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YOD1 - YOD1 deubiquitinase Gene

中文名称:YOD1 去泛素化酶

种属: Homo sapiens

同用名: DUBA8; OTUD2; PRO0907

基因 ID: 55432 | 基因类型: protein coding

关于 YOD1

Cytogenetic location: 1q32.1 Genomic coordinates (GRCh38): 1:207,043,849-207,053,116 (from NCBI)

This gene has 2 transcripts (splice variants) and 201 orthologues. Broad expression in bone marrow (RPKM 24.5), esophagus (RPKM 15.7) and 23 other tissues.

功能概要

蛋白质泛素化控制许多细胞内过程,包括细胞周期进程、转录激活和信号转导。这个动态过程涉及泛素结合酶和去泛素化酶,添加和去除泛素。去泛素化酶是半胱氨酸蛋白酶,可特异性地从泛素缀合的蛋白质底物上切割泛素。该基因编码的蛋白质属于以卵巢肿瘤 (OTU) 结构域为特征的 DUB 亚家族。可变剪接导致多个转录本变体。[RefSeq 提供,2013 年 1 月]

Protein ubiquitination controls many intracellular processes, including cell cycle progression, transcriptional activation, and signal transduction. This dynamic process, involving ubiquitin conjugating Enzymes and deubiquitinating Enzymes, adds and removes ubiquitin. Deubiquitinating Enzymes are cysteine proteases that specifically cleave ubiquitin from ubiquitin-conjugated protein substrates. The protein encoded by this gene belongs to a DUB subfamily characterized by an ovarian tumor (OTU) domain. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2013]

YOD1 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001276320.2 NP_001263249.1 ubiquitin thioesterase OTU1 isoform 2
NM_018566.4 NP_061036.3 ubiquitin thioesterase OTU1 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables K48-linked deubiquitinase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
21376232 GOA
enables cysteine-type deubiquitinase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
19818707 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
19818707 GOA
enables ubiquitin protein ligase binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
24068323 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in ERAD pathway IMP
IMP: 通过突变表型推断
19818707 GOA
involved in endoplasmic reticulum unfolded protein response IMP
IMP: 通过突变表型推断
19818707 GOA
involved in macroautophagy IMP
IMP: 通过突变表型推断
27753622 GOA
involved in negative regulation of retrograde protein transport, ER to cytosol IMP
IMP: 通过突变表型推断
24068323 GOA
involved in protein K11-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
23827681 GOA
involved in protein K11-linked deubiquitination IMP
IMP: 通过突变表型推断
24068323 GOA
involved in protein K27-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
23827681 GOA
involved in protein K29-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
23827681 GOA
involved in protein K33-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
23827681 GOA
involved in protein K48-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
19818707 GOA
involved in protein K48-linked deubiquitination IMP
IMP: 通过突变表型推断
24068323 GOA
involved in protein K63-linked deubiquitination IDA
IDA: 通过直接分析推断
19818707 GOA
involved in protein K63-linked deubiquitination IMP
IMP: 通过突变表型推断
24068323 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
27753622 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

YOD1 蛋白结构

OTU

OTU: OTU-like cysteine protease (155 - 254)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 348 a.a.
蛋白主名 其他名称

ubiquitin thioesterase OTU1

DUBA-8

YOD1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TP53BP2 Homo sapiens Q05BL1 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TP53BP2 Homo sapiens Q05BL1 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 LMO2 Homo sapiens P25791-3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 LMO2 Homo sapiens P25791-3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 FAM168A Homo sapiens Q92567-2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 FAM168A Homo sapiens Q92567-2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 FAM168A Homo sapiens Q92567-2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 ZFP57 Homo sapiens Q9NU63-3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 ZFP57 Homo sapiens Q9NU63-3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 ZFP57 Homo sapiens Q9NU63-3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RFC2 Homo sapiens P35250-2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RFC2 Homo sapiens P35250-2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 UBXN6 Homo sapiens Q9BZV1 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 UBXN6 Homo sapiens Q9BZV1 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 UBXN6 Homo sapiens Q9BZV1 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TRIM8 Homo sapiens Q9BZR9 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TRIM8 Homo sapiens Q9BZR9 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 SPART Homo sapiens Q8N0X7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 SPART Homo sapiens Q8N0X7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 SPART Homo sapiens Q8N0X7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 NGRN Homo sapiens Q9NPE2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 NGRN Homo sapiens Q9NPE2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 NGRN Homo sapiens Q9NPE2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 UBC Homo sapiens P0CG48 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 UBC Homo sapiens P0CG48 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RNF5 Homo sapiens Q99942 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RNF5 Homo sapiens Q99942 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RNF5 Homo sapiens Q99942 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 VCP Homo sapiens P55072 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 VCP Homo sapiens P55072 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TRAF6 Homo sapiens Q9Y4K3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TRAF6 Homo sapiens Q9Y4K3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TRAF6 Homo sapiens Q9Y4K3 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 MKRN1 Homo sapiens Q9UHC7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 MKRN1 Homo sapiens Q9UHC7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 MKRN1 Homo sapiens Q9UHC7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PLEKHB2 Homo sapiens Q96CS7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PLEKHB2 Homo sapiens Q96CS7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PLEKHB2 Homo sapiens Q96CS7 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PSMA7 Homo sapiens O14818 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PSMA7 Homo sapiens O14818 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TBX22 Homo sapiens Q9Y458 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TBX22 Homo sapiens Q9Y458 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 TBX22 Homo sapiens Q9Y458 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 INCA1 Homo sapiens Q0VD86 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 INCA1 Homo sapiens Q0VD86 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RNF216 Homo sapiens Q9NWF9 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RNF216 Homo sapiens Q9NWF9 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 RNF216 Homo sapiens Q9NWF9 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 DDIT4L Homo sapiens Q96D03 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 DDIT4L Homo sapiens Q96D03 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 DDIT4L Homo sapiens Q96D03 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PLSCR4 Homo sapiens Q9NRQ2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PLSCR4 Homo sapiens Q9NRQ2 32296183
种属内
YOD1 Q5VVQ6 PLSCR4 Homo sapiens Q9NRQ2 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus YOD1 MGD MGI:2442596
Canis familiaris YOD1 VGNC VGNC:48496
Rattus norvegicus YOD1 RGD RGD:1359726
Macaca mulatta YOD1 VGNC VGNC:79471
Bos taurus YOD1 VGNC VGNC:37033
Others YOD1 NCBI