1. Gene
  2. LMO1 - LIM domain only 1 Gene

LMO1 - LIM domain only 1 Gene

中文名称:仅 LIM 域 1

种属: Homo sapiens

同用名: TTG1; RBTN1; RHOM1

基因 ID: 4004 | 基因类型: protein coding

关于 LMO1

Cytogenetic location: 11p15.4 Genomic coordinates (GRCh38): 11:8,224,309-8,268,787 (from NCBI)

This gene has 4 transcripts (splice variants), 253 orthologues, 20 paralogues and is associated with 54 phenotypes. Low expression observed in reference dataset.

功能概要

该基因座编码一个转录调节器,该调节器包含两个富含半胱氨酸的 LIM 结构域,但缺少 DNA 结合结构域。 LIM 结构域可能在蛋白质相互作用中发挥作用;因此,编码的蛋白质可以通过竞争性结合特定的 DNA 结合转录因子来调节转录。该基因座的改变与急性淋巴细胞 T 细胞白血病有关。在该基因座和至少两个基因座之间观察到染色体重排,即 T 细胞抗原受体基因的 delta 亚基和 LIM 结构域结合 1 基因。已经描述了选择性剪接的转录物变体。[RefSeq 提供,2012 年 7 月]

This locus encodes a transcriptional regulator that contains two cysteine-rich LIM domains but lacks a DNA-binding domain. LIM domains may play a role in protein interactions; thus the encoded protein may regulate transcription by competitively binding to specific DNA-binding transcription factors. Alterations at this locus have been associated with acute lymphoblastic T-cell leukemia. Chromosomal rearrangements have been observed between this locus and at least two loci, the delta subunit of the T-cell antigen receptor gene and the LIM domain binding 1 gene. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Jul 2012]

LMO1 基因产物(2)

mRNA Protein Name
NM_001270428.2 NP_001257357.1 rhombotin-1 isoform b
NM_002315.3 NP_002306.1 rhombotin-1 isoform a
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
21516116 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in positive regulation of transcription by RNA polymerase II IMP
IMP: 通过突变表型推断
20855495 GOA
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

LMO1 蛋白结构

LIM

LIM: LIM domain (24 - 82)

LIM

LIM: LIM domain (88 - 143)

  • 0
  • 100
  • 156 a.a.
蛋白主名 其他名称

rhombotin-1

LIM domain only 1 (rhombotin 1)

LMO1 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
LMO1 P25800 KRT40 Homo sapiens Q6A162 25416956
种属内
LMO1 P25800 KRT40 Homo sapiens Q6A162 25416956
种属内
LMO1 P25800 KRT40 Homo sapiens Q6A162 25416956
种属内
LMO1 P25800 TASOR2 Homo sapiens Q5VWN6-2 25416956
种属内
LMO1 P25800 TASOR2 Homo sapiens Q5VWN6-2 25416956
种属内
LMO1 P25800 TASOR2 Homo sapiens Q5VWN6-2 25416956
种属内
LMO1 P25800 ADAMTSL4 Homo sapiens Q6UY14-3 25416956
种属内
LMO1 P25800 ADAMTSL4 Homo sapiens Q6UY14-3 25416956
种属内
LMO1 P25800 NUTM1 Homo sapiens Q86Y26 25416956
种属内
LMO1 P25800 NUTM1 Homo sapiens Q86Y26 25416956
种属内
LMO1 P25800 CDX4 Homo sapiens O14627 25416956
种属内
LMO1 P25800 RBBP8 Homo sapiens Q99708-2 25416956
种属内
LMO1 P25800 RBBP8 Homo sapiens Q99708-2 25416956
种属内
LMO1 P25800 RBBP8 Homo sapiens Q99708-2 25416956
种属内
LMO1 P25800 ZNF511 Homo sapiens Q8NB15 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF511 Homo sapiens Q8NB15 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF511 Homo sapiens Q8NB15 32296183
种属内
LMO1 P25800 PTPN3 Homo sapiens P26045 25416956
种属内
LMO1 P25800 PTPN3 Homo sapiens P26045 32296183
种属内
LMO1 P25800 PTPN3 Homo sapiens P26045 32296183
种属内
LMO1 P25800 PTPN3 Homo sapiens P26045 32296183
种属内
LMO1 P25800 GAS8 Homo sapiens O95995 32296183
种属内
LMO1 P25800 GAS8 Homo sapiens O95995 32296183
种属内
LMO1 P25800 HDX Homo sapiens Q7Z353 32296183
种属内
LMO1 P25800 HDX Homo sapiens Q7Z353 32296183
种属内
LMO1 P25800 HDX Homo sapiens Q7Z353 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF526 Homo sapiens Q8TF50 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF526 Homo sapiens Q8TF50 32296183
种属内
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种属内
LMO1 P25800 CEP57L1 Homo sapiens Q8IYX8 32296183
种属内
LMO1 P25800 CEP57L1 Homo sapiens Q8IYX8 32296183
种属内
LMO1 P25800 CEP57L1 Homo sapiens Q8IYX8 32296183
种属内
LMO1 P25800 PPP1R13B Homo sapiens Q96KQ4 32296183
种属内
LMO1 P25800 PPP1R13B Homo sapiens Q96KQ4 32296183
种属内
LMO1 P25800 PPP1R13B Homo sapiens Q96KQ4 32296183
种属内
LMO1 P25800 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9 31515488
种属内
LMO1 P25800 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9 32296183
种属内
LMO1 P25800 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9 32296183
种属内
LMO1 P25800 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9 25416956
种属内
LMO1 P25800 TFIP11 Homo sapiens Q9UBB9 32296183
种属内
LMO1 P25800 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 ABI2 Homo sapiens Q9NYB9-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 UFSP2 Homo sapiens Q9NUQ7 32296183
种属内
LMO1 P25800 PRDM6 Homo sapiens Q9NQX0 32296183
种属内
LMO1 P25800 PRDM6 Homo sapiens Q9NQX0 32296183
种属内
LMO1 P25800 PRDM6 Homo sapiens Q9NQX0 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZFP90 Homo sapiens Q8TF47 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZFP90 Homo sapiens Q8TF47 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZFP90 Homo sapiens Q8TF47 32296183
种属内
LMO1 P25800 GPRASP3 Homo sapiens Q6PI77 32296183
种属内
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种属内
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种属内
LMO1 P25800 IKZF1 Homo sapiens Q13422-7 32296183
种属内
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种属内
LMO1 P25800 IKZF1 Homo sapiens Q13422-7 32296183
种属内
LMO1 P25800 BANP Homo sapiens Q8N9N5-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 BANP Homo sapiens Q8N9N5-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 BANP Homo sapiens Q8N9N5-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 NAGK Homo sapiens Q9UJ70-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 NAGK Homo sapiens Q9UJ70-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 NAGK Homo sapiens Q9UJ70-2 27107012
种属内
LMO1 P25800 NAGK Homo sapiens Q9UJ70-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 NAGK Homo sapiens Q9UJ70-2 27107012
种属内
LMO1 P25800 MSS51 Homo sapiens Q4VC12 32296183
种属内
LMO1 P25800 MSS51 Homo sapiens Q4VC12 32296183
种属内
LMO1 P25800 MSS51 Homo sapiens Q4VC12 32296183
种属内
LMO1 P25800 ABI1 Homo sapiens Q8IZP0-5 32296183
种属内
LMO1 P25800 ABI1 Homo sapiens Q8IZP0-5 32296183
种属内
LMO1 P25800 ABI1 Homo sapiens Q8IZP0-5 32296183
种属内
LMO1 P25800 AKAP9 Homo sapiens Q6PJH3 32296183
种属内
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种属内
LMO1 P25800 AKAP9 Homo sapiens Q6PJH3 32296183
种属内
LMO1 P25800 PXN Homo sapiens P49023-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 PXN Homo sapiens P49023-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 PXN Homo sapiens P49023-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 GPATCH2L Homo sapiens Q9NWQ4-1 32296183
种属内
LMO1 P25800 GPATCH2L Homo sapiens Q9NWQ4-1 32296183
种属内
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种属内
LMO1 P25800 LDB1 Homo sapiens Q86U70-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 LDB1 Homo sapiens Q86U70-2 32296183
种属内
LMO1 P25800 LDB1 Homo sapiens Q86U70-2 32296183
种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
LMO1 P25800 LZTS1 Homo sapiens Q9Y250 32296183
种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
LMO1 P25800 KRBOX4 Homo sapiens Q5JUW0-3 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF641 Homo sapiens Q96N77-2 32296183
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
LMO1 P25800 KANK2 Homo sapiens Q63ZY3 25416956
种属内
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种属内
LMO1 P25800 KANK2 Homo sapiens Q63ZY3 32296183
种属内
LMO1 P25800 KANK2 Homo sapiens Q63ZY3 25416956
种属内
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种属内
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种属内
LMO1 P25800 AKNA Homo sapiens Q7Z591 32296183
种属内
LMO1 P25800 AKNA Homo sapiens Q7Z591 32296183
种属内
LMO1 P25800 AKNA Homo sapiens Q7Z591 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF84 Homo sapiens P51523 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF84 Homo sapiens P51523 32296183
种属内
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种属内
LMO1 P25800 ZNF143 Homo sapiens P52747 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF143 Homo sapiens P52747 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF143 Homo sapiens P52747 32296183
种属内
LMO1 P25800 POLR3GL Homo sapiens Q9BT43 32296183
种属内
LMO1 P25800 POLR3GL Homo sapiens Q9BT43 32296183
种属内
LMO1 P25800 POLR3GL Homo sapiens Q9BT43 32296183
种属内
LMO1 P25800 LDB2 Homo sapiens O43679 32296183
种属内
LMO1 P25800 LDB2 Homo sapiens O43679 32296183
种属内
LMO1 P25800 KRT75 Homo sapiens O95678 32296183
种属内
LMO1 P25800 KRT75 Homo sapiens O95678 32296183
种属内
LMO1 P25800 REL Homo sapiens Q04864 25416956
种属内
LMO1 P25800 REL Homo sapiens Q04864 25416956
种属内
LMO1 P25800 KIAA1328 Homo sapiens Q86T90 32296183
种属内
LMO1 P25800 KIAA1328 Homo sapiens Q86T90 32296183
种属内
LMO1 P25800 KIAA1328 Homo sapiens Q86T90 32296183
种属内
LMO1 P25800 CCDC88B Homo sapiens A6NC98 32296183
种属内
LMO1 P25800 CCDC88B Homo sapiens A6NC98 32296183
种属内
LMO1 P25800 SOX5 Homo sapiens P35711 25416956
种属内
LMO1 P25800 SOX5 Homo sapiens P35711 25416956
种属内
LMO1 P25800 HNRNPH1 Homo sapiens P31943 32296183
种属内
LMO1 P25800 HNRNPH1 Homo sapiens P31943 32296183
种属内
LMO1 P25800 HNRNPH1 Homo sapiens P31943 32296183
种属内
LMO1 P25800 KRT16 Homo sapiens P08779 32296183
种属内
LMO1 P25800 KRT16 Homo sapiens P08779 32296183
种属内
LMO1 P25800 VBP1 Homo sapiens P61758 32296183
种属内
LMO1 P25800 VBP1 Homo sapiens P61758 32296183
种属内
LMO1 P25800 VBP1 Homo sapiens P61758 32296183
种属内
LMO1 P25800 BYSL Homo sapiens Q13895 32296183
种属内
LMO1 P25800 TCP10L Homo sapiens Q8TDR4 32296183
种属内
LMO1 P25800 TCP10L Homo sapiens Q8TDR4 32296183
种属内
LMO1 P25800 TCP10L Homo sapiens Q8TDR4 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF219 Homo sapiens Q9P2Y4 25416956
种属内
LMO1 P25800 ZNF219 Homo sapiens Q9P2Y4 25416956
种属内
LMO1 P25800 SAXO1 Homo sapiens Q8IYX7 25416956
种属内
LMO1 P25800 SAXO1 Homo sapiens Q8IYX7 25416956
种属内
LMO1 P25800 ZNF620 Homo sapiens Q6ZNG0 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF620 Homo sapiens Q6ZNG0 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF620 Homo sapiens Q6ZNG0 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF688 Homo sapiens P0C7X2 32296183
种属内
LMO1 P25800 ZNF688 Homo sapiens P0C7X2 32296183
种属内
LMO1 P25800 UTP14A Homo sapiens Q9BVJ6 32296183
种属内
LMO1 P25800 UTP14A Homo sapiens Q9BVJ6 32296183
种属内
LMO1 P25800 UTP14A Homo sapiens Q9BVJ6 32296183
种属内
LMO1 P25800 HNRNPM Homo sapiens P52272 32296183
种属内
LMO1 P25800 HNRNPM Homo sapiens P52272 32296183
种属内
LMO1 P25800 HNRNPM Homo sapiens P52272 32296183
种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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种属内
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Y2H
21516116
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种属内
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种属内
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LMO1 P25800 SYTL4 Homo sapiens Q96C24 32296183
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种属内
LMO1 P25800 SYTL4 Homo sapiens Q96C24 32296183
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LMO1 P25800 IKZF3 Homo sapiens Q9UKT9 25416956
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LMO1 P25800 ZCCHC12 Homo sapiens Q6PEW1 32296183
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种属内
LMO1 P25800 ZCCHC12 Homo sapiens Q6PEW1 32296183
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LMO1 P25800 CARD9 Homo sapiens Q9H257 25416956
种属内
LMO1 P25800 CARD9 Homo sapiens Q9H257 25416956
种属内
LMO1 P25800 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属内
LMO1 P25800 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属内
LMO1 P25800 PICK1 Homo sapiens Q9NRD5 32296183
种属内
LMO1 P25800 EVI5 Homo sapiens O60447 32296183
种属内
LMO1 P25800 EVI5 Homo sapiens O60447 32296183
种属内
LMO1 P25800 KCTD1 Homo sapiens Q719H9 32296183
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LMO1 P25800 KCTD1 Homo sapiens Q719H9 32296183
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种属内
LMO1 P25800 RCN1 Homo sapiens Q15293 32296183
种属内
LMO1 P25800 RCN1 Homo sapiens Q15293 32296183
种属内
LMO1 P25800 RCN1 Homo sapiens Q15293 32296183
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia

T-Cell Leukemia

Acute T Cell Leukemia

Precursor T Lymphoblastic Leukemia

Precursor T-Lymphoblastic Lymphoma/Leukemia

T Acute Lymphoblastic Leukemia

T-Cell Acute Lymphocytic Leukaemia

T-Cell Lymphoblastic Leukemia/Lymphoma

Leukemia T-Cell

Leukemia, T-Cell

Leukemia, Acute, Lymphoblastic, T-Cell

Leukemia, T-Cell Acute Lymphoblastic

Leukemia, Acute T-Cell

Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma

Precursor T-Cell Lymphoblastic Lymphoma

Precursor T Cell Lymphoblastic Leukemia/Lymphoblastic Lymphoma

Exencephaly
Neuroblastoma

Nb

Neuroblastoma, Susceptibility To

Neuroblastomas

Central Neuroblastoma

Leukemia

Leukemias

Leukaemia, Unspecified, Without Mention Of Remission

Aleukemic Leukaemia

Chronic Leukaemia

Subacute Leukaemia

Leukaemia Disorder

Leukaemia Nos

Precursor T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia

T-All

Precursor T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia/Lymphoma

Precursor T-Cell Acute Lymphocytic Leukemia

Precursor T-Cell Acute Lymphocytic Leukemia/Lymphoma

Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma

Adult T-Cell Lymphoma/Leukemia

Partington Syndrome

X-Linked Reticulate Pigmentary Disorder

PRTS

Partington X-Linked Mental Retardation Syndrome

Mrxs1

Mrx36

Intellectual Developmental Disorder, X-Linked, Syndromic 1

Partington Disease

Pdr

Partington-Mulley Syndrome

Russell-Silver Syndrome, X-Linked

Mental Retardation, X-Linked, Syndromic 1

Mental Retardation, X-Linked, With Dystonic Movements, Ataxia, And Seizures

Mental Retardation, X-Linked 36

X-Linked Reticulate Pigmentary Disorder With Systemic Manifestations

X-Linked Russell-Silver Syndrome

Intelectual Disability-Dystonic Movements-Ataxia-Seizures Syndrome

Intellectual Disability, X-Linked, Syndromic 1

Intellectual Disability, X-Linked, With Dystonic Movements, Ataxia, And Seizures

Partington X-Linked Intellectual Disability Syndrome

X-Linked Intellectual Deficit-Dystonia-Dysarthria

X-Linked Mental Retardation With Dystonic Movements, Ataxia, And Seizures

Familial Cutaneous Amyloidosis

X-Linked Cutaneous Amyloidosis

Xlpdr

X-Linked Intellectual Disability-Dystonia-Dysarthria Syndrome

Pigmentary Disorder, Reticulate, With Systemic Manifestations

Immunodeficiency 18

IMD18

Cd3-Epsilon Deficiency

Immunodeficiency 18, Scid Variant

Cd3epsilon Deficiency

Immunodeficiency 18, Severe Combined Immunodeficiency Variant

Immunodeficiency, Type 18

Autonomic Nervous System Neoplasm

Tumor Of Autonomic Nervous System

Congenital Central Hypoventilation Syndrome

Cchs

Haddad Syndrome

Ondine Curse

Ondine Syndrome

Congenital Central Hypoventilation

Congenital Central Alveolar Hypoventilation Syndrome

Congenital Failure Of Autonomic Control

Ondine'S Curse

Primary Alveolar Hypoventilation

Ondine-Hirschsprung Disease

Central Congenital Hypoventilation Syndrome

Congenital Ondine Curse

Idiopathic Congenital Central Alveolar Hypoventilation

Congenital Central Alveolar Hypoventilation-Hirschsprung Disease Syndrome

Ondine-Hirschsprung Syndrome

Peripheral Nervous System Disease

Peripheral Neuropathy

Peripheral Nerve Disease

Peripheral Nerve Disorders

Neuropathy, Peripheral

Peripheral Neuropathy Due To Vitamin Pyridoxine Hyperalimentation

疾病名称 别名
Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Waldenstroem'S Macroglobulinemia

Macroglobulinemia Of Waldenstrom

Lymphoplasmacytic Lymphoma With Igm Gammopathy

Lymphoplasmacytic Lymphoma

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Rattus norvegicus LMO1 RGD RGD:621166
Bos taurus LMO1 VGNC VGNC:30933
Felis catus LMO1 VGNC VGNC:68070
Macaca mulatta LMO1 VGNC VGNC:74430
Canis familiaris LMO1 VGNC VGNC:42722
Mus musculus LMO1 MGD MGI:102812