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SUMO3 - small ubiquitin like modifier 3 Gene

中文名称:小泛素样修饰符 3

种属: Homo sapiens

同用名: SMT3A; Smt3B; SMT3H1; SUMO-3

基因 ID: 6612 | 基因类型: protein coding

关于 SUMO3

Cytogenetic location: 21q22.3 Genomic coordinates (GRCh38): 21:44,805,617-44,818,062 (from NCBI)

This gene has 6 transcripts (splice variants), 221 orthologues and 3 paralogues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 42.6), bone marrow (RPKM 40.3) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码真核蛋白小泛素相关修饰物 (SUMO) 家族的成员。编码的蛋白质通过称为苏木化的翻译后修饰与其他蛋白质共价结合。 Sumoylation 可能在多种细胞过程中发挥作用,包括核转运、DNA 复制和修复、有丝分裂、转录调节和信号转导。已经描述了编码不同蛋白质的可变剪接转录物变体。[RefSeq 提供,2014 年 2 月]

This gene encodes a member of the small ubiquitin-related modifier (SUMO) family of eukaryotic proteins. The encoded protein is covalently conjugated to Other proteins via a post-translation modification known as sumoylation. Sumoylation may play a role in a wide variety of cellular processes, including nuclear transport, DNA replication and repair, mitosis, transcriptional regulation, and signal transduction. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct proteins have been described. [provided by RefSeq, Feb 2014]

SUMO3 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001286416.2 NP_001273345.1 small ubiquitin-related modifier 3 isoform 2
NM_006936.3 NP_008867.2 small ubiquitin-related modifier 3 isoform 1 precursor
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
17000644 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
16626738 GOA
involved in protein sumoylation IDA
IDA: 通过直接分析推断
11889051 GOA
involved in regulation of protein localization to nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
19050011 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in PML body IDA
IDA: 通过直接分析推断
19050011 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
21965678 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SUMO3 蛋白结构

Rad60-SLD

Rad60-SLD: Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like (17 - 85)

  • 0
  • 103 a.a.
蛋白主名 其他名称

small ubiquitin-related modifier 3

SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 1

SUMO3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SUMO3 P55854 CARM1 Homo sapiens Q86X55
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SUMO3 P55854 USPL1 Homo sapiens Q5W0Q7
Enzymatic Study
22878415
种属内
SUMO3 P55854 USPL1 Homo sapiens Q5W0Q7
Pull Down
22878415
种属内
SUMO3 P55854 USPL1 Homo sapiens Q5W0Q7
Y2H Fragment Pooling
35914814
种属内
SUMO3 P55854 ZBTB33 Homo sapiens Q86T24
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZBTB33 Homo sapiens Q86T24
Validated Y2H
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZBTB33 Homo sapiens Q86T24
Y2H Array
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ATXN2 Homo sapiens Q99700-5
Y2H Pooling
32814053
种属内
SUMO3 P55854 ATXN2 Homo sapiens Q99700-5
Validated Y2H
32814053
种属内
SUMO3 P55854 ATXN2 Homo sapiens Q99700-5
Y2H Array
32814053
种属内
SUMO3 P55854 SART1 Homo sapiens O43290
Affinity Chrom
17000644
种属内
SUMO3 P55854 SENP2 Homo sapiens Q9HC62
Anti Tag CoIP
33961781
种属内
SUMO3 P55854 SENP2 Homo sapiens Q9HC62
Y2H Array
25416956
种属内
SUMO3 P55854 SENP2 Homo sapiens Q9HC62
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
SUMO3 P55854 ZNF496 Homo sapiens Q96IT1
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZNF496 Homo sapiens Q96IT1
Validated Y2H
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZNF496 Homo sapiens Q96IT1
Y2H Array
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZCCHC12 Homo sapiens Q6PEW1
Y2H Fragment Pooling
35914814
种属内
SUMO3 P55854 ZCCHC12 Homo sapiens Q6PEW1
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZCCHC12 Homo sapiens Q6PEW1
Validated Y2H
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZCCHC12 Homo sapiens Q6PEW1
Y2H Array
32296183
种属内
SUMO3 P55854 SP100 Homo sapiens P23497
Affinity Chrom
17000644
种属内
SUMO3 P55854 ZBTB39 Homo sapiens O15060
Y2H Prey Pooling
32296183
种属内
SUMO3 P55854 ZBTB39 Homo sapiens O15060
Y2H Array
32296183
种属间
SUMO3 P55854 RPS27A Bos taurus P62990
Pull Down
21857666
种属间
SUMO3 P55854 RPS27A Bos taurus P62990
Comigration in SDS
21857666
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

重组 SUMO3 蛋白

目录号 产品名 蛋白编号 纯度
HY-P71346 SUMO3 Protein, Human (HEK293, His) P55854 (S2-G92) ≥95%

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus SUMO3 MGD MGI:1336201
Rattus norvegicus SUMO3 RGD RGD:1561022
Bos taurus SUMO3 VGNC VGNC:56237