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CNOT8 - CCR4-NOT transcription complex subunit 8 Gene

中文名称:CCR4-NOT 转录复合物亚基 8

种属: Homo sapiens

同用名: CAF1; POP2; CALIF; Caf1b; hCAF1

基因 ID: 9337 | 基因类型: protein coding

关于 CNOT8

Cytogenetic location: 5q33.2 Genomic coordinates (GRCh38): 5:154,858,249-154,876,792 (from NCBI)

This gene has 25 transcripts (splice variants), 209 orthologues and 1 paralogue. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 22.1), lymph node (RPKM 19.7) and 25 other tissues.

功能概要

启用聚 (A) 特异性核糖核酸酶活性。参与去腺苷酸化 mRNA 的外切核酸分解代谢和细胞群增殖的正调控。位于核内。 CCR4-NOT 复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables poly(A)-specific ribonuclease activity. Involved in exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA and positive regulation of cell population proliferation. Located in nucleus. Part of CCR4-NOT complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

CNOT8 基因产物(9)

mRNA Protein Name
NM_001301073.2 NP_001288002.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 1
NM_001301074.2 NP_001288003.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 2
NM_001301075.2 NP_001288004.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 3
NM_001301077.2 NP_001288006.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 3
NM_001301080.2 NP_001288009.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 3
NM_001301082.1 NP_001288011.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 3
NM_001301083.1 NP_001288012.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 3
NM_001301086.2 NP_001288015.1 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 4
NM_004779.6 NP_004770.4 CCR4-NOT transcription complex subunit 8 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables 3'-5'-RNA exonuclease activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
15769875 GOA
enables poly(A)-specific ribonuclease activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
15769875 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
10637334 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in miRNA-mediated gene silencing by mRNA destabilization IDA
IDA: 通过直接分析推断
20065043 GOA
involved in positive regulation of cell population proliferation IMP
IMP: 通过突变表型推断
19605561 GOA
involved in positive regulation of mRNA catabolic process IMP
IMP: 通过突变表型推断
22977175 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of CCR4-NOT complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
19558367 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
9820826 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

CNOT8 蛋白结构

CAF1

CAF1: CAF1 family ribonuclease (14 - 239)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 292 a.a.
蛋白主名 其他名称

CCR4-NOT transcription complex subunit 8

CAF1-like protein

CNOT8 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CNOT8 Q9UFF9 BTG1 Homo sapiens Q6IBC8
Validated Y2H
25416956
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT6L Homo sapiens Q96LI5
Anti Tag CoIP
17452450
种属内
CNOT8 Q9UFF9 BTG2 Homo sapiens P78543
Validated Y2H
25416956
种属内
CNOT8 Q9UFF9 BTG2 Homo sapiens P78543
Y2H
11136725
种属内
CNOT8 Q9UFF9 BTG2 Homo sapiens P78543
Pull Down
11136725
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT1 Homo sapiens A5YKK6
Anti Bait CoIP
16778766
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT1 Homo sapiens A5YKK6
Anti Bait CoIP
17353931
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT1 Homo sapiens A5YKK6
Anti Tag CoIP
22977175
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT1 Homo sapiens A5YKK6
Y2H
10637334
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT6 Homo sapiens Q9ULM6
Y2H
11747467
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT6 Homo sapiens Q9ULM6
Anti Tag CoIP
17452450
种属内
CNOT8 Q9UFF9 TOB2 Homo sapiens Q14106
Y2H Array
25416956
种属内
CNOT8 Q9UFF9 BTG1 Homo sapiens P62324
Pull Down
11136725
种属内
CNOT8 Q9UFF9 BTG1 Homo sapiens P62324
Y2H Array
31515488
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT2 Homo sapiens Q9NZN8
Anti Bait CoIP
16778766
种属内
CNOT8 Q9UFF9 CNOT3 Homo sapiens O75175
Anti Bait CoIP
16778766
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Macaca mulatta CNOT8 VGNC VGNC:71391
Mus musculus CNOT8 MGD MGI:1916375
Bos taurus CNOT8 VGNC VGNC:27523
Rattus norvegicus CNOT8 RGD RGD:1306401
Felis catus CNOT8 VGNC VGNC:68960
Canis familiaris CNOT8 VGNC VGNC:39419