1. Gene
  2. SNRPC - small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C Gene

SNRPC - small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C Gene

中文名称:小核核糖核蛋白多肽 C

种属: Homo sapiens

同用名: U1C; Yhc1

基因 ID: 6631 | 基因类型: protein coding

关于 SNRPC

Cytogenetic location: 6p21.31 Genomic coordinates (GRCh38): 6:34,757,505-34,773,857 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants) and 183 orthologues. Ubiquitous expression in testis (RPKM 34.9), bone marrow (RPKM 32.7) and 25 other tissues.

功能概要

该基因编码剪接体形成所需的 U1 小核糖核蛋白 (snRNP) 颗粒的特定蛋白质成分之一。编码的蛋白质参与核前体信使 RNA 剪接的加工。 snRNP 颗粒受到结缔组织病患者经常产生的自身抗体的攻击。基因组包含该功能基因的几个假基因。可变剪接导致非编码转录本变体。[RefSeq 提供,2009 年 10 月]

This gene encodes one of the specific protein components of the U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) particle required for the formation of the spliceosome. The encoded protein participates in the processing of nuclear precursor messenger RNA splicing. snRNP particles are attacked by autoantibodies frequently produced by patients with connective tissue diseases. The genome contains several pseudogenes of this functional gene. Alternative splicing results in a non-coding transcript variant.[provided by RefSeq, Oct 2009]

SNRPC 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_003093.3 NP_003084.1 U1 small nuclear ribonucleoprotein C
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
NOT enables U1 snRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
1826349 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8076607 GOA
enables protein homodimerization activity IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
8532530 GOA
enables single-stranded RNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
8798632 GOA
enables zinc ion binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
15312772 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in mRNA splicing, via spliceosome IDA
IDA: 通过直接分析推断
8972845 GOA
involved in spliceosomal snRNP assembly IDA
IDA: 通过直接分析推断
8972845 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
located in Cajal body IDA
IDA: 通过直接分析推断
10068039 GOA
part of U1 snRNP IDA
IDA: 通过直接分析推断
15312772 GOA
part of U1 snRNP IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
33677607 GOA
part of spliceosomal complex IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
33677607 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

SNRPC 蛋白结构

zf-U1

zf-U1: U1 zinc finger (1 - 38)

  • 0
  • 100
  • 159 a.a.
蛋白主名 其他名称

U1 small nuclear ribonucleoprotein C

U1 small nuclear RNP specific C

SNRPC 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
SNRPC P09234 KRTAP8-1 Homo sapiens Q8IUC2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP8-1 Homo sapiens Q8IUC2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP8-1 Homo sapiens Q8IUC2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-5 Homo sapiens Q3LI72 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-5 Homo sapiens Q3LI72 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-5 Homo sapiens Q3LI72 32296183
种属内
SNRPC P09234 BCAS2 Homo sapiens O75934 32296183
种属内
SNRPC P09234 BCAS2 Homo sapiens O75934 32296183
种属内
SNRPC P09234 BCAS2 Homo sapiens O75934 35271311
种属内
SNRPC P09234 KRTAP11-1 Homo sapiens Q8IUC1 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP11-1 Homo sapiens Q8IUC1 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP11-1 Homo sapiens Q8IUC1 32296183
种属内
SNRPC P09234 NCKIPSD Homo sapiens Q9NZQ3-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 NCKIPSD Homo sapiens Q9NZQ3-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 NCKIPSD Homo sapiens Q9NZQ3-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 TLE5 Homo sapiens Q08117-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 TLE5 Homo sapiens Q08117-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 TLE5 Homo sapiens Q08117-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP13-2 Homo sapiens Q52LG2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP13-2 Homo sapiens Q52LG2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP13-2 Homo sapiens Q52LG2 32296183
种属内
SNRPC P09234 SPAG8 Homo sapiens Q99932-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 SPAG8 Homo sapiens Q99932-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 SPAG8 Homo sapiens Q99932-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP6-2 Homo sapiens Q3LI66 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP6-2 Homo sapiens Q3LI66 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP6-2 Homo sapiens Q3LI66 32296183
种属内
SNRPC P09234 ACTMAP Homo sapiens Q5BKX5-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 ACTMAP Homo sapiens Q5BKX5-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 ACTMAP Homo sapiens Q5BKX5-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 BOLL Homo sapiens Q8N9W6-4 32296183
种属内
SNRPC P09234 BOLL Homo sapiens Q8N9W6-4 32296183
种属内
SNRPC P09234 BOLL Homo sapiens Q8N9W6-4 32296183
种属内
SNRPC P09234 RUNX1 Homo sapiens Q01196-8 32296183
种属内
SNRPC P09234 RUNX1 Homo sapiens Q01196-8 32296183
种属内
SNRPC P09234 RUNX1 Homo sapiens Q01196-8 32296183
种属内
SNRPC P09234 WWOX Homo sapiens Q9NZC7-5 32296183
种属内
SNRPC P09234 WWOX Homo sapiens Q9NZC7-5 32296183
种属内
SNRPC P09234 WWOX Homo sapiens Q9NZC7-5 32296183
种属内
SNRPC P09234 UFSP1 Homo sapiens Q6NVU6 32296183
种属内
SNRPC P09234 UFSP1 Homo sapiens Q6NVU6 32296183
种属内
SNRPC P09234 UFSP1 Homo sapiens Q6NVU6 32296183
种属内
SNRPC P09234 ANKRD10 Homo sapiens Q9NXR5-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 ANKRD10 Homo sapiens Q9NXR5-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 ANKRD10 Homo sapiens Q9NXR5-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 FUBP1 Homo sapiens Q96AE4-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 FUBP1 Homo sapiens Q96AE4-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 FUBP1 Homo sapiens Q96AE4-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 FAM168B Homo sapiens A1KXE4-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 FAM168B Homo sapiens A1KXE4-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-2 Homo sapiens Q3LHN2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-2 Homo sapiens Q3LHN2 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-2 Homo sapiens Q3LHN2 32296183
种属内
SNRPC P09234 PRR20D Homo sapiens P86480 32296183
种属内
SNRPC P09234 PRR20D Homo sapiens P86480 32296183
种属内
SNRPC P09234 PRR20D Homo sapiens P86480 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-6 Homo sapiens Q3LI70 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-6 Homo sapiens Q3LI70 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP19-6 Homo sapiens Q3LI70 32296183
种属内
SNRPC P09234 EYA2 Homo sapiens O00167-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 EYA2 Homo sapiens O00167-2 32296183
种属内
SNRPC P09234 STH Homo sapiens Q8IWL8 32296183
种属内
SNRPC P09234 STH Homo sapiens Q8IWL8 32296183
种属内
SNRPC P09234 STH Homo sapiens Q8IWL8 32296183
种属内
SNRPC P09234 CREM Homo sapiens Q03060-25 32296183
种属内
SNRPC P09234 CREM Homo sapiens Q03060-25 32296183
种属内
SNRPC P09234 CREM Homo sapiens Q03060-25 32296183
种属内
SNRPC P09234 TIA1 Homo sapiens P31483 12486009
种属内
SNRPC P09234 TIA1 Homo sapiens P31483 12486009
种属内
SNRPC P09234 KRTAP7-1 Homo sapiens Q8IUC3 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP7-1 Homo sapiens Q8IUC3 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP7-1 Homo sapiens Q8IUC3 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP21-2 Homo sapiens Q3LI59 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP21-2 Homo sapiens Q3LI59 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP21-2 Homo sapiens Q3LI59 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP6-3 Homo sapiens Q3LI67 32296183
种属内
SNRPC P09234 KRTAP6-3 Homo sapiens Q3LI67 32296183
种属内
SNRPC P09234 MKRN3 Homo sapiens Q13064 32296183
种属内
SNRPC P09234 MKRN3 Homo sapiens Q13064 32296183
种属内
SNRPC P09234 MKRN3 Homo sapiens Q13064 32296183
种属内
SNRPC P09234 SF3A2 Homo sapiens Q15428 35271311
种属内
SNRPC P09234 SF3A2 Homo sapiens Q15428 17332742
种属内
SNRPC P09234 BAG4 Homo sapiens O95429 32296183
种属内
SNRPC P09234 BAG4 Homo sapiens O95429 32296183
种属内
SNRPC P09234 HNRNPDL Homo sapiens O14979 35271311
种属内
SNRPC P09234 HNRNPDL Homo sapiens O14979 32296183
种属内
SNRPC P09234 HNRNPH1 Homo sapiens P31943 32296183
种属内
SNRPC P09234 HNRNPH1 Homo sapiens P31943 32296183
种属内
SNRPC P09234 HNRNPH1 Homo sapiens P31943 32296183
种属内
SNRPC P09234 AKAP8L Homo sapiens Q9ULX6 35271311
种属内
SNRPC P09234 AKAP8L Homo sapiens Q9ULX6 32296183
种属内
SNRPC P09234 AKAP8L Homo sapiens Q9ULX6 32296183
种属内
SNRPC P09234 AKAP8L Homo sapiens Q9ULX6 32296183
种属内
SNRPC P09234 EXOSC8 Homo sapiens Q96B26 32296183
种属内
SNRPC P09234 EXOSC8 Homo sapiens Q96B26 32296183
种属内
SNRPC P09234 EXOSC8 Homo sapiens Q96B26 32296183
种属内
SNRPC P09234 CYSRT1 Homo sapiens A8MQ03 32296183
种属内
SNRPC P09234 CYSRT1 Homo sapiens A8MQ03 32296183
种属内
SNRPC P09234 PRDM14 Homo sapiens Q9GZV8 32296183
种属内
SNRPC P09234 PRDM14 Homo sapiens Q9GZV8 32296183
种属内
SNRPC P09234 PRDM14 Homo sapiens Q9GZV8 32296183
种属内
SNRPC P09234 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7 32296183
种属内
SNRPC P09234 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7 32296183
种属内
SNRPC P09234 TRIB3 Homo sapiens Q96RU7 32296183
种属内
SNRPC P09234 ODAM Homo sapiens A1E959 32296183
种属内
SNRPC P09234 ODAM Homo sapiens A1E959 32296183
种属内
SNRPC P09234 MAGED1 Homo sapiens Q9Y5V3 32296183
种属内
SNRPC P09234 MAGED1 Homo sapiens Q9Y5V3 32296183
种属内
SNRPC P09234 MAGED1 Homo sapiens Q9Y5V3 32296183
种属内
SNRPC P09234 RBM10 Homo sapiens P98175 22365833
种属内
SNRPC P09234 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
SNRPC P09234 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
SNRPC P09234 DAZAP2 Homo sapiens Q15038 32296183
种属内
SNRPC P09234 PLA2G10 Homo sapiens O15496 32296183
种属内
SNRPC P09234 PLA2G10 Homo sapiens O15496 32296183
种属内
SNRPC P09234 RBPMS Homo sapiens Q93062-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 RBPMS Homo sapiens Q93062-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 RBPMS Homo sapiens Q93062-3 32296183
种属内
SNRPC P09234 HOXA1 Homo sapiens P49639 32296183
种属内
SNRPC P09234 HOXA1 Homo sapiens P49639 32296183
种属内
SNRPC P09234 HOXA1 Homo sapiens P49639 32296183
种属内
SNRPC P09234 FHL3 Homo sapiens Q13643 32296183
种属内
SNRPC P09234 FHL3 Homo sapiens Q13643 32296183
种属内
SNRPC P09234 FHL3 Homo sapiens Q13643 32296183
种属内
SNRPC P09234 HSD17B14 Homo sapiens Q9BPX1 32296183
种属内
SNRPC P09234 HSD17B14 Homo sapiens Q9BPX1 32296183
种属内
SNRPC P09234 HSD17B14 Homo sapiens Q9BPX1 32296183
种属内
SNRPC P09234 SEC23B Homo sapiens Q15437 32296183
种属内
SNRPC P09234 SEC23B Homo sapiens Q15437 32296183
种属内
SNRPC P09234 SEC23B Homo sapiens Q15437 32296183
种属内
SNRPC P09234 WWP2 Homo sapiens O00308 32296183
种属内
SNRPC P09234 WWP2 Homo sapiens O00308 32296183
种属内
SNRPC P09234 RAMAC Homo sapiens Q9BTL3 32296183
种属内
SNRPC P09234 RAMAC Homo sapiens Q9BTL3 32296183
种属内
SNRPC P09234 RAMAC Homo sapiens Q9BTL3 32296183
种属内
SNRPC P09234 INTS11 Homo sapiens Q5TA45 32296183
种属内
SNRPC P09234 INTS11 Homo sapiens Q5TA45 32296183
种属内
SNRPC P09234 INTS11 Homo sapiens Q5TA45 32296183
种属内
SNRPC P09234 ARHGAP9 Homo sapiens Q9BRR9 32296183
种属内
SNRPC P09234 ARHGAP9 Homo sapiens Q9BRR9 32296183
种属内
SNRPC P09234 ARHGAP9 Homo sapiens Q9BRR9 32296183
种属内
SNRPC P09234 KLF1 Homo sapiens Q13351 32296183
种属内
SNRPC P09234 KLF1 Homo sapiens Q13351 32296183
种属内
SNRPC P09234 KLF1 Homo sapiens Q13351 32296183
种属内
SNRPC P09234 METTL27 Homo sapiens Q8N6F8 32296183
种属内
SNRPC P09234 METTL27 Homo sapiens Q8N6F8 32296183
种属内
SNRPC P09234 METTL27 Homo sapiens Q8N6F8 32296183
种属内
SNRPC P09234 JMJD7 Homo sapiens P0C870 32296183
种属内
SNRPC P09234 JMJD7 Homo sapiens P0C870 32296183
种属内
SNRPC P09234 JMJD7 Homo sapiens P0C870 32296183
种属内
SNRPC P09234 GIGYF1 Homo sapiens O75420 32296183
种属内
SNRPC P09234 GIGYF1 Homo sapiens O75420 32296183
种属内
SNRPC P09234 ECM1 Homo sapiens Q16610 32296183
种属内
SNRPC P09234 ECM1 Homo sapiens Q16610 32296183
种属内
SNRPC P09234 ECM1 Homo sapiens Q16610 32296183
种属内
SNRPC P09234 RERE Homo sapiens Q9P2R6 32296183
种属内
SNRPC P09234 RERE Homo sapiens Q9P2R6 32296183
种属内
SNRPC P09234 RERE Homo sapiens Q9P2R6 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

SNRPC 抗体

目录号 产品名 应用 反应物种
HY-P82581 U1C Antibody (YA2326) WB, IHC-F, IHC-P, ICC/IF, IP Human, Rat

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Bos taurus SNRPC VGNC VGNC:35078
Mus musculus SNRPC MGD MGI:109489
Rattus norvegicus SNRPC RGD RGD:1306065