1. Gene
  2. CLK1 - CDC like kinase 1 Gene

CLK1 - CDC like kinase 1 Gene

中文名称:CDC 样激酶 1

种属: Homo sapiens

同用名: CLK; STY; CLK/STY

基因 ID: 1195 | 基因类型: protein coding

关于 CLK1

Cytogenetic location: 2q33.1 Genomic coordinates (GRCh38): 2:200,853,009-200,864,658 (from NCBI)

This gene has 14 transcripts (splice variants), 185 orthologues and 12 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 96.5), lymph node (RPKM 51.9) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码双特异性蛋白激酶类 CDC2 (或 LAMMER) 家族的成员。在细胞核中,编码的蛋白质磷酸化参与 pre-mRNA 加工的富含丝氨酸/精氨酸的蛋白质,将它们释放到核质中。 pre-mRNA 加工过程中剪接位点的选择可能受交易因子浓度的调节,包括富含丝氨酸/精氨酸的蛋白质。因此,编码的蛋白质可能在控制剪接位点选择中发挥间接作用。已发现该基因编码不同异构体的多个转录变体。[RefSeq 提供,2009 年 6 月]

This gene encodes a member of the CDC2-like (or LAMMER) family of dual specificity protein kinases. In the nucleus, the encoded protein phosphorylates serine/arginine-rich proteins involved in pre-mRNA processing, releasing them into the nucleoplasm. The choice of splice sites during pre-mRNA processing may be regulated by the concentration of transacting factors, including serine/arginine rich proteins. Therefore, the encoded protein may play an indirect role in governing splice site selection. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2009]

CLK1 基因产物(5)

mRNA Protein Name
NM_001162407.1 NP_001155879.1 dual specificity protein kinase CLK1 isoform 2
NM_004071.4 NP_004062.2 dual specificity protein kinase CLK1 isoform 1
NR_027856.2
NR_027855.2
NM_001024646.1
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
25416956 GOA
enables protein serine/threonine kinase activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
10480872 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in regulation of RNA splicing IMP
IMP: 通过突变表型推断
19168442 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

CLK1 蛋白结构

Pkinase

Pkinase: Protein kinase domain (161 - 477)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 400
  • 484 a.a.
蛋白主名 其他名称

dual specificity protein kinase CLK1

CDC28/CDC2-like kinase

protein tyrosine kinase STY

CLK1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
CLK1 P49759 KRTAP10-7 Homo sapiens P60409
Y2H Prey Pooling
25416956
种属内
CLK1 P49759 PDE9A Homo sapiens O76083
Validated Y2H
25416956
种属内
CLK1 P49759 PDE9A Homo sapiens O76083
Y2H Prey Pooling
25416956
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus CLK1 MGD MGI:107403
Rattus norvegicus CLK1 RGD RGD:1311469
Felis catus CLK1 VGNC VGNC:60963
Bos taurus CLK1 VGNC VGNC:27448
Macaca mulatta CLK1 VGNC VGNC:71258
Canis familiaris CLK1 VGNC VGNC:39346
Others CLK1 NCBI