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SCRIB - scribble planar cell polarity protein Gene

中文名称:涂鸦平面细胞极性蛋白

种属: Homo sapiens

同用名: CRIB1; SCRB1; SCRIB1; Vartul; oSCRIB

基因 ID: 23513 | 基因类型: protein coding

关于 SCRIB

Cytogenetic location: 8q24.3 Genomic coordinates (GRCh38): 8:143,790,925-143,815,773 (from NCBI)

This gene has 10 transcripts (splice variants), 1 gene allele, 187 orthologues, 31 paralogues and is associated with 1 phenotype. Ubiquitous expression in colon (RPKM 9.3), skin (RPKM 9.0) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白质被鉴定为与果蝇涂鸦蛋白质相似。哺乳动物蛋白参与肿瘤抑制途径。作为参与细胞极化过程的支架蛋白,该蛋白与许多其他蛋白结合。编码的蛋白质通过其 PDZ 结构域和 E6 的 C 末端与乳头瘤病毒 E6 蛋白结合。已经为该基因发现了编码不同蛋白质同种型的两种选择性剪接的转录物变体。[RefSeq 提供,2011 年 11 月]

This gene encodes a protein that was identified as being similar to the Drosophila scribble protein. The mammalian protein is involved in tumor suppression pathways. As a scaffold protein involved in cell polarization processes, this protein binds to many Other proteins. The encoded protein binds to papillomavirus E6 protein via its PDZ domain and the C-terminus of E6. Two alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

SCRIB 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_015356.5 NP_056171.3 protein scribble homolog isoform b
NM_182706.5 NP_874365.3 protein scribble homolog isoform a
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
15182672 GOA
enables signaling adaptor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
27380321 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in activation of GTPase activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
19041750 GOA
involved in apoptotic process involved in morphogenesis IMP
IMP: 通过突变表型推断
19041750 GOA
involved in cell migration IMP
IMP: 通过突变表型推断
18716323 GOA
involved in cell population proliferation IDA
IDA: 通过直接分析推断
16965391 GOA
involved in cell-cell adhesion IGI
IGI: 通过遗传相互作用推断
16344308 GOA
involved in establishment of apical/basal cell polarity IMP
IMP: 通过突变表型推断
19041750 GOA
involved in negative regulation of mitotic cell cycle IDA
IDA: 通过直接分析推断
16965391 GOA
involved in negative regulation of translational initiation IMP
IMP: 通过突变表型推断
34535749 GOA
involved in neural tube closure IMP
IMP: 通过突变表型推断
22095531 GOA
involved in polarized epithelial cell differentiation IMP
IMP: 通过突变表型推断
27380321 GOA
involved in positive chemotaxis IMP
IMP: 通过突变表型推断
18716323 GOA
involved in positive regulation of apoptotic process IMP
IMP: 通过突变表型推断
19041750 GOA
involved in positive regulation of receptor recycling IMP
IMP: 通过突变表型推断
15775968 GOA
involved in protein localization to adherens junction IMP
IMP: 通过突变表型推断
16611247 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of Scrib-APC-beta-catenin complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
16611247 GOA
located in adherens junction IDA
IDA: 通过直接分析推断
16965391 GOA
colocalizes with cell leading edge IDA
IDA: 通过直接分析推断
18716323 GOA
located in cell-cell junction IDA
IDA: 通过直接分析推断
15649318 GOA
located in cytoplasm IDA
IDA: 通过直接分析推断
19386766 GOA
colocalizes with plasma membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
16611247 GOA
located in plasma membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
15182672 GOA
colocalizes with postsynaptic membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
15182672 GOA
colocalizes with presynaptic membrane IDA
IDA: 通过直接分析推断
15182672 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SCRIB 蛋白结构

LRR_8

LRR_8: Leucine rich repeat (37 - 94)

LRR_4

LRR_4: Leucine Rich repeats (2 copies) (152 - 187)

LRR_4

LRR_4: Leucine Rich repeats (2 copies) (197 - 237)

PDZ

PDZ: PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) (730 - 811)

PDZ

PDZ: PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) (868 - 946)

PDZ

PDZ: PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) (1005 - 1089)

PDZ

PDZ: PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) (1103 - 1188)

  • 0
  • 300
  • 600
  • 900
  • 1200
  • 1500
  • 1630 a.a.
蛋白主名 其他名称

protein scribble homolog

scribbled homolog

SCRIB 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SCRIB Q14160 VEPH1 Homo sapiens Q14D04 30126976
种属内
SCRIB Q14160 YAP1 Homo sapiens P46937 30126976
种属内
SCRIB Q14160 ARHGEF16 Homo sapiens Q5VV41 30126976
种属内
SCRIB Q14160 TANC1 Homo sapiens Q9C0D5
MST
30126976
种属内
SCRIB Q14160 TANC1 Homo sapiens Q9C0D5 30126976
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P06427
SLC
22898364
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P06427 24550280
种属内
SCRIB Q14160 ATP2B2 Homo sapiens Q01814 30126976
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P03126 16103886
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P03126 24550280
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P03126
SLC
22898364
种属内
SCRIB Q14160 b7z2y1_human Homo sapiens B7Z2Y1 24550280
种属内
SCRIB Q14160 NXPE2 Homo sapiens Q96DL1 24550280
种属内
SCRIB Q14160 SLC15A5 Homo sapiens A6NIM6 30126976
种属内
SCRIB Q14160 FAM163B Homo sapiens P0C2L3 30126976
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P24835 24550280
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P24835
SLC
22898364
种属间
SCRIB Q14160 tax Human T-cell leukemia virus P0C213 24550280
种属间
SCRIB Q14160 tax Human T-cell leukemia virus P0C222 24550280
种属内
SCRIB Q14160 KCNJ12 Homo sapiens Q14500 24550280
种属内
SCRIB Q14160 KCNJ12 Homo sapiens Q14500 30126976
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P06463 16103886
种属间
SCRIB Q14160 E6 Human papillomavirus P06463
SLC
22898364
种属内
SCRIB Q14160 RPS6KA2 Homo sapiens Q15349 30126976
种属内
SCRIB Q14160 RPS6KA2 Homo sapiens Q15349
ITC
30126976
种属内
SCRIB Q14160 RPS6KA2 Homo sapiens Q15349
NMR
29144123
种属内
SCRIB Q14160 RPS6KA2 Homo sapiens Q15349
MST
30126976
种属内
SCRIB Q14160 RPS6KA2 Homo sapiens Q15349
NMR
30126976
种属内
SCRIB Q14160 TSHR Homo sapiens P16473 15775968
种属内
SCRIB Q14160 TSHR Homo sapiens P16473 15775968
种属内
SCRIB Q14160 ADAM22 Homo sapiens Q9P0K1 30126976
种属内
SCRIB Q14160 ADAM22 Homo sapiens Q9P0K1 24550280
种属内
SCRIB Q14160 WTIP Homo sapiens A6NIX2 30126976
种属内
SCRIB Q14160 NET1 Homo sapiens Q7Z628 30126976
种属内
SCRIB Q14160 PHLPP1 Homo sapiens O60346 33961781
种属内
SCRIB Q14160 MCC Homo sapiens P23508 30126976
种属内
SCRIB Q14160 MCC Homo sapiens P23508
NMR
29144123
种属内
SCRIB Q14160 MCC Homo sapiens P23508 33961781
种属内
SCRIB Q14160 MCC Homo sapiens P23508
ITC
30126976
种属内
SCRIB Q14160 MCC Homo sapiens P23508 19555689
种属内
SCRIB Q14160 MCC Homo sapiens P23508
IF
19555689
种属内
SCRIB Q14160 MCC Homo sapiens P23508
MST
30126976
种属内
SCRIB Q14160 FRMPD4 Homo sapiens Q14CM0 30126976
种属内
SCRIB Q14160 CYSLTR2 Homo sapiens Q9NS75 30126976
种属内
SCRIB Q14160 SLC6A12 Homo sapiens P48065 24550280
种属内
SCRIB Q14160 CRHR1 Homo sapiens P34998 30126976
种属内
SCRIB Q14160 ADRA1D Homo sapiens P25100 24550280
种属内
SCRIB Q14160 ADRA1D Homo sapiens P25100
TAP
26617989
种属内
SCRIB Q14160 ATP2B1 Homo sapiens P20020 30126976
种属内
SCRIB Q14160 MAPK12 Homo sapiens P53778
IF
24550280
种属内
SCRIB Q14160 MAPK12 Homo sapiens P53778
ITC
30126976
种属内
SCRIB Q14160 MAPK12 Homo sapiens P53778 24550280
种属内
SCRIB Q14160 MAPK12 Homo sapiens P53778 30126976
种属内
SCRIB Q14160 MAPK12 Homo sapiens P53778 24550280
种属内
SCRIB Q14160 GUCY1A2 Homo sapiens P33402 30126976
种属内
SCRIB Q14160 GUCY1A2 Homo sapiens P33402
IF
24550280
种属内
SCRIB Q14160 GUCY1A2 Homo sapiens P33402 24550280
种属内
SCRIB Q14160 GUCY1A2 Homo sapiens P33402 24550280
种属间
SCRIB Q14160 Fat1 Mus musculus Q9QXA3 19439659
种属间
SCRIB Q14160 Fat1 Mus musculus Q9QXA3 19439659
种属内
SCRIB Q14160 KCNJ2 Homo sapiens P63252 30126976
种属内
SCRIB Q14160 KCNJ4 Homo sapiens P48050 30126976
种属内
SCRIB Q14160 KCNJ4 Homo sapiens P48050 24550280
种属内
SCRIB Q14160 ARHGEF7 Homo sapiens Q14155 24550280
种属内
SCRIB Q14160 ARHGEF7 Homo sapiens Q14155 19041750
种属内
SCRIB Q14160 ARHGEF7 Homo sapiens Q14155 24550280
种属内
SCRIB Q14160 ARHGEF7 Homo sapiens Q14155
TAP
26617989
种属内
SCRIB Q14160 ARHGEF7 Homo sapiens Q14155 33961781
种属内
SCRIB Q14160 ARHGEF7 Homo sapiens Q14155
IF
24550280
种属内
SCRIB Q14160 DNM1L Homo sapiens O00429 24550280
种属内
SCRIB Q14160 PKP4 Homo sapiens Q99569
IF
24550280
种属内
SCRIB Q14160 PKP4 Homo sapiens Q99569 24550280
种属内
SCRIB Q14160 PKP4 Homo sapiens Q99569 30126976
种属内
SCRIB Q14160 PKP4 Homo sapiens Q99569 24550280
种属内
SCRIB Q14160 CTNND2 Homo sapiens Q9UQB3 24550280
种属内
SCRIB Q14160 CTNND2 Homo sapiens Q9UQB3 30126976
种属内
SCRIB Q14160 APC Homo sapiens P25054 16611247
种属内
SCRIB Q14160 APC Homo sapiens P25054 30126976
种属内
SCRIB Q14160 APC Homo sapiens P25054 16611247
种属内
SCRIB Q14160 MAPK3 Homo sapiens P27361 20622900
种属内
SCRIB Q14160 FASTKD5 Homo sapiens Q7L8L6 30126976
种属内
SCRIB Q14160 WWTR1 Homo sapiens Q9GZV5 30126976
种属内
SCRIB Q14160 RALBP1 Homo sapiens Q15311 30126976
种属内
SCRIB Q14160 RALBP1 Homo sapiens Q15311 24550280
种属内
SCRIB Q14160 DNAAF11 Homo sapiens Q86X45 25036637
种属内
SCRIB Q14160 RPS6KA1 Homo sapiens Q15418 30126976
种属内
SCRIB Q14160 RPS6KA1 Homo sapiens Q15418
MST
30126976
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Neural Tube Defects

Spina Bifida

Neural Tube Defect

NTD

Neural Tube Defects, Susceptibility To

Spinal Dysraphism

Spina Bifida, Susceptibility To

Rachischisis

Cleft Spine

Open Spine

Hydrocele Spinalis

Neural Tube Defect Nos

Sb - [Spina Bifida]

Spinal Hernia Nos

Spinal Fissure Nos

Tick-Borne Encephalitis

Siberian Tick-Borne Encephalitis

Encephalitis, Tick-Borne

Central European Encephalitis

Far Eastern Tbe

Russian Spring-Summer Encephalitis

Taiga Encephalitis

West-Siberian Encephalitis

Western European Tick-Borne Encephalitis

Tbe

Encephalitis Tick-Borne

Encephalitis, Central European

Encephalitis, Far Eastern Russian

Myelomeningocele

Meningomyelocele

Anencephaly

Aprosencephaly

Anencephalus

Congenital Absence Of Brain

Absence Of A Large Part Of The Brain And The Skull

Anencephalia

Anencephalic Monster

Brain Absence

Brain Agenesis

Brain Aplasia

Absent Brain

Anencephalic

Congenital Absence Of Cerebrum

Congenital Hemicrania

Incomplete Anencephaly

Encephalitis

Mumps Encephalitis

Mumps Meningoencephalitis

Herpes Simplex Neuroinvasion

Herpetic Encephalitis

Herpetic Encephalopathy

Herpes Simplex Encephalitis, Myelitis Or Encephalomyelitis

Encephalitis Due To Herpesviridae

Encephalitis Due To Herpesvirus

Herpes Encephalitis

Herpesviral Encephalitis

Herpes Simplex Encephalitis

Hsv - [Herpes Simplex Virus] Encephalitis

Herpes Virus Encephalitis

Simian B Disease

Simian B Disorder

Encephalitis Nec

Idiopathic Encephalitis

Spinal Cord Lipoma

Lipoma Of Spinal Cord

Tethered Spinal Cord Syndrome

Spinal Dysraphism

Tethered Cord Syndrome

Occult Spinal Dysraphism

Occult Spinal Dysraphism Sequence

Segmental Vertebral Anomalies

Tethered Spinal Cord Disease

Tethered Cord

Spina Bifida Occulta

Cryptomerorachischisis

Spina Bifida Occulta With Tethered Spinal Cord

Sbo - [Spina Bifida Occulta]

Atrial Septal Defect 2

ASD2

Atrial Heart Septal Defect 2

Atrial Septal Defect-2

Asd Ii

Septal Defect, Atrial, Type 2

Congenital Nervous System Abnormality

Congenital Neurologic Anomaly

Congenital Nervous System Disorder

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus SCRIB RGD RGD:1565055
Canis familiaris SCRIB VGNC VGNC:45931
Bos taurus SCRIB VGNC VGNC:34365
Mus musculus SCRIB MGD MGI:2145950
Felis catus SCRIB VGNC VGNC:81694