1. Gene
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RNPS1 - RNA binding protein with serine rich domain 1 Gene

中文名称:具有富丝氨酸结构域 1 的 RNA 结合蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: E5.1

基因 ID: 10921 | 基因类型: protein coding

关于 RNPS1

Cytogenetic location: 16p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 16:2,253,116-2,268,126 (from NCBI)

This gene has 26 transcripts (splice variants) and 252 orthologues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 25.4), testis (RPKM 24.3) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质是参与 mRNA 核输出和 mRNA 监视的剪接后多蛋白复合物的一部分。 mRNA 监测检测具有截短开放阅读框的输出 mRNA,并启动无义介导的 mRNA 衰变 (NMD) 。当翻译在最后一个外显子-外显子连接处的上游结束时,这会触发 NMD 降解含有过早终止密码子的 mRNA。这种蛋白质与 mRNA 结合并在核输出后保持结合,充当核质穿梭蛋白。这种蛋白质含有许多丝氨酸残基。已发现该基因编码不同亚型的几种转录变体。[RefSeq 提供,2013 年 11 月]

This gene encodes a protein that is part of a post-splicing multiprotein complex involved in both mRNA nuclear export and mRNA surveillance. mRNA surveillance detects exported mRNAs with truncated open reading frames and initiates nonsense-mediated mRNA decay (NMD). When translation ends upstream from the last exon-exon junction, this triggers NMD to degrade mRNAs containing premature stop codons. This protein binds to the mRNA and remains bound after nuclear export, acting as a nucleocytoplasmic shuttling protein. This protein contains many serine residues. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2013]

RNPS1 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001286625.1 NP_001273554.1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 isoform a
NM_001286626.2 NP_001273555.1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 isoform b
NM_001286627.2 NP_001273556.1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 isoform c
NM_006711.5 NP_006702.1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 isoform a
NM_080594.4 NP_542161.1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 isoform a
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
NOT enables RNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22388736 GOA
enables mRNA 3'-UTR binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
11546874 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11477570 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of ASAP complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
12665594 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
11546874 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
11546874 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

RNPS1 蛋白结构

RRM_1

RRM_1: RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) (165 - 234)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 305 a.a.
蛋白主名 其他名称

RNA-binding protein with serine-rich domain 1

RNA binding protein with serine-rich domain

RNPS1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
Intra RNPS1 Q15287 ZNF394 Homo sapiens Q53GI3
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF394 Homo sapiens Q53GI3
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF394 Homo sapiens Q53GI3
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 FAM81B Homo sapiens Q96LP2
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 FAM81B Homo sapiens Q96LP2
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 FAM81B Homo sapiens Q96LP2
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 PSTPIP1 Homo sapiens O43586
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 PSTPIP1 Homo sapiens O43586
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF286A Homo sapiens Q9HBT8
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF286A Homo sapiens Q9HBT8
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF286A Homo sapiens Q9HBT8
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZSCAN30 Homo sapiens Q86W11
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZSCAN30 Homo sapiens Q86W11
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZSCAN30 Homo sapiens Q86W11
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF660 Homo sapiens Q6AZW8
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF660 Homo sapiens Q6AZW8
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF660 Homo sapiens Q6AZW8
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF41 Homo sapiens P51814-6
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF41 Homo sapiens P51814-6
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 TRA2A Homo sapiens Q13595
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RNPS1 Q15287 TRA2A Homo sapiens Q13595
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 TRA2A Homo sapiens Q13595
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF345 Homo sapiens Q14585
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF345 Homo sapiens Q14585
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 CCNL1 Homo sapiens Q9UK58
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 CCNL1 Homo sapiens Q9UK58
Anti Tag CoIP
26496610
Intra RNPS1 Q15287 CCNL1 Homo sapiens Q9UK58
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 CCNL1 Homo sapiens Q9UK58
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 YTHDC1 Homo sapiens Q96MU7
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 YTHDC1 Homo sapiens Q96MU7
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 YTHDC1 Homo sapiens Q96MU7
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF9 Homo sapiens Q13242
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF9 Homo sapiens Q13242
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF10 Homo sapiens O75494
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RNPS1 Q15287 SRSF10 Homo sapiens O75494
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF10 Homo sapiens O75494
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF3 Homo sapiens P84103
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF3 Homo sapiens P84103
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRRM4 Homo sapiens A7MD48
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRRM4 Homo sapiens A7MD48
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 NKAPD1 Homo sapiens Q6ZUT1
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 NKAPD1 Homo sapiens Q6ZUT1
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 NKAPD1 Homo sapiens Q6ZUT1
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ACIN1 Homo sapiens Q9UKV3
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RNPS1 Q15287 ACIN1 Homo sapiens Q9UKV3
Y2H
22365833
Intra RNPS1 Q15287 SRSF7 Homo sapiens Q16629
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF7 Homo sapiens Q16629
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRSF7 Homo sapiens Q16629
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZRANB1 Homo sapiens Q9UGI0
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZRANB1 Homo sapiens Q9UGI0
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZRANB1 Homo sapiens Q9UGI0
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRPK1 Homo sapiens Q96SB4
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RNPS1 Q15287 SRPK1 Homo sapiens Q96SB4
Anti Tag CoIP
23602568
Intra RNPS1 Q15287 SRPK1 Homo sapiens Q96SB4
Anti Bait CoIP
17353931
Intra RNPS1 Q15287 HEXIM2 Homo sapiens Q96MH2
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 GOLGA6L9 Homo sapiens A6NEM1
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 GOLGA6L9 Homo sapiens A6NEM1
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRPK2 Homo sapiens P78362
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRPK2 Homo sapiens P78362
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SRPK2 Homo sapiens P78362
Anti Bait CoIP
17353931
Intra RNPS1 Q15287 SRPK2 Homo sapiens P78362
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RNPS1 Q15287 STX11 Homo sapiens O75558
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 STX11 Homo sapiens O75558
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF165 Homo sapiens P49910
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ZNF165 Homo sapiens P49910
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ELOA2 Homo sapiens Q8IYF1
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ELOA2 Homo sapiens Q8IYF1
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 ELOA2 Homo sapiens Q8IYF1
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SDCBP2 Homo sapiens Q9H190
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SDCBP2 Homo sapiens Q9H190
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SDCBP2 Homo sapiens Q9H190
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 SDCBP2 Homo sapiens Q9H190
Y2H Array
31515488
Intra RNPS1 Q15287 SRSF6 Homo sapiens Q13247
Anti Tag CoIP
33961781
Intra RNPS1 Q15287 CLK3 Homo sapiens P49761
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 CLK3 Homo sapiens P49761
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 CLK3 Homo sapiens P49761
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 CLK2 Homo sapiens P49760
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 CLK2 Homo sapiens P49760
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5
Validated Y2H
32296183
Intra RNPS1 Q15287 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Y2H Prey Pooling
32296183
Intra RNPS1 Q15287 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Y2H Array
32296183
Intra RNPS1 Q15287 RBMY1F Homo sapiens Q15415
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Metaphyseal Chondrodysplasia, Schmid Type

MCDS

Schmid Metaphyseal Chondrodysplasia

Metaphyseal Chondrodysplasia Schmid Type

Spondylometaphyseal Dysplasia, Japanese Type

Japanese Type Spondylometaphyseal Dysplasia

Schmid Type Metaphyseal Dysplasia

Metaphyseal Chondrodysplasia Type Schmid

Schmid Type Metaphyseal Chondrodysplasia

SMCD

Chondrodysplasia, Metaphyseal, Schmid Type

Corneal Dystrophy, Subepithelial Mucinous

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus RNPS1 RGD RGD:1307522
Canis familiaris RNPS1 VGNC VGNC:45683
Mus musculus RNPS1 MGD MGI:97960
Felis catus RNPS1 VGNC VGNC:80680