USP4 - ubiquitin specific peptidase 4 Gene

中文名称：泛素特异性肽酶 4

种属: Homo sapiens

同用名: UNP; Unph

基因 ID: 7375 | 基因类型: protein coding

关于 USP4

Cytogenetic location: 3p21.31 Genomic coordinates (GRCh38): 3:49,277,144-49,340,053 (from NCBI)

This gene has 14 transcripts (splice variants), 140 orthologues and 71 paralogues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 15.1), bone marrow (RPKM 14.6) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质是一种蛋白酶，可使目标蛋白质 (如 ADORA2A 和 TRIM21) 去泛素化。编码的蛋白质在细胞核和细胞质之间穿梭，并参与维持内质网的操作保真度。已发现该基因的三个转录变体编码不同的亚型。[RefSeq 提供，2011 年 10 月]

The protein encoded by this gene is a protease that deubiquitinates target proteins such as ADORA2A and TRIM21. The encoded protein shuttles between the nucleus and cytoplasm and is involved in maintaining operational fidelity in the endoplasmic reticulum. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011]

USP4 基因产物(3)

mRNA	Protein	Name
NM_001251877.2	NP_001238806.1	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 isoform c
NM_003363.4	NP_003354.2	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 isoform a
NM_199443.3	NP_955475.1	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 isoform b

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables adenosine receptor binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	16339847	GOA
enables cysteine-type deubiquitinase activity	IDA IDA: 通过直接分析推断	16316627	GOA
enables identical protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	22001210	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	11461834	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in negative regulation of protein ubiquitination	IMP IMP: 通过突变表型推断	16472766	GOA
involved in positive regulation of TORC1 signaling	IDA IDA: 通过直接分析推断	30514904	GOA
involved in protein deubiquitination	IDA IDA: 通过直接分析推断	16316627	GOA
involved in protein deubiquitination	IMP IMP: 通过突变表型推断	20595234	GOA
involved in protein localization to cell surface	IDA IDA: 通过直接分析推断	16339847	GOA
involved in regulation of protein stability	IDA IDA: 通过直接分析推断	16472766	GOA
involved in spliceosomal tri-snRNP complex assembly	IMP IMP: 通过突变表型推断	20595234	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in cytoplasm	IDA IDA: 通过直接分析推断	16316627	GOA
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	16339847	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

USP4 蛋白结构

DUSP

Ubiquitin_3

UCH

0
200
400
600
800
963 a.a.

蛋白主名

其他名称

ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4

deubiquitinating enzyme 4

USP4 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	USP4	Q13107	ADORA2A	Homo sapiens	P29274	Anti Tag CoIP	16339847
种属内	USP4	Q13107	RIPK1	Homo sapiens	Q13546	Anti Bait CoIP	23313255
种属内	USP4	Q13107	RIPK1	Homo sapiens	Q13546	Anti Tag CoIP	23313255
种属内	USP4	Q13107	HUWE1	Homo sapiens	Q7Z6Z7	Anti Bait CoIP	21522127
种属内	USP4	Q13107	MEPCE	Homo sapiens	Q7L2J0	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	USP4	Q13107	EDC3	Homo sapiens	Q96F86	Anti Tag CoIP	19615732
种属内	USP4	Q13107	USP4	Homo sapiens	Q13107	GMS	22001210
种属内	USP4	Q13107	EDC3	Homo sapiens	Q96F86	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	USP4	Q13107	PRPF3	Homo sapiens	O43395	Anti Tag CoIP	19615732
种属内	USP4	Q13107	TUT1	Homo sapiens	Q9H6E5	Anti Tag CoIP	19615732
种属内	USP4	Q13107	PRPF4	Homo sapiens	O43172	Anti Tag CoIP	19615732
种属内	USP4	Q13107	USP4	Homo sapiens	Q13107	NMR	22001210
种属内	USP4	Q13107	DCP1B	Homo sapiens	Q8IZD4	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	USP4	Q13107	MEPCE	Homo sapiens	Q7L2J0	Anti Tag CoIP	19615732
种属内	USP4	Q13107	PRPF3	Homo sapiens	O43395	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	USP4	Q13107	TUT1	Homo sapiens	Q9H6E5	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	USP4	Q13107	PRPF4	Homo sapiens	O43172	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	USP4	Q13107	USP11	Homo sapiens	P51784	Anti Tag CoIP	33961781
种属内	USP4	Q13107	DCP1B	Homo sapiens	Q8IZD4	Anti Tag CoIP	19615732

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Oculopharyngeal Muscular Dystrophy

OPMD	Muscular Dystrophy, Oculopharyngeal
Dystrophy, Oculopharyngeal Muscular	Oculopharyngeal Dystrophy
Progressive Muscular Dystrophy, Oculopharyngeal Type	Muscular Dystrophy Oculopharyngeal
Dystrophy, Muscular, Oculopharyngeal

Trichorhinophalangeal Syndrome, Type I

Trichorhinophalangeal Dysplasia Type I	TRPS1
Trichorhinophalangeal Syndrome Type I	Trps I
Trichorhinophalangeal Syndrome Type 1	Type I Trichorhinophalangeal Syndrome
Giedion Syndrome	Trp Syndrome
Tricho-Rhino-Phalangeal Syndrome 1	Trichorhinophalangeal Syndrome, Type Iii

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-13814	PR-619		99.38%	否
HY-103435	Vialinin A	Inhibitor	99.89%	否
HY-RS15551	USP4 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Felis catus	USP4	VGNC	VGNC:66886
Bos taurus	USP4	VGNC	VGNC:36729
Macaca mulatta	USP4	VGNC	VGNC:78416
Rattus norvegicus	USP4	RGD	RGD:1587387
Mus musculus	USP4	MGD	MGI:98905
Canis familiaris	USP4	VGNC	VGNC:48195
Others	USP4	NCBI

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