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SUPT4H1 - SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit Gene

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中文名称：SPT4 同系物，DSIF 延伸因子亚单位

种属: Homo sapiens

同用名: SPT4; SPT4H; SUPT4H; Supt4a

基因 ID: 6827 | 基因类型: protein coding

关于 SUPT4H1

Cytogenetic location: 17q22 Genomic coordinates (GRCh38): 17:58,345,178-58,352,201 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants) and 214 orthologues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 34.4), brain (RPKM 26.3) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 DRB (5,6-dichloro-1-beta-d-ribofuranosylbenzimidazole) 敏感性诱导因子 (DSIF) 复合体的小亚基，该复合体通过 RNA 聚合酶 II 调节 mRNA 加工和转录延伸。编码的蛋白质定位于细胞核并与大亚基 (SUPT5H) 相互作用形成 DSIF 复合物。已在 2 号和 12 号染色体上鉴定出相关的假基因。已发现该基因的可变剪接转录物变体。[RefSeq 提供，2012 年 11 月]

This gene encodes the small subunit of DRB (5,6-dichloro-1-beta-d-ribofuranosylbenzimidazole) sensitivity-inducing factor (DSIF) complex, which regulates mRNA processing and transcription elongation by RNA polymerase II. The encoded protein is localized to the nucleus and interacts with the large subunit (SUPT5H) to form the DSIF complex. Related pseudogenes have been identified on chromosomes 2 and 12. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2012]

SUPT4H1 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_003168.3 NP_003159.1 transcription elongation factor SPT4
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10075709 GOA
enables protein heterodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
9450929 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of DNA-templated transcription, elongation IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
involved in negative regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
involved in positive regulation of DNA-templated transcription, elongation IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
involved in regulation of transcription elongation by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
involved in transcription elongation by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of DSIF complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
part of DSIF complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19860741 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
9450929 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

SUPT4H1 蛋白结构

Spt4

Spt4: Spt4/RpoE2 zinc finger (13 - 90)

  • 0
  • 100
  • 117 a.a.
蛋白主名 其他名称

transcription elongation factor SPT4

DRB sensitivity-inducing factor 14 kDa subunit

SUPT4H1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SUPT4H1 P63272 SUPT5H Homo sapiens O00267
Far-WB
10075709
种属内
SUPT4H1 P63272 SUPT5H Homo sapiens O00267
Validated Y2H
27107012
种属内
SUPT4H1 P63272 SUPT5H Homo sapiens O00267
Y2H Array
31515488
种属内
SUPT4H1 P63272 SUPT5H Homo sapiens O00267
BFG-2H
27107012
种属内
SUPT4H1 P63272 SUPT5H Homo sapiens O00267
Y2H Array
25502805
种属内
SUPT4H1 P63272 SUPT5H Homo sapiens O00267
Anti Tag CoIP
10075709
种属内
SUPT4H1 P63272 SUPT5H Homo sapiens O00267
SLC
27107012
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

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Cat. No. 产品名 作用方式
纯度 是否罕见病
HY-RS14037 SUPT4H1 Human Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Sets / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
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