1. Gene
  2. CD53 - CD53 molecule Gene

CD53 - CD53 molecule Gene

中文名称:CD53 分子

种属: Homo sapiens

同用名: MOX44; TSPAN25

基因 ID: 963 | 基因类型: protein coding

关于 CD53

Cytogenetic location: 1p13.3 Genomic coordinates (GRCh38): 1:110,871,210-110,899,922 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants), 223 orthologues and 32 paralogues. Biased expression in lymph node (RPKM 181.8), appendix (RPKM 156.6) and 12 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是跨膜 4 超家族的成员,也称为四跨膜蛋白家族。这些成员中的大多数是细胞表面蛋白,其特征在于存在四个疏水结构域。这些蛋白质介导在细胞发育、活化、生长和运动的调节中起作用的信号转导事件。这种编码的蛋白质是已知与整合素复合的细胞表面糖蛋白。它有助于 T 细胞和自然杀伤细胞中 CD2 生成信号的转导,并被认为在生长调节中发挥作用。该基因的家族性缺陷与免疫缺陷有关,这种免疫缺陷与由细菌、真菌和病毒引起的复发性传染病有关。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供,2016 年 3 月]

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is a cell surface glycoprotein that is known to complex with integrins. It contributes to the transduction of CD2-generated signals in T cells and natural killer cells and has been suggested to play a role in growth regulation. Familial deficiency of this gene has been linked to an immunodeficiency associated with recurrent infectious diseases caused by bacteria, fungi and viruses. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2016]

CD53 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_000560.4 NP_000551.1 leukocyte surface antigen CD53 isoform 1
NM_001040033.2 NP_001035122.1 leukocyte surface antigen CD53 isoform 1
NM_001320638.2 NP_001307567.1 leukocyte surface antigen CD53 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables identical protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
32296183 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21930792 GOA
enables protein-membrane adaptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
35767951 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in receptor clustering IDA
IDA: 通过直接分析推断
35767951 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in immunological synapse IDA
IDA: 通过直接分析推断
21930792 GOA
is active in plasma membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
28487417 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

CD53 蛋白结构

Tetraspannin

Tetraspannin: Tetraspanin family (9 - 210)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 219 a.a.
蛋白主名 其他名称

leukocyte surface antigen CD53

CD53 antigen

CD53 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CD53 P19397 LSMEM1 Homo sapiens Q8N8F7
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 SMAGP Homo sapiens Q0VAQ4
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 RPRM Homo sapiens Q9NS64
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM128 Homo sapiens Q5BJH2-2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM237 Homo sapiens Q96Q45-2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM237 Homo sapiens Q96Q45-2
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM237 Homo sapiens Q96Q45-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 ARL13B Homo sapiens Q3SXY8
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 ARL13B Homo sapiens Q3SXY8
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 ARL13B Homo sapiens Q3SXY8
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 GPR108 Homo sapiens Q9NPR9
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 GPX8 Homo sapiens Q8TED1
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 GPX8 Homo sapiens Q8TED1
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 GPX8 Homo sapiens Q8TED1
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 STX2 Homo sapiens P32856-2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 STX2 Homo sapiens P32856-2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 STX2 Homo sapiens P32856-2
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 AIG1 Homo sapiens Q9NVV5-2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 SNORC Homo sapiens Q6UX34
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CLEC7A Homo sapiens Q9BXN2-6
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TRAM1L1 Homo sapiens Q8N609
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CTXN3 Homo sapiens Q4LDR2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 LPAR3 Homo sapiens Q9UBY5
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 C1QL4 Homo sapiens Q86Z23
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 C1QL4 Homo sapiens Q86Z23
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM97 Homo sapiens Q5BJF2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 VSTM1 Homo sapiens Q6UX27-3
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM229B Homo sapiens Q8NBD8
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TSPO2 Homo sapiens Q5TGU0
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 COL4A5 Homo sapiens P29400-2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CLDN19 Homo sapiens Q8N6F1-2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 MS4A3 Homo sapiens Q96HJ5
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 MS4A3 Homo sapiens Q96HJ5
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 MS4A3 Homo sapiens Q96HJ5
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 ASGR2 Homo sapiens P07307-3
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 ASGR2 Homo sapiens P07307-3
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 CNIH2 Homo sapiens Q6PI25
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 SLC35A1 Homo sapiens P78382
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 ST6GAL2 Homo sapiens Q96JF0-2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 GPR152 Homo sapiens Q8TDT2
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 GPR152 Homo sapiens Q8TDT2
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 GPR152 Homo sapiens Q8TDT2
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 CD302 Homo sapiens Q8IX05
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 MUC1 Homo sapiens P15941-11
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 MUC1 Homo sapiens P15941-11
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 KIR3DL3 Homo sapiens Q8N743
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 KIR3DL3 Homo sapiens Q8N743
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 KIR3DL3 Homo sapiens Q8N743
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 GJA8 Homo sapiens P48165
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 GJA8 Homo sapiens P48165
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 GJA8 Homo sapiens P48165
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 EFNA5 Homo sapiens P52803
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 FAM209A Homo sapiens Q5JX71
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 FAM209A Homo sapiens Q5JX71
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 FAM209A Homo sapiens Q5JX71
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 GET1 Homo sapiens O00258
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 GET1 Homo sapiens O00258
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM86B Homo sapiens Q8N661
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CYBC1 Homo sapiens Q9BQA9
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CYBC1 Homo sapiens Q9BQA9
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 CYBC1 Homo sapiens Q9BQA9
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 UBIAD1 Homo sapiens Q9Y5Z9
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 LHFPL5 Homo sapiens Q8TAF8
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM140 Homo sapiens Q9NV12
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 PMP22 Homo sapiens Q01453
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 TMEM60 Homo sapiens Q9H2L4
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 NKG7 Homo sapiens Q16617
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 SAR1A Homo sapiens Q9NR31
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 SAR1A Homo sapiens Q9NR31
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 SAR1A Homo sapiens Q9NR31
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 MAL Homo sapiens P21145
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 EMP1 Homo sapiens P54849
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CLCN7 Homo sapiens P51798
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 SLC7A14 Homo sapiens Q8TBB6
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 SLC7A14 Homo sapiens Q8TBB6
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 SLC7A14 Homo sapiens Q8TBB6
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 PLP2 Homo sapiens Q04941
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 GIMAP5 Homo sapiens Q96F15
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 ccsb orf id: 13502 Homo sapiens EBI-23641393
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 PLN Homo sapiens P26678
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CREB3L1 Homo sapiens Q96BA8
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 CREB3L1 Homo sapiens Q96BA8
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 CREB3L1 Homo sapiens Q96BA8
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 BIK Homo sapiens Q13323
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 BIK Homo sapiens Q13323
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 BIK Homo sapiens Q13323
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 ERG28 Homo sapiens Q9UKR5
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 IGFBP5 Homo sapiens P24593
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 ATP6V0C Homo sapiens P27449
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 CLDN7 Homo sapiens O95471
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 CLDN7 Homo sapiens O95471
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 SMIM3 Homo sapiens Q9BZL3
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 BCL2L13 Homo sapiens Q9BXK5
Y2H Array
32296183
种属内
CD53 P19397 BCL2L13 Homo sapiens Q9BXK5
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
CD53 P19397 BCL2L13 Homo sapiens Q9BXK5
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 IFITM3 Homo sapiens Q01628
Validated Y2H
32296183
种属内
CD53 P19397 BTN2A2 Homo sapiens Q8WVV5
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

CD53 抗体

目录号 产品名 应用 反应物种
HY-P81370 CD53 Antibody (YA1115) IHC-P Human

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus CD53 VGNC VGNC:27039
Felis catus CD53 VGNC VGNC:60633
Canis familiaris CD53 VGNC VGNC:38964
Rattus norvegicus CD53 RGD RGD:2310
Macaca mulatta CD53 VGNC VGNC:70771
Mus musculus CD53 MGD MGI:88341
Macaca fascicularis CD53 NCBI NCBI:102127943
Others CD53 NCBI