RBM39 - RNA binding motif protein 39 Gene

中文名称：RNA 结合基序蛋白 39

种属: Homo sapiens

同用名: HCC1; CAPER; RNPC2; FSAP59; CAPERalpha

基因 ID: 9584 | 基因类型: protein coding

关于 RBM39

Cytogenetic location: 20q11.22 Genomic coordinates (GRCh38): 20:35,701,347-35,742,260 (from NCBI)

This gene has 47 transcripts (splice variants), 279 orthologues and 36 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 103.4), lymph node (RPKM 47.1) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码 U2AF65 蛋白家族的成员。编码的蛋白质存在于细胞核中，在那里它与核心剪接体蛋白共定位。它已被证明在类固醇激素受体介导的转录和可变剪接中发挥作用，它也是病毒癌蛋白 v-Rel 的转录共调节因子。已观察到该基因的多个转录变体。已在 X 染色体上鉴定出一个相关的假基因。[RefSeq 提供，2011 年 8 月]

This gene encodes a member of the U2AF65 family of proteins. The encoded protein is found in the nucleus, where it co-localizes with core spliceosomal proteins. It has been shown to play a role in both steroid hormone receptor-mediated transcription and alternative splicing, and it is also a transcriptional coregulator of the viral oncoprotein v-Rel. Multiple transcript variants have been observed for this gene. A related pseudogene has been identified on chromosome X. [provided by RefSeq, Aug 2011]

RBM39 基因产物(7)

mRNA	Protein	Name
NM_001242599.2	NP_001229528.1	RNA-binding protein 39 isoform c
NM_001242600.2	NP_001229529.1	RNA-binding protein 39 isoform d
NM_001323422.2	NP_001310351.1	RNA-binding protein 39 isoform e
NM_001323423.2	NP_001310352.1	RNA-binding protein 39 isoform f
NM_001323424.2	NP_001310353.1	RNA-binding protein 39 isoform g
NM_004902.4	NP_004893.1	RNA-binding protein 39 isoform b
NM_184234.3	NP_909122.1	RNA-binding protein 39 isoform a

基因本体论

分子功能
生物过程
细胞组分

分子功能 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
enables protein binding	IPI IPI: 通过物理相互作用推断	15798186	GOA

生物过程 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
involved in regulation of mRNA splicing, via spliceosome	IDA IDA: 通过直接分析推断	15694343	GOA
involved in regulation of mRNA splicing, via spliceosome	IMP IMP: 通过突变表型推断	28302793	GOA

细胞组分 GO 注释	逻辑证据	参考文献	来源
located in nuclear speck	IMP IMP: 通过突变表型推断	28437394	GOA
part of protein-containing complex	IMP IMP: 通过突变表型推断	28437394	GOA

EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

RBM39 蛋白结构

RRM_1

RBM39linker

RRM_5

0
100
200
300
400
500
530 a.a.

蛋白主名

其他名称

RNA-binding protein 39

CAPER alpha

RBM39 蛋白互作信息

分类	蛋白名称	蛋白编号	互作蛋白	互作蛋白种属	互作蛋白编号	实验方法	参考文献
Intra	RBM39	Q14498	KRTAP12-2	Homo sapiens	P59991	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	KRTAP12-2	Homo sapiens	P59991	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	KRTAP12-2	Homo sapiens	P59991	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	NKAPD1	Homo sapiens	Q6ZUT1-2	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	ARL6IP4	Homo sapiens	Q66PJ3-3	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	ARL6IP4	Homo sapiens	Q66PJ3-3	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SREK1IP1	Homo sapiens	Q8N9Q2	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SAP18	Homo sapiens	O00422	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SAP18	Homo sapiens	O00422	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SAP18	Homo sapiens	O00422	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SAP18	Homo sapiens	O00422	Anti Tag CoIP	35271311
Intra	RBM39	Q14498	SREK1	Homo sapiens	Q8WXA9	Validated Y2H	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SREK1	Homo sapiens	Q8WXA9	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SREK1	Homo sapiens	Q8WXA9	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SRSF11	Homo sapiens	Q05519	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SRSF11	Homo sapiens	Q05519	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SRSF11	Homo sapiens	Q05519-2	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SRSF11	Homo sapiens	Q05519-2	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	POU6F2	Homo sapiens	P78424	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	POU6F2	Homo sapiens	P78424	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	CSNK2A1	Homo sapiens	P68400	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	CSNK2A1	Homo sapiens	P68400	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	CSNK2B	Homo sapiens	P67870	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	CSNK2B	Homo sapiens	P67870	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	CSNK2B	Homo sapiens	P67870	Anti Tag CoIP	35271311
Intra	RBM39	Q14498	SF3B4	Homo sapiens	Q15427	Anti Tag CoIP	35271311
Intra	RBM39	Q14498	SRRM4	Homo sapiens	A7MD48	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SRRM4	Homo sapiens	A7MD48	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	NKAPD1	Homo sapiens	Q6ZUT1	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	NKAPD1	Homo sapiens	Q6ZUT1	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	NKAPD1	Homo sapiens	Q6ZUT1	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	NKAPD1	Homo sapiens	Q6ZUT1	Validated Y2H	32296183
Intra	RBM39	Q14498	NKAPD1	Homo sapiens	Q6ZUT1	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	PPIG	Homo sapiens	Q13427	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	PPIG	Homo sapiens	Q13427	Anti Tag CoIP	35271311
Intra	RBM39	Q14498	PPIG	Homo sapiens	Q13427	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	PRPF40A	Homo sapiens	O75400-2	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SRPK1	Homo sapiens	Q96SB4	Protein Kinase Assay	23602568
Intra	RBM39	Q14498	SRPK1	Homo sapiens	Q96SB4	Anti Tag CoIP	35271311
Intra	RBM39	Q14498	SRPK2	Homo sapiens	P78362	BiFC	23602568
Intra	RBM39	Q14498	SRPK2	Homo sapiens	P78362	Y2H	22365833
Intra	RBM39	Q14498	SRPK2	Homo sapiens	P78362	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SRPK2	Homo sapiens	P78362	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SRPK2	Homo sapiens	P78362	Anti Tag CoIP	35271311
Intra	RBM39	Q14498	ZCCHC10	Homo sapiens	Q8TBK6	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	ZCCHC10	Homo sapiens	Q8TBK6	Y2H	22365833
Intra	RBM39	Q14498	ZCCHC10	Homo sapiens	Q8TBK6	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	PHC2	Homo sapiens	Q8IXK0	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	INO80B	Homo sapiens	Q9C086	Validated Y2H	32296183
Intra	RBM39	Q14498	SDCBP	Homo sapiens	O00560	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	SDCBP	Homo sapiens	O00560	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	DVL3	Homo sapiens	Q92997	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	DVL3	Homo sapiens	Q92997	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	DVL3	Homo sapiens	Q92997	Validated Y2H	32296183
Intra	RBM39	Q14498	THAP1	Homo sapiens	Q9NVV9	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	THAP1	Homo sapiens	Q9NVV9	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	THAP1	Homo sapiens	Q9NVV9	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	THAP1	Homo sapiens	Q9NVV9	Validated Y2H	32296183
Intra	RBM39	Q14498	THAP1	Homo sapiens	Q9NVV9	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	CLK2	Homo sapiens	P49760	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	CLK2	Homo sapiens	P49760	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	CLK2	Homo sapiens	P49760	Y2H Prey Pooling	32296183
Intra	RBM39	Q14498	CLK2	Homo sapiens	P49760	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	CLK2	Homo sapiens	P49760	Y2H Array	32296183
Intra	RBM39	Q14498	KHDC4	Homo sapiens	Q7Z7F0	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	KHDC4	Homo sapiens	Q7Z7F0	Y2H Prey Pooling	25416956
Intra	RBM39	Q14498	KHDC4	Homo sapiens	Q7Z7F0	Y2H Array	25416956
Intra	RBM39	Q14498	AK8	Homo sapiens	Q96MA6	Validated Y2H	25416956
Intra	RBM39	Q14498	PCBP1	Homo sapiens	Q15365	Anti Tag CoIP	35271311

种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称

别名

Hepatocellular Carcinoma

Liver Cancer	Primary Liver Cancer
HCC	Hepatoma
Malignant Neoplasm Of Liver	Liver Neoplasms
Cancer, Hepatocellular	Liver Cell Carcinoma
Lcc	Hepatoblastoma, Somatic
Hepatic Cancer	Primary Malignant Neoplasm Of Liver
Rare Tumor Of Liver And Intrahepatic Biliary Tract	Hepatocellular Carcinoma, Somatic
Hepatocellular Carcinoma, Childhood Type, Somatic	Hepatocellular Cancer, Somatic
Ca Liver - Primary	Hepatic Neoplasm
Malignant Hepato-Biliary Neoplasm	Malignant Neoplasm Of Liver, Not Specified As Primary Or Secondary
Malignant Neoplasm Of Liver, Primary	Malignant Tumor Of Liver
Neoplasm Of Liver	Non-Resectable Primary Hepatic Malignant Neoplasm
Resectable Malignant Neoplasm Of Liver	Resectable Malignant Neoplasm Of The Liver
Primary Liver Carcinoma	Primary Malignant Liver Neoplasm
Primary Cancer Of Liver	Primary Tumor Of The Liver
Rare Tumor Of Liver And Ibt	Hepatocellular Cancer
Neoplasm Of The Liver	Carcinoma, Hepatocellular
Hepatomas	Liver Neoplasm
Liver Carcinoma	Liver And Intrahepatic Biliary Tract Carcinoma
Malignant Hepatobiliary Neoplasm	Adult Primary Hepatocellular Carcinoma
Hepatoblastoma	Carcinoma Of Liver
Malignant Liver Tumour	Malignant Hepatic Tumour

疾病名称	别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia	Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma Waldenstroem'S Macroglobulinemia Waldenstroem'S Macroglobulinemia Macroglobulinemia Of Waldenstrom Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy Lymphoplasmacytic Lymphoma

目录号	产品名	作用方式	纯度	Phase
HY-13650	Indisulam	Inhibitor	99.80%	Phase 2

Cat. No.	产品名	作用方式	纯度	是否罕见病
HY-W133627	dCeMM1		99.53%	否
HY-RS11751	RBM39 Human Pre-designed siRNA Set A	Pre-designed Sets	/	否

直系同源

种属	基因名	来源	基因 ID
Rattus norvegicus	RBM39	RGD	RGD:1310071
Mus musculus	RBM39	MGD	MGI:2157953
Canis familiaris	RBM39	VGNC	VGNC:45420
Macaca mulatta	RBM39	VGNC	VGNC:98434
Felis catus	RBM39	VGNC	VGNC:64529
Bos taurus	RBM39	VGNC	VGNC:33799

MedChemExpress (MCE) 只为有资质的科研机构、医药企业基于科学研究或药证申报的用途提供医药研发服务，不为任何个人或者非科研性质的、非用于药证申报使用等其他用途提供服务。	站点地图隐私声明
沪ICP备15051369号-4 上海工商沪公网安备31011502019417 沪(浦)应急管危经许[2021]201709(QFYS) 营业执照（三证合一）
Copyright © 2013-2024 MedChemExpress. All Rights Reserved.

MedChemExpress (MCE) 只为有资质的科研机构、医药企业基于科学研究或药证申报的用途提供医药研发服务，不为任何个人或者非科研性质的、非用于药证申报使用等其他用途提供服务。

站点地图隐私声明

沪ICP备15051369号-4