NUDT21 - nudix hydrolase 21 Gene

中文名称：nudix 水解酶 21

种属: Homo sapiens

同用名: CPSF5; CFIM25

基因 ID: 11051 | 基因类型: protein coding

关于 NUDT21

Cytogenetic location: 16q13 Genomic coordinates (GRCh38): 16:56,429,133-56,451,332 (from NCBI)

This gene has 7 transcripts (splice variants) and 230 orthologues. Ubiquitous expression in brain (RPKM 30.7), ovary (RPKM 29.1) and 25 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是 3' RNA 切割和聚腺苷酸化加工所需的切割因子的一个亚基。蛋白质与 RNA 的相互作用是组装 3' 端加工复合物的最早步骤之一，并促进其他加工因子的募集。该基因编码由四个多肽组成的蛋白质复合物的 25kD 亚基。[RefSeq 提供，2008 年 7 月]

The protein encoded by this gene is one subunit of a cleavage factor required for 3' RNA cleavage and polyadenylation processing. The interaction of the protein with the RNA is one of the earliest steps in the assembly of the 3' end processing complex and facilitates the recruitment of Other processing factors. This gene encodes the 25kD subunit of the protein complex, which is composed of four polypeptides. [provided by RefSeq, Jul 2008]

NUDT21 基因产物(1)

mRNA	Protein	Name
NM_007006.3	NP_008937.1	cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
contributes to RNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	8626397	GOA
enables histone deacetylase binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	17172643	GOA
enables identical protein binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	20695905	GOA
enables identical protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	16189514	GOA
enables mRNA 3'-UTR AU-rich region binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	20479262	GOA
enables mRNA binding	IDA IDA: 通过直接分析推断	21295486	GOA
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	11716503	GOA
enables protein homodimerization activity	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	20479262	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in co-transcriptional mRNA 3'-end processing, cleavage and polyadenylation pathway	IDA IDA: 通过直接分析推断	29276085	GOA
involved in mRNA 3'-end processing	IDA IDA: 通过直接分析推断	15937220	GOA
involved in mRNA alternative polyadenylation	IMP IMP: 通过突变表型推断	17098938	GOA
involved in mRNA processing	IDA IDA: 通过直接分析推断	8626397	GOA
involved in protein heterotetramerization	IDA IDA: 通过直接分析推断	23187700	GOA
involved in protein tetramerization	IDA IDA: 通过直接分析推断	21295486	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in cytoplasm	IDA IDA: 通过直接分析推断	19864460	GOA
part of mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	23187700	GOA
part of mRNA cleavage factor complex	IDA IDA: 通过直接分析推断	20695905	GOA
part of mRNA cleavage factor complex	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	20695905	GOA
located in nucleus	IDA IDA: 通过直接分析推断	19864460	GOA
located in paraspeckles	IDA IDA: 通过直接分析推断	15169763	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

NUDT21 蛋白结构

NUDIX_2

0
100
200
227 a.a.

蛋白主名

其他名称

cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5

CPSF 25 kDa subunit

NUDT21 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-1	X-Ray Diffraction	21295486
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-1	Ion Exchange Chrom	21295486
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-1	Pull Down	21295486
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-1	GMS	21295486
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-2	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-2	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-2	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630-2	Anti Tag CoIP	26496610
种属内	NUDT21	O43809	TEPSIN	Homo sapiens	Q96N21	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TEPSIN	Homo sapiens	Q96N21	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TEPSIN	Homo sapiens	Q96N21	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	IKZF1	Homo sapiens	Q13422-7	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	IKZF1	Homo sapiens	Q13422-7	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	IKZF1	Homo sapiens	Q13422-7	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CPSF7	Homo sapiens	Q8N684-3	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CPSF7	Homo sapiens	Q8N684-3	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CPSF7	Homo sapiens	Q8N684-3	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	SPAG8	Homo sapiens	Q99932-2	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	SPAG8	Homo sapiens	Q99932-2	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	SPAG8	Homo sapiens	Q99932-2	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	PSPC1	Homo sapiens	Q8WXF1-2	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	S100PBP	Homo sapiens	Q96BU1	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	S100PBP	Homo sapiens	Q96BU1	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	S100PBP	Homo sapiens	Q96BU1	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CARM1	Homo sapiens	Q86X55	Y2H	23455924
种属内	NUDT21	O43809	KRT75	Homo sapiens	O95678	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	KRT75	Homo sapiens	O95678	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	KRT75	Homo sapiens	O95678	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	MYL6	Homo sapiens	P60660	Y2H Array	31515488
种属内	NUDT21	O43809	MYL6	Homo sapiens	P60660	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630	Pull Down	22960638
种属内	NUDT21	O43809	NUDT21	Homo sapiens	O43809	X-Ray Diffraction	20479262
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630	Anti Bait CoIP	22960638
种属内	NUDT21	O43809	NUDT21	Homo sapiens	O43809	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	NUDT21	Homo sapiens	O43809	Y2H Array	25416956
种属内	NUDT21	O43809	CPSF6	Homo sapiens	Q16630	Y2H Pooling	16189514
种属内	NUDT21	O43809	NUDT21	Homo sapiens	O43809	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	NUDT21	Homo sapiens	O43809	Y2H Pooling	16189514
种属内	NUDT21	O43809	NUDT21	Homo sapiens	O43809	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	ZRANB1	Homo sapiens	Q9UGI0	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	ZRANB1	Homo sapiens	Q9UGI0	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	ZRANB1	Homo sapiens	Q9UGI0	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	GOLGA2	Homo sapiens	Q08379	Validated Y2H	25416956
种属内	NUDT21	O43809	ZNF655	Homo sapiens	Q8N720	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	ZNF655	Homo sapiens	Q8N720	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	ZNF655	Homo sapiens	Q8N720	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	FAM90A1	Homo sapiens	Q86YD7	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Validated Y2H	25416956
种属内	NUDT21	O43809	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TRIM27	Homo sapiens	P14373	Y2H Array	25416956
种属内	NUDT21	O43809	TRIM23	Homo sapiens	P36406	Y2H Array	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TRIM23	Homo sapiens	P36406	Y2H Prey Pooling	32296183
种属内	NUDT21	O43809	TRIM23	Homo sapiens	P36406	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	NTAQ1	Homo sapiens	Q96HA8	Validated Y2H	32296183
种属内	NUDT21	O43809	GFAP	Homo sapiens	P14136	Validated Y2H	32814053
种属内	NUDT21	O43809	GFAP	Homo sapiens	P14136	Y2H Array	32814053
种属内	NUDT21	O43809	GFAP	Homo sapiens	P14136	Y2H Pooling	32814053
种属内	NUDT21	O43809	CPSF7	Homo sapiens	Q8N684	Y2H Pooling	16189514
种属内	NUDT21	O43809	CPSF7	Homo sapiens	Q8N684	Validated Y2H	25416956
种属内	NUDT21	O43809	CPSF7	Homo sapiens	Q8N684	Y2H Prey Pooling	25416956
种属内	NUDT21	O43809	ATXN1	Homo sapiens	P54253	Y2H Array	16713569
种属内	NUDT21	O43809	ATXN1	Homo sapiens	P54253	Validated Y2H	32814053
种属内	NUDT21	O43809	ATXN1	Homo sapiens	P54253	Y2H Pooling	32814053
种属内	NUDT21	O43809	ATXN1	Homo sapiens	P54253	Y2H Array	32814053

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-RS09669	NUDT21 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Bos taurus	NUDT21	VGNC	VGNC:32336
Rattus norvegicus	NUDT21	RGD	RGD:1305766
Macaca mulatta	NUDT21	VGNC	VGNC:99533
Mus musculus	NUDT21	MGD	MGI:1915469
Felis catus	NUDT21	VGNC	VGNC:97541

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