHAE Homo sapiens P62258
Crosslink
36931259
Intra CLK3 P49761 SRSF3 Homo sapiens P84103
Anti Tag CoIP
33961781
Intra CLK3 P49761 RNPS1 Homo sapiens Q15287
Anti Tag CoIP
33961781
Intra CLK3 P49761 RNPS1 Homo sapiens Q15287
Pull Down
32707033
Intra CLK3 P49761 SRPK2 Homo sapiens P78362
Anti Tag CoIP
33961781
Intra CLK3 P49761 SRPK2 Homo sapiens P78362
Protein Kinase Assay
23602568
Intra CLK3 P49761 SRPK2 Homo sapiens P78362
Pull Down
32707033
Intra CLK3 P49761 TINF2 Homo sapiens Q9BSI4
Pull Down
21044950
Intra CLK3 P49761 TRA2B Homo sapiens P62995
Anti Tag CoIP
33961781
Intra CLK3 P49761 TRA2B Homo sapiens P62995
TAP
23602568
Intra CLK3 P49761 TRA2B Homo sapiens P62995
Pull Down
32707033
Intra CLK3 P49761 SDCBP Homo sapiens O00560
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 SDCBP Homo sapiens O00560
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra CLK3 P49761 HOXB6 Homo sapiens P17509
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 RBMX Homo sapiens P38159
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra CLK3 P49761 RBMX Homo sapiens P38159
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 ZNF263 Homo sapiens O14978
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 CLK2 Homo sapiens P49760
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 CLK2 Homo sapiens P49760
Y2H Array
25416956
Intra CLK3 P49761 RSRP1 Homo sapiens Q9BUV0
Y2H Array
25416956
Intra CLK3 P49761 RSRP1 Homo sapiens Q9BUV0
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 RSRP1 Homo sapiens Q9BUV0
Y2H Pooling
16189514
Intra CLK3 P49761 CLK2 Homo sapiens P49760
Anti Tag CoIP
33961781
Intra CLK3 P49761 CLK2 Homo sapiens P49760
Y2H
21516116
Intra CLK3 P49761 CLK2 Homo sapiens P49760
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra CLK3 P49761 RSRP1 Homo sapiens Q9BUV0
Y2H Array
31515488
Intra CLK3 P49761 CLASRP Homo sapiens Q8N2M8
Pull Down
32707033
Intra CLK3 P49761 RBMY1A1 Homo sapiens P0DJD3
Y2H Prey Pooling
25416956
Intra CLK3 P49761 RBMY1A1 Homo sapiens P0DJD3
Y2H Array
25416956
Intra CLK3 P49761 RBMY1A1 Homo sapiens P0DJD3
Validated Y2H
25416956
Intra CLK3 P49761 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Validated Y2H
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Clinical Phase
生物活性分子 (1)
目录号 产品名 作用方式
纯度 Phase
HY-137443 Ipivivint Inhibitor 99.65% Phase 1
Pre-clinical Phase
生物活性分子 (9)
Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-115470 CLK-IN-T3 Inhibitor 98.63% 否
HY-112296 T025 98.84% 否
HY-15951 ML167 Inhibitor 98.62% 否
HY-12828 KH-CB19 Inhibitor 99.31% 否
HY-103647 K00546 Inhibitor 98.08% 否
HY-117049 Leucettine L41 Inhibitor 98.70% 否
HY-12828A KH-CB20 Inhibitor 99.80% 否
HY-155723 Leucettinib-92 Inhibitor / 否
HY-RS02818 CLK3 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Felis catus CLK3 VGNC VGNC:60964
Rattus norvegicus CLK3 RGD RGD:621259
Mus musculus CLK3 MGD MGI:1098670
Canis familiaris CLK3 VGNC VGNC:39348
Bos taurus CLK3 VGNC VGNC:27450
Macaca mulatta CLK3 VGNC VGNC:71260
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