1. Gene
  2. FHL3 - four and a half LIM domains 3 Gene

FHL3 - four and a half LIM domains 3 Gene

中文名称:四个半 LIM 域 3

种属: Homo sapiens

同用名: SLIM2

基因 ID: 2275 | 基因类型: protein coding

关于 FHL3

Cytogenetic location: 1p34.3 Genomic coordinates (GRCh38): 1:37,996,770-38,005,514 (from NCBI)

This gene has 5 transcripts (splice variants), 285 orthologues and 2 paralogues. Ubiquitous expression in esophagus (RPKM 21.3), endometrium (RPKM 16.8) and 25 other tissues.

功能概要

由该基因编码的蛋白质是包含四个半 LIM 结构域的蛋白质家族的成员,该结构域是高度保守的双锌指基序。编码的蛋白质已被证明与癌症发育调节因子 SMAD2、SMAD3 和 SMAD4、骨骼肌成肌蛋白 MyoD 和高亲和力 IgE β 链调节因子 MZF-1 相互作用。该蛋白可能参与肿瘤抑制、MyoD 表达抑制和 IgE 受体表达抑制。已发现该基因的两个转录本变体编码不同的亚型。[RefSeq 提供,2011 年 8 月]

The protein encoded by this gene is a member of a family of proteins containing a four-and-a-half LIM domain, which is a highly conserved double zinc finger motif. The encoded protein has been shown to interact with the Cancer developmental regulators SMAD2, SMAD3, and SMAD4, the skeletal muscle myogenesis protein MyoD, and the high-affinity IgE beta chain regulator MZF-1. This protein may be involved in tumor suppression, repression of MyoD expression, and repression of IgE receptor expression. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

FHL3 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001243878.2 NP_001230807.1 four and a half LIM domains protein 3 isoform 2
NM_004468.5 NP_004459.2 four and a half LIM domains protein 3 isoform 1
基因本体论
  • 分子功能
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
16189514 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

FHL3 蛋白结构

LIM

LIM: LIM domain (40 - 97)

LIM

LIM: LIM domain (101 - 158)

LIM

LIM: LIM domain (162 - 216)

LIM

LIM: LIM domain (221 - 276)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 280 a.a.
蛋白主名 其他名称

four and a half LIM domains protein 3

FHL-3

FHL3 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
FHL3 Q13643 DCDC2B Homo sapiens A2VCK2
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种属内
FHL3 Q13643 KRTAP12-2 Homo sapiens P59991
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种属内
FHL3 Q13643 KRTAP12-2 Homo sapiens P59991
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FHL3 Q13643 TRO Homo sapiens G5E9N2
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FHL3 Q13643 KPRP Homo sapiens Q5T749
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种属内
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种属内
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种属内
FHL3 Q13643 ZNF417 Homo sapiens Q8TAU3
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FHL3 Q13643 CNNM3 Homo sapiens Q8NE01
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Y2H
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FHL3 Q13643 THAP7 Homo sapiens Q9BT49
Y2H Prey Pooling
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FHL3 Q13643 THAP7 Homo sapiens Q9BT49
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FHL3 Q13643 RFX3 Homo sapiens P48380
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种属内
FHL3 Q13643 AIMP2 Homo sapiens Q13155
BFG-2H
27107012
种属内
FHL3 Q13643 AIMP2 Homo sapiens Q13155
Y2H Pooling
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种属内
FHL3 Q13643 RHEBL1 Homo sapiens Q8TAI7
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种属内
FHL3 Q13643 IKZF3 Homo sapiens Q9UKT9
BFG-2H
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FHL3 Q13643 IKZF3 Homo sapiens Q9UKT9
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FHL3 Q13643 RSPH14 Homo sapiens Q9UHP6
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FHL3 Q13643 SPMAP2 Homo sapiens Q9P2T0
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FHL3 Q13643 SPMAP2 Homo sapiens Q9P2T0
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FHL3 Q13643 SAP30BP Homo sapiens Q9UHR5
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FHL3 Q13643 SAP30BP Homo sapiens Q9UHR5
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种属内
FHL3 Q13643 GARIN6 Homo sapiens Q8NEG0
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种属内
FHL3 Q13643 E2F8 Homo sapiens A0AVK6
Validated Y2H
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种属内
FHL3 Q13643 E2F8 Homo sapiens A0AVK6
Y2H Prey Pooling
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Validated Y2H
25416956
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FHL3 Q13643 PTPN6 Homo sapiens P29350
Y2H Prey Pooling
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FHL3 Q13643 PTPN6 Homo sapiens P29350
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FHL3 Q13643 TTLL10 Homo sapiens Q6ZVT0
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种属内
FHL3 Q13643 KLF3 Homo sapiens P57682
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种属内
FHL3 Q13643 KLF3 Homo sapiens P57682
Validated Y2H
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种属内
FHL3 Q13643 KLF3 Homo sapiens P57682
BFG-2H
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种属内
FHL3 Q13643 KLF3 Homo sapiens P57682
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种属内
FHL3 Q13643 IHO1 Homo sapiens Q8IYA8
BFG-2H
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种属内
FHL3 Q13643 IHO1 Homo sapiens Q8IYA8
Validated Y2H
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种属内
FHL3 Q13643 TBC1D22B Homo sapiens Q9NU19
Validated Y2H
32296183
种属内
FHL3 Q13643 MYBPHL Homo sapiens A2RUH7
Y2H Array
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种属内
FHL3 Q13643 GATA1 Homo sapiens P15976-2
BFG-2H
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种属内
FHL3 Q13643 GATA1 Homo sapiens P15976-2
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种属内
FHL3 Q13643 C1orf94 Homo sapiens Q6P1W5
Validated Y2H
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种属内
FHL3 Q13643 DMRT3 Homo sapiens Q9NQL9
Validated Y2H
32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Holoprosencephaly 9

Pituitary Anomalies With Holoprosencephaly-Like Features

HPE9

Holoprosencephaly With Microphthalmia And First Branchial Arch Anomalies

Holoprosencephaly-9

Holoprosencephaly, Type 9

Glycogen Storage Disease Vii

Glycogen Storage Disease Type Vii

Muscle Phosphofructokinase Deficiency

Tarui Disease

GSD7

Pfkm Deficiency

Gsd Vii

Glycogen Storage Disease, Type Vii

Glycogen Storage Disease Type 7

Phosphofructokinase Deficiency

Glycogenosis Type Vii

Phosphofructokinase Myopathy

Glycogenosis 7

Glycogen Storage Disease Due To Muscle Phosphofructokinase Deficiency

Gsd Due To Muscle Phosphofructokinase Deficiency

Gsd Type 7

Gsd Type Vii

Glycogenosis Due To Muscle Phosphofructokinase Deficiency

Glycogenosis Type 7

Glycogen Storage Disease 7

Gsd-Vii

Storage Disease, Glycogen, Type Vii

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Mus musculus FHL3 MGD MGI:1341092
Felis catus FHL3 VGNC VGNC:62266
Macaca mulatta FHL3 VGNC VGNC:72662
Bos taurus FHL3 VGNC VGNC:29001
Canis familiaris FHL3 VGNC VGNC:40873
Rattus norvegicus FHL3 RGD RGD:1307180
Others FHL3 NCBI